این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ژنتیک نوین، جلد ۱۳، شماره ۳، صفحات ۳۶۳-۳۷۹
عنوان فارسی شناسایی miRNAها و ژن‌های هدف بالقوه آن‌ها در گلرنگ زراعی (Carthamus tinctorius L)
چکیده فارسی مقاله microRNAها (miRNA) گروهی از RNAهای غیر کدکننده و کوتاه (~21 نوکلئوتید) هستند که از طریق تنظیم بیان ژن‌ها در سطح پس از رونویسی نقش‌ کلیدی را در توسعه و فیزیولوژی گیاه ایفا می‌کنند. ازآنجایی‌که تاکنون مطالعه جامعی در رابطه با شناسایی miRNAهای گلرنگ به روش in silico انجام نشده است، در این پژوهش با آنالیز توالی‌های ژنومی، 124 miRNA بالقوه متعلق به 26 خانواده حفاظت‌شده، شناسایی و حضور 2 مورد از آن‌ها در ژنوم گلرنگ با استفاده از RT-qPCR تأیید شد. این 29 خانواده miRNA به‌طور چشم‌گیری در اندازه متفاوت هستند. آنالیز توالی‌های pre- miRNA نشان داد که طول این پیش­سازها در گلرنگ از 57 تا 317 با میانگین 1/40 ± 88/95 نوکلئوتید متغیر است. دیگر نتیجه مهم به‌دست‌آمده در این مطالعه، موفقیت در تعیین کلاسترهای miR169، miR395 و miR397 در ژنوم گلرنگ بود. در مطالعه پیش رو برای نخستین ­بار اعضای خانواده‌های miR393، miR477، miR530، miR6111، miR6113 و miR6114 در ژنوم گلرنگ شناسایی شد. با استفاده از پروتکل‌های ارائه‌شده در مطالعات پیشین، درمجموع 84 ژن هدف بالقوه برای miRNAهای گلرنگ شناسایی شد. ژن­های هدف این قبیل از ژن‌ها، فاکتورهای رونویسی، پروتئین‌های دخیل در همانندسازی DNA و آنزیم‌های متابولیکی را شامل می‌شوند. نتایج این مطالعه نشان داد که miRNAهای حفاظت شده در گلرنگ وجود دارند و می‌توانند عملکرد مؤثری در پاسخ به تنش‌های محیطی نیز داشته باشند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله کلاستر Carthamus tinctorius in silico miRNA RT-qPCR
عنوان انگلیسی Identification of conserved miRNAs and their putative target genes in safflower (Carthamus tinctorius L)
چکیده انگلیسی مقاله miRNAs are a class of non-coding and small RNAs (~ 21 nucleotides) performs a key function in plant growth and physiology by regulating gene expression in post-transcriptional level. Since there has not been a comprehensive study on identification of the miRNAs of safflower (Carthamus tinctorius L) using in silico method, in current study, 124 potential miRNAs belonging to 26 conserved families were identified and two miRNAs were validated using qRT-PCR technique. The 29 miRNA families were significantly different in size. Safflower pre- miRNAs greatly varied from 57 to 317 nt in length with an average of 94.56 ± 38.1 nt. Another result of this study was the success in determining miR169, miR395 and miR397 clusters in the safflower genome. In the present study, the family members of miRNAs including miR393, miR477, miR530, miR6111, miR6113, and miR6114were recognized which have not previously been reported. A total of 84 potential target genes were predicted for the identified safflower miRNAs including transcription factors, proteins involved in DNA replication, and metabolic enzymes. The results of this study showed the existence of conserved miRNAs in safflower and may be important role in response to environmental stress.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Carthamus tinctorius, in silico, miRNA, qRT-PCR, cluster
نویسندگان مقاله فرشید کوهی | F Kouhi
گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز

کریم سرخه | K Sorkheh
دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران اهواز

سزای ایرسیزلی | S Ercisli
دانشکده کشاورزی دانشگاه آتاتورک ترکیه

نشانی اینترنتی http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-1-47&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1516/article-1516-1958844.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده ژنتیک گیاهی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی کامل
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات