این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ژنتیک نوین، جلد ۱۱، شماره ۲، صفحات ۱۷۳-۱۸۳
عنوان فارسی مدل سازی نرم افزاری پروتئین تنش گرمایی۷۰ (HSP۷۰) طیور
چکیده فارسی مقاله پروتئین‌های تنش گرمایی (HSP) فراوان‌ترین پروتئین‌های داخل سلولی هستند. سنتز آن‌ها به سرعت توسط عوامل تنش‌زای مختلف از جمله درجه حرارت، محرومیت از گلوکز و عفونت‌ها افزایش می‌یابد. این پروتئین‌ها نقش مهمی در زنده مانی سلول‌ها تحت شرایط تنش و پایداری شرایط داخلی سلول (هوموستازی) بازی می‌کنند. از آن‌جا که ساختار کریستالوگرافی این پروتئین در طیورکه خسارات زیادی از تنش گرمایی می‌بینند، گزارش نشده است، مدل‌سازی ساختار HSP70 در طیور می‌تواند زمینه تشخیص مکانیسم عمل این پروتئین در مقابل تنش‌های محیطی را فراهم نموده و هزینه‌های مربوط به تنش‌های محیطی را کاهش دهد. به همین منظور در تحقیق حاضر مدل‌سازی ساختار سه بعدی پروتئین HSP70 در طیور گونه Gallus gallus برای شناسایی دمین‌های ساختاری و جایگاه‌های ویژه آن انجام گرفته است. مدل‌سازی سه بعدی به روش همولوژی مدلینگ و با استفاده از الگوی مناسب با میزان شباهت بالا که از پایگاه داده PBD تهیه شده بود (HSP70Homo sapiens و Bovine HSC70) و به کمک پایگاه‌های اطلاعاتی I-TASSER و Swiss Model انجام شد. به‌منظور ارزیابی و مطالعه ساختاری مدل ساخته شده از نرم‌افزارSPDBV استفاده شد. همچنین نمودارهای راماچاندران نیز مورد مطالعه و بررسی قرار گرفتند. ارزیابی کیفیت ساختاری این مدل‌ها براساس پارامترهای C-score، TM-score و RMSD انجام شد که نشان داد مدل پیشنهادی برای HSP70 طیور دارای کیفیت و پایداری مناسبی می‌باشد. در مجموع مدل‌سازی HSP70 طیور اولین مرحله در شناسایی ساختار پروتئینی این چاپرون می‌باشد که با توجه به شباهت بالای توالی اسید آمینه‌ای این چاپرون با چاپرون‌های تعیین ساختار شده می‌توان در آنالیزها و طراحی‌های بعدی از این مدل‌ها با ضریب اطمینان بالا استفاده نمود.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله پروتئین تنش گرمایی70،تنش گرمایی،چاپرون،طیور،مدل‌سازی
عنوان انگلیسی Software modeling of heat-shock protein 70 (HSP70) of poultry
چکیده انگلیسی مقاله Heat shock proteins (HSPs) are the most of intracellular proteins. Their synthesis is rapidly up-regulated because of various ‘stressors’ including temperature, glucose deprivation, and infection. These proteins play an important role in survival cell and intracellular homeostasis under stress conditions. Since the crystallographic structure of the protein extensively damaged from heat stress it is not reported in poultry, modeling the structure of HSP70 of poultry can identify the mechanism of action of this protein against environmental stresses and help to reduce costs related to environmental stresses. In this study three-dimensional structure of protein HSP70 in poultry, species Gallus gallus was modeling to identify structural domains and specific position in this structure. The three-dimensional model was prepared by homology modeling using I-TASSER and Swiss Model with similar and suitable pattern from database PBD (Homo sapiens HSP70, Bovine HSC70). In order to evaluate and analysis of structure model SPDBV software was used. Quality evaluation of the model was done based on the structural parameters of C-score, TM-score and RMSD that Showed the quality of the proposed model is suitable and stable for HSP70 of poultry. Modeling HSP70 in poultry is the first stage in identifying of protein's structure of this chaperon. Due to the high similarity of the amino acid sequence of this Chaperon with determined structural Chaperons, this model can high reliability be used in later analysis and design.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Chaperon, , Heat stress, , HSP70, ,Modeling, Poultry
نویسندگان مقاله الهام رضوان نژاد | الهام رضوان نژاد


مجتبی مرتضوی | مجتبی مرتضوی


علی ریاحی مدواری | علی ریاحی مدواری


نشانی اینترنتی http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-416&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1516/article-1516-1988751.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات