این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری، جلد ۵، شماره ۲، صفحات ۵۵-۶۷
عنوان فارسی تحلیل شبکه های زیستی علامت‏ دار از دیدگاه نظریه تعادل ساختاری
چکیده فارسی مقاله تحلیل شبکه ‏های زیستی علامت‏دار از زمینه ‏های پژوهشی جدید در سال‏های اخیر به شمار می رود. این مقاله به بررسی و مقایسه خوشه‏ های متعادل و انجمن‏های چگال به عنوان دو الگوی ساختاری متفاوت در تحلیل و کشف واحدهای ساختاری موثر در شبکه ‏ها می پردازد. اگرچه بنابر مطالعات موجود شبکه‏ های زیستی به سمت ساختار متعادل گرایش دارند، اما این پژوهش نشان می‏دهد که الگوی انجمن‏های چگال در شبکه های بازنویسی سلول‏های e‏coli و yeast از طرح خوشه‏ های متعادل فاصله داشته و تعداد پیوند‏های منفی در آنها به طور معناداری بالا است. این فاصله به عنوان معیاری در ارزیابی و تحلیل ساختار و عملکرد سیستم پیشنهاد می‏شود. همچنین با وجود آنکه اکثریت پیوند‏های بین خوشه ‏های متعادل از نوع منفی می باشد، اما این تحقیق بر نقش پیوند‏های مثبت واسطه بین خوشه ‏های متعادل در پاسخ سیستم تاکید دارد. تحلیل داده ‏های تعدادی شبکه تنظیم ژنی نشان می‏دهد که اغتشاش در وضعیت ژن‏های این پیوندهای واسطه تاثیر مهمی در پاسخ کلی سیستم داشته و سبب ایجاد فاصله بیشتر تعادل جدید از وضعیت اولیه می گردد. به این ترتیب شناسایی خوشه‏ های متعادل و ارتباطات آنها، رویکرد موثری در تعیین واحدهای موثر عملکردی و ارتباطات کلیدی شبکه ‏ها فراهم می کند. این رویکرد در کاربردهایی نظیر هدفگیری ژنی و قطع ارتباطات موثر بین زیرواحدهای اصلی سلولی می تواند مفید واقع شود.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Analysis of signed biological networks in the perspective of structural balance theory
چکیده انگلیسی مقاله Analysis of signed biological networks has been an interest of some researchers in recent years. We consider communities and balanced clusters as two structural patterns that may reveal different structures in the networks. Although biological networks tend to structural balance, this study clarifies adhesive communities in some transcriptional networks of ecoli and yeast differ from the balanced clusters and have significantly more negative links in their structure. This difference may be used as an index in categorizing various systems' structure and function. Also we study the important role of the positive links between balanced clusters, even though the links between these clusters are mostly negative. Analyzing data of some Gene Regulatory Networks, shows that perturbing the genes located at these links, has a larger effect on the system and causes more distance from the initial equilibrium state. So, signed clustering and detecting the links between these clusters can be considered as an effective approach in detecting the functional units and the key components in the system. This can be useful in applications like gene targeting in drug synthesis.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله مریم احسانی |
دانشجوی دکتری،دانشکده مهندسی صنایع و سیستم ها ،دانشگاه تربیت مدرس
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)

محمد مهدی سپهری | mohammad mehdi
دانشیار،دانشکده ی مهندسی صنایع و سیستم ها،دانشگاه تربیت مدرس
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)

سید شهریار عرب | seyed shahriar
استادیار، گروه بیوفیزیک دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)

نشانی اینترنتی http://biot.modares.ac.ir/article_12826_1585a55ef8c7aa484c62c245bc45589f.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/899/article-899-187077.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات