این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری، جلد ۷، شماره ۲، صفحات ۳۰-۴۰
عنوان فارسی اثرات دافعه الکترواستاتیکی بارهای مثبت در انتهای کربوکسیل بر ساختمان و میانکنش پپتید مشتق از اندواستاتین
چکیده فارسی مقاله اندواستاتین رشد و پیشرفت تعداد زیادی از تومورها را از طریق اتصال به پروتئین‌های موجود در سطح سلول‌های اندوتلیال و ماتریکس خارج سلولی مانند اینتگرین، هپارین، ماتریکس متالوپروتئیناز2 و ترانس گلوتامیناز2 سرکوب می‌نماید. در سطح اندواستاتین یک موتیف غنی از آرژنین وجود داشته که جهت اتصال به برخی از پروتئین‌های مذکور ضروری هستند. نشان داده شده است که پپتید 27 آمینواسیدی مشتق از اندواستاتین مسئول اعمال ضد رگزایی و ضد توموری آن است و جهش هیستیدین‌های متصل شونده به Zn فعالیت آن را تا حد زیادی کاهش می‌دهد. در مطالعه حاضر با توجه به اهمیت لوپ متصل شونده به Zn در انتهای آمین و آرژنین 27 در انتهای کربوکسیل، پپتیدهایی مطابق با این ناحیه و یک فرم جهش یافته حاوی جهش ایزولوسین 26 به آرژنین سنتز شدند و ساختار و میانکنش آنها با ماتریکس متالوپروتئیناز2 و ترانس گلوتامیناز2 با استفاده از روش‌های طیف سنجی فلوئورسانس، شبیه سازی دینامیک مولکولی و داکینگ مولکولی بررسی گردید. هدف از این مطالعه بررسی اثر کنار هم قرار گرفتن دو آمینواسید آرژنین با بار مثبت بر ساختار و میانکنش این قطعه از اندواستاتین بود. نتایج نشان دادند که قرار گرفتن دو آرژنین کنار یکدیگر در انتهای کربوکسیل موجب افزایش نوسانات در کل ساختار پپتید، تغییر ناحیه لوپ متصل شونده به یون Zn در انتهای آمین و منفی‌تر شدن انرژی اتصال پپتید به ماتریکس متالوپروتئیناز2 و ترانس گلوتامیناز2 می‌گردد. می‌توان چنین استنتاج نمود که دافعه آرژنین‌های با بار مثبت در انتهای کربوکسیل موجب القای تغییرات کانفورماسیونی در کل ساختار و بخش لوپ انتهای آمین گردیده است.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Effects of electrostatic repulsion of positive charges in carboxyl terminal on the structure and interaction of endostatin-derived peptide
چکیده انگلیسی مقاله Endostatin suppresses growth and progression of many tumors through binding to endothelial cell surface and extracellular matrix proteins like integrin, heparin, matrix metalloproteinase-2 and transglutaminase-2. There is an arginine rich motif on the surface of endostatin that is essential for binding to some of aforementioned proteins. It has been shown that a 27 amino acid peptide derived from amino terminal of endostatin responsible for its anti-angiogenic and anti-tumor activities and mutation of histidines bound to Zn significantly reduce its activity. In the present study, as regards the importance of Zn-binding loop in amino terminal and arginine 27 in carboxyl terminal, peptides corresponding to this region and a mutated variant including isoleusin 26 to arginine mutation synthesized and their structure and interaction with matrix metalloproteinase-2 and transglutaminase-2 analyzed using fluorescence spectroscopy, molecular dynamic and docking simulation techniques. This study aimed to analyze effect of placing two positively charged arginines on the structure and interaction of this fragment of endostatin. Results showed that placing two arginines close together in the carboxyl terminal of peptide increases fluctuations in total structure of peptide, alters Zn-binding loop in the amino terminal and makes binding energy of peptide to matrix metalloproteinase-2 and transglutaminase-2 more negative. It can be inferred that repulsion of two positively charged arginines in carboxyl terminal induces conformational changes in the whole structure and in the amino terminal loop region.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله ریحانه چمنی |
دانشگاه گیلان، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه گیلان (Guilan university)

سید محسن اصغری | seyed mohsen
دانشگاه گیلان، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه گیلان (Guilan university)

نشانی اینترنتی
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات