این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله دانشگاه علوم پزشکی کردستان، جلد ۲۳، شماره ۶، صفحات ۱-۹
عنوان فارسی بررسی تاثیر هسپرتین بر سه فاکتور پیش آپوپتوزی Bad، Bak، و Bim در محیط شبیه سازی شده
چکیده فارسی مقاله مقدمه: بسیاری از ترکیبات مشتق شده از گیاهان دارویی مانند آنتی‌اکسیدان‌ها و پلی فنل ها نقش بسزایی در پیشگیری و درمان انواع سرطان ها دارند. یکی از فرایندهای مهار سرطان، فعال کردن مسیر آپوپتوز است و ما قصد داریم در این مطالعه، تأثیر دینامیک مولکولی هسپرتین (Hesperetin) را بر روی فاکتورهای پیش آپوپتوزی Bad، Bak و Bim در محیط شبیه‌سازی‌شده بررسی نماییم. روش کار: اطلاعات مربوط به ساختار سه بعدی و فایل های PDB (Protein Data Bank)سه فاکتور آپوپتوزی Bad، Bak و Bim را از پایگاه اطلاعاتی www.rcsb.org دریافت کردیم و با استفاده از نرم افزارهای AutoDock v.4.2, VMD v.1.9.2 و Gromacs v.4.5.4 فرایندهای بهینه‌سازی، شبیه‌سازی، اتصال مولکولی و محاسبات دینامیک مولکولی را انجام دادیم. نتایج: مولکول Bad در اتصال با هسپرتین بیشترین میزان انرژی را آزاد می‌کند در حالی که تغییرات مربوط به شعاع چرخشی (Radius of Gyration) پروتئین  Badبعد از اتصال هسپرتین کاهش ولی برای پروتئین های Bak و Bim افزایش یافت. بیشترین تغییر ساختار دوم پروتئین مربوط به افزایش میزان ساختار Bent و کاهش میزان ساختار β-Sheet در مولکول Bim بود. بحث و نتیجه‌گیری: هسپرتین با تأثیر بر دینامیک مولکولی فاکتور های پیش آپوپتوزی Bad، Bak و Bim می‌تواند فعالیت آن‌ها را تحت تأثیر قرار دهد. هر چند که به نظر می‌رسد بیشترین تأثیر را در فعال کردن مولکول Bad دارد و با ایجاد تغییر در ساختار دوم پروتئین Bim می‌تواند منجر به فعال کردن این پروتئین و القاء آپوپتوز شود.  
کلیدواژه‌های فارسی مقاله دینامیک مولکولی، آپوپتوز، هسپریتین
عنوان انگلیسی Insilco study of the effect of hesperetin on three pre-apoptotic factors Bad, Bak, Bim
چکیده انگلیسی مقاله Background and Aim: Many compounds derived from medicinal plants, such as antioxidants and polyphenols have significant roles in prevention and treatment of various cancers. Activation of apoptosis related pathways is one of the mechanisms for inhibition of cancer progression. In this study, we investigated the effect of molecular dynamics simulation of hesperetin on the pre-apoptotic factors of Bad, Bak, and Bim. Material and Methods: In this study we collected data about 3 dimensional structure and Protein Data Bank (PDB) files of three apoptotic factors of Bad, Bak, and Bim from Protein Data Bank (http://www.rscb.org/pdb). Using VMD v1.9.2, AutoDock v.4.2, and Gromacs v.4.5.4 softwares, we started processes such as optimization, simulation, molecular docking and molecular dynamics calculations. Results: Binding of Bad molecule to hesperetin led to release of the highest amount of energy and reduced changes in the radius of gyration of Bad protein. But after binding of Bim and Bak proteins to hesperetin, changes in the radius of gyration, increased. The most frequent change in the secondary protein structure was related to increased amount of Bent structure and decreased amount of β-sheet structure in Bim molecule. Conclusion: Hesperetin can affect the activities of pre-apoptotic factors of Bad, Bak, and Bim by influencing their molecular dynamics. It seems that hesperetin has the highest effect on the activation of Bad molecule. Also, it can activate Bim protein and induce apoptosis via inducing alternations in the secondary structure of the protein. ts.  
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Molecular dynamic, Apoptosis, Hesperetin
نویسندگان مقاله جواد صفاری چالشتری | Javad Saffari-Chaleshtori


نوید جمالی | Navid Jamali


احسان حیدری سورشجانی | Ehsan Heydari


کیهان قطره سامانی | Keihan Ghatreh Samani


نشانی اینترنتی http://sjku.muk.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3516-1&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/33/article-33-1215093.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده عمومی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات