این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
شنبه 22 آذر 1404
Iranian Journal of Fisheries Sciences
، جلد ۱۵، شماره ۴، صفحات ۱۴۲۵-۱۴۴۰
عنوان فارسی
چکیده فارسی مقاله
کلیدواژههای فارسی مقاله
عنوان انگلیسی
Transcriptome analysis of the freshwater pearl mussel, Hyriopsis cumingii (Lea) using illumina paired-end sequencing to identify genes and markers
چکیده انگلیسی مقاله
The transcriptome of triangle sail mussel Hyriopsis cumingii (Lea) using Illumina paired-end sequencing technology was conducted and analyzed. Equal quantities of total RNA isolated from six tissues, including gonad, hepatopancreas, foot, mantel, gill and adductor muscle, were pooled to construct a cDNA library. A total of 58.09 million clean reads with 98.48 % Q20 bases were generated. Clustering and assembling of these reads produced a non-redundant set of 92,347 unigenes with an average length of 1,150.61 bp. 11,174 unigenes were involved in the molecular function, cellular component and biological process categories by GO Gene Ontology)analysis. Potential genes and their functions were predicted by KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) pathway mapping and COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)analysis. More than 8 putative genes of interest involved in sex determination/differentiation were identified. Furthermore, 8,014 SSRs and 38,288 SNPs were identified in this transcriptome dataset.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله
علی جعفر زانگ | a j zhang
سیده لادن liu | s l liu
j y zhu | j y zhu
زهرا مرضیه gu | z m gu
زهرا مرضیه zhou | z m zhou
گلناز فروغ زانگ | g f zhang
خلیل lu | k h lu
نشانی اینترنتی
http://www.jifro.ir/browse.php?a_code=A-10-653-2&slc_lang=fa&sid=en
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
en
موضوعات مقاله منتشر شده
Genetics
نوع مقاله منتشر شده
کاربردی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات