این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله دانشگاه علوم پزشکی کردستان، جلد ۱۸، شماره ۴، صفحات ۱۱۳-۱۲۶
عنوان فارسی رمزینه‌گذاری داکسی ریبونوکلئیک اسید (Barcoding DNA): افقی جدید در شناسایی مولکولی قارچ‌های پاتوژن (مقاله مروری)
چکیده فارسی مقاله چکیده تعداد گونه‌های قارچی موجود حدود 5/1 میلیون عدد برآورد شده است که تا امروز کمتر از 10 درصد آنها توصیف شده‌اند. با پیشرفت‌های اخیر در زیست‌شناسی مولکولی و توسعه فناوری‌هایی مثل توالی‌یابی ژنی و ژنومی، کشف و شناسایی گونه‌های جدید در گروه‌های مختلف موجودات زنده به‌ویژه قارچ‌ها روند افزایشی به خود گرفته است. با توجه به ناکارآمدی روش‌های مبتنی بر ریخت‌شناسی برای شناسایی گونه‌های قارچی، استفاده از تکنیکهای جدید مبتنی بر داده‌های DNA جایگاه خاصی را در شناسایی سریع و دقیق گونه‌های قارچی پیدا کرده است. رمزینه‌گذاری یا بارکد‌گذاری DNA در مرکز ثقل راهکارهای نوین برای شناسایی قارچ‌ها واقع شده است و از سابقه 10 ساله در شناسایی قارچ‌ها و شبه ‌قارچ‌ها برخوردار می‌باشد. ناحیه فاصله ‌انداز بین ژنی اپرون RNA ریبوزومی (ITS- rDNA) به عنوان یک رمزینه یا بارکد مناسب مورد توجه قرار گرفته است. کارآیی داده‌های توالی ناحیه ITS-rDNA در شناسایی اغلب گروه‌های قارچی باعث شده است که استفاده از این ناحیه به عنوان رمزینه استاندارد در شناسایی قارچ‌ها مورد توافق قارچ‌شناسان قرار گیرد. با وجود این به نظر می‌رسد که ناحیهITS-rDNA به عنوان رمزینه اولیه برای شناسایی قارچ‌ها در حد جنس و یا گروه گونه‌ای مورد استفاده واقع شود و شناسایی دقیق در حد گونه بسته به گروه قارچی مورد مطالعه بر اساس رمزینه‌های ثانویه انجام شود. با عنایت به طبیعت پلئومورفیک قارچ‌ها استفاده از رمزینه‌گذاری D‏NA برای شناسایی قارچ‌ها از درجه اهمیت بالاتری برخوردار می‌باشد و در این راستا تاکنون صدها هزار توالی رمزینه مرجع برای هزاران گونه از موجودات زنده از طریق پروژه‌های رمزینه‌گذاری DNA ایجاد شده است و تلاش‌های بعدی دانشمندان در راستای مدیریت داده‌های رمزینه و اتوماتیزاسیون رمزینه‌گذاری DNA جهت تسریع فرآیند شناسایی توسط کاربران نهایی خواهد بود. واژه های کلیدی: 1 Cytochrome oxidase، ITS- rDNA،tubulin –β، شناسایی گونه، مفهوم گونه مورفولوژیک. وصول مقاله:1/5/91 اصلاحیه نهایی:11/10/91 پذیرش:30/10/91
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی An overview on DNA barcoding: a new horizon in fungal molecular diagnostics
چکیده انگلیسی مقاله ABSTRACT Total number of fungal species has been estimated over 1.5 million, of which less than 10 percent have formally been described. Advances made in molecular biology, development of gene and genome sequence technologies, discovery and description of new species among different clusters of life, especially fungi, has been accelerated. With respect to the failure of morphological-based species recognition methods for fungi identification, use and application of DNA based identification methods have assumed great importance for rapid and accurate identification of fungal species. DNA barcoding is of central importance among the new approaches for the identification of fungi and pseudo fungi and has been used during the last 10 years. For fungi, the internal transcribed spacer region of ribosomal DNA (ITS-rDNA) has become an appropriate barcode. Efficacy of ITS-rDNA sequence data in successful identification of fungal species has resulted in general agreement among mycologists to use ITS-rDNA region as a gold standard barcode for fungi. However, it seems that ITS-rDNA region will be used as the primary barcode for identification of fungal species and accurate identification will further be performed by use of sequence data from the other genomic loci as secondary barcodes. Considering the pleomorphic nature of the fungi, use of DNA barcoding has assumed higher importance. Hundreds of thousands of reference barcodes have been generated for a great number of species by DNA barcoding projects. Scientists now are facing new challenges for barcode data management, facilitation and acceleration in species identification process using DNA barcodes by the end-users through automation of DNA barcoding system. Key words: Cytochrome oxidase1, ITS- rDNA, β– tubulin, Species identification, Morphological species concept. Received: Jul 22, 2012 Accepted: Jan 19, 2013 Conflict of interest: None declared
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله مهدی ارزنلو | mehdi arzanlou
department of phytopathology, tabriz university, tabriz, iran.
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تبریز (Tabriz university)

هاله دخانچی | haleh dokhanchi
master of phytopathology and mycology, tabriz university, tabriz, iran.
کارشناسی ارشد رشته بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تبریز (Tabriz university)

مهدی داوری | mehdi davari
department of phytopathology, university of mohaghegh ardabil, ardabil, iran.
گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه محقق اردبیلی (Mohaghegh ardabili university)

صادق خداویسی | sadegh khodaveisy
medical mycology and parasitology dept., kurdistan university of medical sciences, sanandaj, iran. phd student of mycology, medical parasitology and mycology department, school of public health, tehran university of medical sciences, tehran, iran.
گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشگاه علوم پزشکی کردستان، سنندج، ایران. دانشجوی دکتری تخصصی قارچ شناسی پزشکی، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران.
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی کردستان (Kordestan university of medical sciences)

حمید بدلی | hamid badali
medical mycology and parasitology dept., invasive fungi research center ifrc amp;amp; molecular and cell biology research centre, school of medicine, mazandaran university of medical sciences, sari, iran. corresponding author tel 98-151-3542475
گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات قارچ های مهاجم و مرکز تحقیقات بیولوژی سلولی و مولکولی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری، ایران. مولف مسوول تلفن ثابت 3542475-0151
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی مازندران (Mazandaran university of medical sciences)

نشانی اینترنتی http://sjku.muk.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-424&slc_lang=fa&sid=en
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده عمومی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات