این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
چهارشنبه 26 آذر 1404
بوم شناسی آبزیان
، جلد ۲، شماره ۳، صفحات ۱۳-۱
عنوان فارسی
انتخاب مناسبترین ژنهای رفرنس جهت مطالعات Real-time PCR در مراحل ابتدایی زیست تاسماهی ایرانی، Acipenser persicus
چکیده فارسی مقاله
در مطالعاتی که از تکنیک PCR Real-time کمی استفاده می شود، به منظور کمی سازی داده های حاصل از اندازه گیری سطوح mRNA می بایست میزان mRNA ژن هدف را نسبت به میزان mRNA یک ژن رفرنس داخلی نرمال سازی کرد. از آنجا که سطح بیان ژن کنترل داخلی می بایست در بین بافتهای مختلف و نیز تمامی مراحل رشد یک موجود زنده ثابت بوده و نیز تحت تأثیر تیمارهای آزمایش قرار نگیرد، در هر یک از آزمایش های بیان ژن می بایست ثبات و پایداری بیان چندین ژن رفرنس مورد آزمایش و ارزیابی قرار گیرد تا مناسب ترین ژن رفرنس به منظور نرمال سازی داده های حاصل از بیان ژن هدف انتخاب گردد. در مطالعه حاضر ثبات بیان شش ژن رفرنس شامل actin- beta (ACTB)، Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH)، Ribosomal protein L6 (RPL6)، Ubiquitin (UBQ)، Ribosomal protein L13 (RPL13) و Elongation factor 1-alpha (EF1A) در طی مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهی ایرانی با استفاده از تکنیکReal-Time PCR TaqMan مورد ارزیابی قرار گرفت. برآیند کلی نتایج حاصل از نرم افزارهای geNorm، Bestkeeper و NormFinder نشان داد که دو ژن RPL6 و ACTB از بیشترین ثبات بیان ژن برخوردار بودند، در حالیکه ژن RPL13 بیشترین تغییرات بیان ژن را از خود نشان داد. بر این اساس استفاده از ژن های RPL6، ACTB و نیز میانگین هندسی آنها به منظور نرمال سازی داده های بیان ژن هدف در مراحل ابتدایی رشد و تکامل تاسماهی ایرانی و نیز سایر گونه های تاسماهیان توصیه می شود.
کلیدواژههای فارسی مقاله
تاسماهیایرانی، ژن رفرنس، mRNA ، Real-TimePCR
عنوان انگلیسی
Selection of suitable reference genes for real-time PCR studies of early developmental stages of sturgeons
چکیده انگلیسی مقاله
In quantitative real-time PCR, the mRNA level can be quantified in relative terms based on the expression ratio of mRNAs of the target gene and an internal reference gene. Since, an internal standard should be expressed at a constant level among different tissues of an organism at all stages of development, and should be unaffected by the experimental treatment, the stability of different reference genes needs to be tested for every new experiment to select the most suitable reference gene for normalization of target gene. Here in this study, the stability of six candidate reference genes including ribosomal protein L6 (RPL6), ribosomal protein L13 (RPL13), Elongation factor 1-alpha (EF1A), Ubiquitin (UBQ), Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) and beta-actin (ACTB) were studied during early development of Persian sturgeon, Acipenser persicus using Real-Time PCR TaqMan. The general consensus from BestKeeper, NormFinder and geNorm models indicate that RPL6 and ACTB were found to be the most stable reference genes across the different developmental time-points, whereas RPL13 was the most variable gene. Using RPL6, ACTB and a two-gene normalization factor based on the geometric average of RPL6/ACTB could be recommended for standardization of qPCR data in future developmental studies of Persian sturgeon and likely in other Acipenserid species.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله
آرش اکبرزاده | arash akbarzadeh
حمید فرحمند | hamid farahmand
فروزنده محجوبی | frouzandeh mahjoubi
محمد علی نعمت اللهی | mohammad ali nematollahi
کمال الدین حق بین | kamahldin haghbeen
حامد کلنگی میاندره | hamed kolangi miandareh
نشانی اینترنتی
http://jae.hormozgan.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-59&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
تخصصی
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات