این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
پنجشنبه 20 آذر 1404
طب جنوب
، جلد ۱۸، شماره ۴، صفحات ۷۱۱-۷۱۹
عنوان فارسی
به کارگیری مدل مخاطره جمعی برای پیش بینی زمان بقای بیماران مبتلا به لنفوم منتشر سلولهای بزرگ B و تعیین ژن های مؤثر بر آن با استفاده از داده های ریزآرایه
چکیده فارسی مقاله
زمینه: تحقیقات اخیر نشان داده است که بیان ژنهای مؤثر بر بقای بیماران سرطانی، نقش مهمی را بهعنوان عامل خطر یا عامل پیشگیری کننده بیماری بازی میکنند. مطالعه حاضر برای تعیین ژنهای مؤثر بر بقای بیماران مبتلا به لنفوم منتشر سلول بزرگ B و پیشبینی زمان بقای آنها با استفاده از این ژنها طراحی شده است. مواد و روشها: مطالعه حاضر یک مطالعه مقطعی بوده که بر روی 40 بیمار مبتلا به لنفوم منتشر سلول B انجام شده است. برای این بیماران 2042 بیان ژن اندازهگیری شده است، بهمنظور پیشبینی زمان بقای بیماران، ترکیب مدل بقای نیمهپارامتری جمعی با دو روش انتخاب ژن الستیک نت و لاسو بهکار رفته است. مقایسهی روشهای ذکر شده با رسم سطح زیر منحنی مشخصه عملکرد و محاسبه میانه آن منحنی انجام گرفت. یافتهها: براساس یافتههای این مطالعه ده ژن مؤثر بهوسیله روش الستیک نت- جمعی انتخاب شده است و روش لاسو- جمعی هفت ژن انتخاب کرده است. ژن GENE3325X زمان بقای بیماران را افزایش میدهد (006/0=P) و ژنهای GENE3980X و GENE377X زمان بقای بیماران را کاهش میدهند (004/0=P). این سه ژن بهعنوان مهمترین ژنها در هر دو روش انتخاب شده است. نتیجهگیری: مطالعه حاضر نشان داد که روش الستیک نت کارائی بهتری از روش رایج لاسو در تعیین ژنهای مؤثر بر زمان بقای بیماران دارد. علاوهبر این مشاهده شد که بهکار بردن مدل بقای جمعی به جای مدل رایج کاکس و استفاده از دادههای ریزآرایه راهکاری مفید و قابل استفاده برای پیشبینی زمان بقای بیماران مبتلا به سرطان است.
کلیدواژههای فارسی مقاله
سرطان لنفوم، آنالیز بقا، انتخاب ژن، الستیک نت، لاسو
عنوان انگلیسی
Applied the additive hazard model to predict the survival time of patient with diffuse large B- cell lymphoma and determine the effective genes, using microarray data
چکیده انگلیسی مقاله
Background: Recent studies have shown that effective genes on survival time of cancer patients play an important role as a risk factor or preventive factor. Present study was designed to determine effective genes on survival time for diffuse large B-cell lymphoma patients and predict the survival time using these selected genes. Materials & Methods: Present study is a cohort study was conducted on 40 patients with diffuse large B-cell lymphoma. For these patients, 2042 gene expression was measured. In order to predict the survival time, the composition of the semi-parametric additive survival model with two gene selection methods elastic net and lasso were used. Two methods were evaluated by plotting area under the ROC curve over time and calculating the integral of this curve. Results: Based on our findings, the elastic net method identified 10 genes, and Lasso-Cox method identified 7 genes. GENE3325X increased the survival time (P=0.006), Whereas GENE3980X and GENE377X reduced the survival time (P=0.004). These three genes were selected as important genes in both methods. Conclusion: This study showed that the elastic net method outperformed the common Lasso method in terms of predictive power. Moreover, apply the additive model instead Cox regression and using microarray data is usable way for predict the survival time of patients.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله
عارفه جعفرزاده کهنه لو | arefa jafarzadeh kohneloo
department of biostatistics amp;amp; epidemiology, school of public health, hamadan university of medical sciences, iran
گروه آمار زیستی و اپیدمیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی همدان، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی همدان (Hamadan university of medical sciences)
علیرضا سلطانیان | ali reza soltanian
research center for modeling of non-communicable diseases and department of biostatistics amp;amp; epidemiology, school of public health, hamadan university of medical sciences, iran
مرکز تحقیقات مدلسازی بیماری های غیرواگیر و گروه آمار زیستی و اپیدمیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی همدان، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی همدان (Hamadan university of medical sciences)
جلال پورالعجل | jalal poorolajal
research center for modeling of non-communicable diseases and department of biostatistics amp;amp; epidemiology, school of public health, hamadan university of medical sciences, iran
مرکز تحقیقات مدلسازی بیماری های غیرواگیر و گروه آمار زیستی و اپیدمیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی همدان، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی همدان (Hamadan university of medical sciences)
حسین محجوب | hosean mahjub
research center for health sciences and department of biostatistics amp;amp; epidemiology, school of public health, hamadan university of medical sciences, iran
مرکز تحقیقات علوم بهداشتی و گروه آمار زیستی و اپیدمیولوژی، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی همدان، ایران
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی همدان (Hamadan university of medical sciences)
نشانی اینترنتی
http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3-622&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
آسیبشناسی
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات