این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
علوم دامی، جلد ۲۹، شماره ۱۱۰، صفحات ۱۶۷-۱۸۰
عنوان فارسی بازسازی و آنالیز توپولوژی شبکه متابولیکی دخیل در تولید شیرگاو
چکیده فارسی مقاله مدل‌سازی متابولیسم تولید شیر مبتنی بر بازسازی شبکه متابولیکی دخیل در تولید شیر، احتمالا می تواند منجر به دیدگاهی سیستمی به این فرآیند پیچیده و درک بهتر آن گردد. این بازسازی با استفاده از اطلاعات ژنومی قابل دسترس گاو امکان‌پذیر است. در این پژوهش، شبکه متابولیتی درگیر در تولید شیر در گاو، بازسازی و آنالیز شده است. بدین منظور، ابتدا اطلاعات موجود در پایگاه داده­های NCBI ، Uniprot ، KEGG و Brenda مورد استفاده قرار گرفته­اند. شبکه حاصل، شامل 3605 واکنش بوده که توسط 646 آنزیم کاتالیز شده و از پایگاه داده KEGG تهیه گردیده­اند. براساس تئوری گراف، تمامی ویژگی­های ساختاری شبکه متابولیتی جهت دار و بدون جهت مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. میانگین طول مشخصه مسیر برابر با مقادیر 51/5 و53/5 به ترتیب برای شبکه متابولیتی جهت دار و بدون جهت به­دست آمد. 23 متابولیت هاب تعیین گردید. زیرا هرگونه تغییر در این متابولیت­ها ممکن است موجب کاهش تولید شیر بوده و یا برای سلامتی دام مضر باشد. بنابراین هدف از ساخت شبکه متابولیت محور، مقایسه تطابق ویژگی­های این شبکه با سایر شبکه‌های بیولوژیکی و تعیین متابولیتهای کلیدی در تولید شیر می باشد. تحقیق حاضر، می تواند اطلاعات مفیدی برای بهبود و درک بهتر فرآیند تولید شیر در گاو از دیدگاه متابولیکی ارائه دهد و منجر به ارائه پیشنهاداتی در جهت ایجاد ویا بهبود استراتژی­های اصلاح نژادی گردد
کلیدواژه‌های فارسی مقاله گاو، تولید شیر، شبکه متابولیکی، تئوری گراف، متابولیسم،
عنوان انگلیسی Reconstruction and topology analysis of metabolic network involved in Bos Taurus milk production
چکیده انگلیسی مقاله The modeling of metabolism of milk production through the reconstruction of metabolic networks involved in the milk production in cow (bos taurus) from the available genomics information is possible now and may be uncover a comprehensive view on this complex process. Computation of topological indices and quantitative characterizations, are some of the principle computations based on graph theory applied in biological data. In the present study, the metabolic network involved in milk production in cow was reconstructed and analyzed based on the available bovine genome information using several public datasbaces (NCBI, Uniprot, KEGG, and Brenda). The reconstructed network was consisted of 3605 reactions named by KEGG compound numbers and 646 enzymes that catalyzed the corresponding reactions. The characteristics of the directed and undirected network have been analyzed using Graph Theory. The mean path length was identified equal to 5.51 and 5.53 for directed and undirected networks, respectively. The top 23 hub metabolites have been determined, that the abnormality among these metabolites may have some dangers for bovine health and reduce milk production. Therefore, the aim of constructing the metabolites centric network is to see if the network follows the same network properties of the biological networks. Key metabolites have been determined. The results include information that might improve the better understanding and more knowledge about milk production in cow and could be beneficial to cow breeding.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله شعله قربانی |
دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد ژنتیک مولکولی ، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه فردوسی (Ferdowsi university)

مجتبی طهمورث پور |
استاد دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه فردوسی (Ferdowsi university)

علی مسعودی نژاد |
دانشیار موسسه تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک ، دانشگاه تهران
سازمان اصلی تایید شده: مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک (Institute of biochemistry and biophysics)

محمد رضا نصیری | mohammad reza
استاد دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه فردوسی (Ferdowsi university)

یزدان عسگری |
استادیاربخش بیولوژی، پژوهشگاه دانش های بنیادی، تهران
سازمان اصلی تایید شده: پژوهشگاه دانش های بنیادی

احسان معتمدیان |
استادیار دانشکده مهندسی شیمی، دانشگاه تربیت مدرس
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تربیت مدرس (Tarbiat modares university)

نشانی اینترنتی http://asj.areo.ir/article_106530_7adef9f1990235eee3c38d57771b401d.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/953/article-953-194450.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات