این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
شیمی و مهندسی شیمی ایران، جلد ۳۱، شماره ۲، صفحات ۹۷-۱۱۰
عنوان فارسی مدل سازی شبکه ی متابولیکی میکروارگانیسم سودوموناس ائروجینوزا
چکیده فارسی مقاله در این مقاله یک شبکه‌ی متابولیکی، در بردارنده ‌ی مسیرهای متابولیکی مرکزی سودوموناس ائروجینوزا در شرایط بی ‌هوازی ارایه شده است. به منظور تأیید دقت مدل، پیش بینی ‌های مدل با نتیجه ‌های تجربی به دست آمده از کار دیگر پژوهشگران مقایسه شده است. برای دست یابی به این مهم، از برنامه ریزی خطی برای بهینه سازی معادله ‌های حاکم بر سامانه استفاده شد. تابع هدف برای بررسی درستی مدل، نرخ ویژه رشد این میکروارگانیسم بوده است. طبق پیش بینی های مدل با این تابع هدف، مسیرهای انتنردودورف و پنتوز فسفات برای فروساخت گلوکز فعال بودند. هم چنین چرخه ی تری کربوکسیلیک اسید به طورکامل انجام نمی‌ شد. در صورتی که مقدارهای بهینه تولیدی کوفاکتورهای ATPو NADPH به عنوان تابع هدف در نظر گرفته شوند مسیر پنتوز فسفات و در صورتی که تولید بیشینه ‌ی NADH مورد نظر باشد مسیر انتنردودورف مسیرفعال می ‌باشد. پیش بینی‌ های مدل در مقایسه با اندازه ‌گیری ‌های آزمایشی دارای خطای نسبی کمتر از 10 درصد بوده است. این میزان خطای کم، نشان دهنده ی قابل اعتماد بودن مدل بوده و امکان کاربرد آن را در پژوهش‌های آتی فراهم می‌ کند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Metabolic Network Modeling of Pseudomonas aeruginosa
چکیده انگلیسی مقاله A metabolic network comprising central metabolic pathway of Pseudomonas aeruginosa under anaerobic condition was developed. To confirm the model accuracy, a comparison between the model prediction and the corresponding experimental results from other works in the literature have been performed. Linear programming was used for this purpose. Objective function was specific growth rate of the microorganism. Base on the model predictions with this objective function, Entenr-Doudoroff and pentose phosphate pathway were both active for the catabolism of glucose. Moreover, the entire reactions of the tricarboxylic acid cycle were not active. Glucose was oxidized via the pentose phosphate pathway when maximization of cofactors ATP and NADPH were the objective of optimization, whereas Entner-Doudoroff was active for maximizing NADH. The model predictions showed a relative error less than 10 percent compare with the experimental results. The small error makes the model reliable for further researches.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله رضا قشلاقی |
مشهد، دانشگاه فردوسی مشهد، دانشکده مهندسی، گروه مهندسی شیمی، صندوق پستی 9177948974
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه فردوسی (Ferdowsi university)

زهرا حیدری |
مشهد، دانشگاه فردوسی مشهد، دانشکده مهندسی، گروه مهندسی شیمی، صندوق پستی 9177948974
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه فردوسی (Ferdowsi university)

محمود اخوان مهدوی | akhavan mahdavi
مشهد، دانشگاه فردوسی مشهد، دانشکده مهندسی، گروه مهندسی شیمی، صندوق پستی 9177948974
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه فردوسی (Ferdowsi university)

نشانی اینترنتی http://www.nsmsi.ir/article_7122_31fb8ffc753b42811c65f0d7b21f76c1.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/931/article-931-190385.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات