این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری، جلد ۵، شماره ۲، صفحات ۷-۱۹
عنوان فارسی شناسایی ، بررسی و مقایسه ی پروتئین های آرگونات موجود در ژنوم شش گیاه دارویی
چکیده فارسی مقاله پروتئین های آرگونات از جمله پروتئین های دخیل در بحث خاموشی ژن می باشند که فعالیت اندونکلئولیتیکی برای بسیاری از آنها به اثبات رسیده است. هدف از این تحقیق شناسایی و بررسی پروتئین های آرگونات موجود در ژنوم 6 گیاه دارویی با استفاده از ابزارها و روش های بیوانفورماتیکی می باشد. توالی های اسید آمینه ی پروتئین های آرگونات گیاهان مورد بررسی با استفاده از توالی های پروتئین های آرگونات آرابیدوپسیس، از پایگاه اطلاعاتی فیتوزوم شد، سپس همردیفی توالی ها،‏‏ ساختار سه بعدی، دامنه ها و درخت فیلوژنی این پروتئین ها مشخص شد. این تحقیق نشان داد که گیاهان دارویی مورد بررسی دارای 6 الی 18 پروتئین آرگونات در ژنوم خود می باشند. پروتئین های آرگونات موجود در این گیاهان به طور کلی دارای سه دامنه اصلی به نام های PAZ، MIDو PIWI می باشند، این پروتئین ها هنگام رسم درخت فیلوژنی در سه دسته مجزا قرار می گیرند که نشان از حفظ شدگی بالای آنها می-باشد. طول این پروتئین ها در گیاهان مورد بررسی بین 846 اسید امینه تا 1187 اسیدامینه می باشد که میانگین طول و وزن این پروتئین ها در این گیاهان به ترتیب 970 اسیدامینه و 108 کیلو داالتون است. به طور کلی نتایج این تحقیق نشان داد که پروتئین های آرگونات گیاهان دارویی مورد بررسی ویژگی‌های کلی پروتئین های آرگونات را دارا می باشند و تفاوت بین این پروتئین‌ها بیشتر در تعداد و خصوصیات فیزیکی آنها می‌باشد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله بیوانفورماتیک، پروتئین های آرگونات، 6 گیاه دارویی،
عنوان انگلیسی Identify, evaluate and compare of argonaute proteins in the genome of six medicinal plants
چکیده انگلیسی مقاله One of the most important proteins in gene silencing and creation of small RNA, are argonaute proteins. Most of these proteins have an endonucleolytic activity so argonaute proteins play a key role in creation of defense mechanism against certain pathogenic viruses. In current study we studied the putative argonaute genes in six medicinal plants using bioinformatic tools. Sequences of argonaute genes of six medicinal plants were retrieved from target database using Arabidopsis Argonaut blast. Sequence alignment, 3D structure, phylogenetic tree and conserved domain were generated for six medicinal plants argonautes. Results showed that studied medicinal plants have 6 to 18 argonaute proteins in the genome. There were three classes of Argonaute proteins similar to that of Arabidopsis, and each varies in length from 846 to 1187 AA, with a average of 970 AA and 108 kDa. six medicinal plants argonaute proteins had PAZ, PIWI and MID conserved domains.Our results showed that six medicinal plants have three classes of argonautes, This indicates is that the conservation of argonaute proteins in different plants.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Argonaute proteins, bioinformatic, six medicinal plants
نویسندگان مقاله محمد حسن شمسی فرد | mohammad hassan shamsi fard
دانشجو

خالد میرزایی |
دانشجو

بهمن بهرام نژاد |
استادیار بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه کردستان
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه کردستان (Kordestan university)

نشانی اینترنتی http://biot.modares.ac.ir/article_12823_449a8c2e9738c5be86211f0d7e62a79a.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/899/article-899-187073.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات