این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
چهارشنبه 3 دی 1404
تولید محصولات زراعی و باغی
، جلد ۱۲، شماره ۴۳، صفحات ۵۶۵-۵۷۵
عنوان فارسی
اشباع نقشه پیوستگی ریزماهوارهای گندم نان درجمعیت حاصل از تلاقی Fukuho-Komugi × Oligo-Culm با استفاده از نشانگرهای AFLP
چکیده فارسی مقاله
نقشههای ژنتیکی با پوشش بالای ژنوم نقش بسزایی در تحقیقات پایه و کاربردی ژنتیک ایفا میکنند. در دهههای اخیر با پیدایش نشانگرهای DNA تحول عظیمی در تهیه نقشههای ژنتیکی در گیاهان مختلف به خصوص گندم به وجود آمده است. در این تحقیق، از نشانگر AFLPبرای اشباع نقشه ژنتیکی 107فرد هاپلوئید مضاعف حاصل از تلاقی دو والد به نامهای Fukuho-Komugi × Oligo-Culm دریافت شده از مرکز تحقیقات بین المللی کشاورزی ژاپن استفاده گردید. از چهارچوب نقشه ژنتیکی این جمعیت به عنوان نقشه پایه در تجزیه و تحلیلهای بعدی استفاده شد. تجزیهAFLP با استفاده از آنزیمهای برشی MseI/PstI انجام گرفت. متوسط درصد چند شکلی نشانگر 16/6% AFLP بود. تجزیه دادهها توسط نرم افزار 3/3 Mapmaker/EXP Ver با معیار حداکثر فاصله 50 سانتی مورگان و حداقل LOD برابر 3 و رسم نقشه گروههای پیوستگی توسط نرم افزارDrawmap Ver1.1 انجام گرفت. 115 نشانگر AFLP به 10 گروه منتسب شدند و تعدادی نیز به صورت غیرپیوسته باقی ماندند. تجزیه تکمیلی دادهها به همراه نشانگرهای ریزماهواره، موقعیت کروموزومی نشانگرها را تعیین کرد. در نهایت 1/71% نشانگرها به ژنوم A ، 16/5% به ژنوم B و تنها 3% به ژنوم D تخصیص یافتند. نشانگرهای AFLP مورد استفاده در این تحقیق توانستند در مجموع 11 فاصله خالیرا درهفت کروموزوم (2A،3A،7A،2B،3B،5B،7B) پر نمایند. پوشش کم ژنوم D توسط نشانگرها بهدلیل سطح کم چند شکلی در این ژنوم در جمعیتهای مختلف و حالت حفظ شده آن در جمعیتهای گوناگون میباشد. در بین کروموزومها، بیشترین تعداد نشانگر(60) به کروموزوم 7B تخصیص داده شد. توزیع نشانگرها روی این کروموزوم غیریکنواخت بود. توزیع غیریکنواخت نشانگر روی این کروموزوم به تجمع نشانگرهای AFLP در نواحی هتروکروماتین به خصوص اطراف سانترومر مربوط میشود.
کلیدواژههای فارسی مقاله
گندم، جمعیتهاپلوئید مضاعف، نقشه پیوستگی، AFLP
عنوان انگلیسی
Saturating Microsatellite Linkage Map of Wheat in Fukuho-Komugi × Oligo-Culm Cross Population using AFLP Markers
چکیده انگلیسی مقاله
Genetic maps with high genome coverage are becoming increasingly useful in both basic and applied genetic researches. In the last decades, the advent of DNA markers has brought about a magnificent revolution in the production of genetic map, especially in wheat. In the present study, AFLP markers were used to saturate linkage map of 107 doubled haploid individuals produced through Fukuho _Komugi × Oligo – Culm crosses received from Japan International Research Center of Agricultural Science (JIRCAS). The framework of genetic map was used as base map for next analysis. AFLP analysis was performed with MseI / PstI as digestive enzymes. The average percentage of polymorphism with AFLP markers was around 16.6%. Data analysis was performed by computer program known as Mapmaker / EXP, Ver. 3.3. In this program, the maximum distance criterion was 50 cM and the minimum LOD equated 3. The drawing of chromosome schema for the linkage groups was performed by Draw map, Ver 1.1. In this analysis, 115 AFLP markers were divided into 10 groups in addition, some of the markers remained unlinked. The supplementary data analysis along with specific SSR markers identified the chromosome loci of the markers. Ultimately, 71.1% of the markers were assigned to genome A, 16.5% to genome B and only 3% to genome D. The AFLP markers filled 11 gaps in 7 chromosomes (2A, 3A, 7A, 2B, 3B, 5B and 7B). The low coverage of genome D was due to the limited polymorphism and its conservation in different populations. Among the chromosomes, maximum number of markers (60) was assigned to the chromosome 7A. The distribution of the markers on this chromosome was not uniform. Such a distribution was related to the grouping AFLP markers within heterochromatin region, particularly around the centromere.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
Wheat, Doubled haploid population, Linkage map, AFLP.
نویسندگان مقاله
مهدی رحیم ملک | m. rahimmalek
بدر الدین ابراهیم سید طباطبایی | b e sayed tabatabaei
سید ابوالقاسم محمدی | s a mohammadi
نشانی اینترنتی
http://jcpp.iut.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2-861&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
عمومی
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات