این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ژنتیک نوین، جلد ۱۱، شماره ۳، صفحات ۳۹۱-۳۹۸
عنوان فارسی حساسیت صحت پیش‌بینی‌های ژنومی تک‌صفتی و چندصفتی به معماری ژنتیکی صفات
چکیده فارسی مقاله در تحقیق حاضر صحت پیش‌بینی‌های ژنومی تک‌صفتی و چندصفتی در حالت وجود 10، 50، 150 و 500 جایگاه کنترل‌کننده صفات کمی (QTL) مؤثر بر دو صفت با توارث پذیری 1/0 و 6/0 و در حالت وجود پنج توزیع آماری نرمال، یکنواخت،t ، گاما و لاپلاس برای آثار QTLها با استفاده از شبیه‌سازی تصادفی مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور ژنومی به‌طول 10 مورگان شبیه‌سازی شد و 10000 نشانگر با فواصل یکسان بر روی آن قرار گرفت. در هر سناریو QTL‌ها به‌صورت تصادفی بر روی ژنوم پخش شدند و اثر جایگزینی آن‌ها از یکی از پنج توزیع مذکور گرفته شد. برای ایجاد عدم تعادل پیوستگی بین نشانگرها و QTL‌ها به‌مدت 50 نسل از رانش ژنتیکی استفاده شد. سپس در نسل 51 که جمعیت مرجع نام دارد تعداد حیوانات به 1000 حیوان افزایش یافت و برای این حیوانات یک ارزش فنوتیپی شبیه‌سازی شد. اثر نشانگرها در این جمعیت با استفاده از روش بهترین پیش‌بینی نااریب خطی (BLUP) و تجزیه‌های تک‌صفتی و چندصفتی برآورد شد. با استفاده از این اثرات برآوردی و ژنوتیپ نشانگرها برای افراد جوان نسل 52 که جمعیت تایید نام دارد و فاقد فنوتیپ بود، ارزش‌های اصلاحی ژنومی حیوانات محاسبه شده و صحت این ارزش‌های اصلاحی مبنای مقایسه سناریوهای مختلف این تحقیق بود. نتایج این تحقیق نشان داد که در همه سناریوهای مورد بررسی صحت ارزش‌های اصلاحی صفت با توارث پذیری بالا بیش‌تر از صفت با توارث‌پذیری پایین بود. همچنین ارزیابی‌های چندصفتی وقتی که همبستگی ژنتیکی بین صفات 6/0 بود، باعث افزایش ده درصدی صحت ارزش‌های اصلاحی صفت با توارث‌پذیری پایین شد، ولی تأثیری بر صحت ارزش‌های اصلاحی صفت با توارث پذیری بالا نداشت. در همه سناریوهای مورد بررسی تغییر در تعداد QTL‌های کنترل‌کننده صفات و هم‌چنین تفاوت توزیع آثار QTL‌ها تاثیری بر صحت ارزش‌های اصلاحی ژنومی توسط روش BLUP نداشت. در نتیجه تجزیه‌های چندصفتی روش BLUP بدون هیچ‌گونه حساسیتی به معماری صفت می‌توانند در ارزیابی ژنتیکی صفات با توارث‌پذیری پایین مورد استفاده قرار گیرند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله تجزیه تک‌صفتی،تجزیه چندصفتی،تعداد QTL،توزیع آثار QTL،شبیه سازی
عنوان انگلیسی Sensitivity of genomic single and multi-trait prediction accuracy to genetic architecture of the traits
چکیده انگلیسی مقاله Current research was carried out to study accuracy of single and multi-trait genomic prediction for two traits with 0.1 and 0.6 heritability; four 10, 50, 150 and 500 underlying QTL numbers for each trait and five normal, uniform, t, gamma and Laplace distributions for QTL effects using stochastic simulation. A genome with 10 Morgan lengths was simulated and 10000 markers were evenly spaced within it. In each scenario QTLs was randomly distributed on genome and their substitution effects was drawn from one of mentioned distributions. In order to create linkage disequilibrium between markers and QTLs genetic drift was used for 50 generations. In generation 51, called reference population, number of individuals increased to 1000 animals and phenotype of each of these animals was simulated. Marker effects were estimated in reference population using single and multi-trait best linear unbiased prediction (BLUP) methods. By using these estimated markers effects and genotype of markers for juvenile animals in generation 52, called validation population, genomic breeding values were predicted and different scenarios of this study were compared using accuracy of the predictions. Results of this study showed that in all scenarios high heritable trait had higher accuracy than low heritable trait. As well as, multi-trait BLUP increased nearly 10 percent accuracy of breeding values for low heritable trait, when genetic correlation between traits was 0.6. In all studied scenarios accuracies of genomic breeding values not affected by changes in number of QTLs and different distribution for QTLs effects. Therefore, multi-trait BLUP method without sensitivity to genetic architecture of traits can be used for genetic evaluation of low heritable traits.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله صاحب فروتنی‌فر | صاحب فروتنی‌فر


نشانی اینترنتی http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-437&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1516/article-1516-1988740.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات