این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
دوشنبه 1 دی 1404
ژنتیک نوین
، جلد ۱۱، شماره ۱، صفحات ۵۷-۶۳
عنوان فارسی
شناسایی چند شکلی ژن پرایون در گوسفندان نژاد نائینی با استفاده از روش PCR-SSCP، تعیین توالی مستقیم و تجزیه منحنی ذوب
چکیده فارسی مقاله
تعیین ژنوتیپ با استفاده از تجزیه و تحلیل مستقیم DNA اهمیت بهسزایی در به نژادی گیاهان و جانوران و نیز برای تشخیص و بررسی بینظمیهای ژنتیکی در موجودات مختلف اعم از گیاه، حیوان و همچنین در علم پزشکی قانونی دارد. در حال حاضر روش تجزیه منحنی ذوب یکی از کم هزینهترین روشهای تعیین ژنوتیپ به حساب میآید که میتواند در مطالعات ژنتیکی مورد استفاده قرار گیرد. پژوهش حاضر بهمنظور شناسایی چندشکلیهای تک نوکلئوتیدی در جایگاه ژن پرایون گوسفندی انجام گرفت. پس از استخراج DNA از نمونه خون 145 رأس گوسفند نژاد نائینی و تکثیر قطعه مورد نظر توسط واکنش زنجیرهای پلیمراز، ژنوتیپها تعیین و برای تایید نتایج بهدست آمده از دو روش PCR-SSCP و روش تعیین توالی مستقیم استفاده شد. نتایج نشان داد که در جایگاه ژنی پروتئین پرایون، در مجموع نه ژنوتیپ مشاهده شد. اما به دلیل وجود چندین SNP در قطعه تکثیری، تفکیک هر یک از ژنوتیپها با استفاده از تجزیه منحنی ذوب بهطور اختصاصی میسر نشد. بنابراین روش تجزیه منحنی ذوب، ژنوتیپهای حاصل از جابهجایی تک نوکلئوتیدی در یک قطعه تکثیری (تک جایگاه) را به راحتی از هم تفکیک کرده، اما به دلیل پیچیدگیهای حاصل از حضور چندین جابهجایی در یک قطعه تکثیری (جایگاههای چندگانه) امکان جداسازی اختصاصی ژنوتیپها به راحتی میسر نمیباشد. با توجه به مزایای روش تجزیه منحنی ذوب در جداسازی ژنوتیپها، پیشنهاد میشود با انجام پژوهشهای جدید بتوان محدودیتهای این تکنیک برای قطعات تکثیری حامل چند جابهجایی تک نوکلئوتیدی را رفع کرد.
کلیدواژههای فارسی مقاله
ژن پرایون، PCR SSCP، MCA،تعیین توالی مستقیم ،گوسفند نژاد نائینی
عنوان انگلیسی
Identification of different allelic forms of PrP gene in Naeinian sheep using melting curve analysis technique
چکیده انگلیسی مقاله
Genotyping using direct analysis of DNA has a considerable importance in plants and animals breeding, also for diagnosis and evaluation of genetic disorders in plants, animals and in forensic science. The melting curve analysis method is one of the most cost-effective genotyping methods that can be used in relevant studies. In order to evaluate the performance of this technique, the current study was performed for detection of single nucleotide polymorphisms (SNPs) PrP gene in sheep. The DNA was extracted from 145 blood samples of Naieni sheep from Esfahan province with modified salting out method. After amplification of the desired fragment by polymerase chain reaction (PCR) genotyping of samples was carried out by melting curve analysis technique. In the following, the two methods of PCR-SSCP and direct sequencing method were used to confirm the genotyping results. The results of the present study showed that nine genotypes were observed at PrP locus in studied sheep population. But, due to multiple SNP at the amplified fragment, it cannot possible to exactly predict each genotype by melting curve analysis. With the results obtained from this study it can be concluded that melting curve analysis technique easily separates genotypes occurred by a single nucleotide substitution in one amplified fragment (single marker site), but because of the complexity of the presence of several SNP in an amplified fragment (multiple marker sites), it is not easily possible to separate each genotypes specifically. According to the advantages of melting curve analysis technique for isolation of genotypes, it is suggested that more research should be done for resolving the limitations of this technique for amplified fragments carrying multiple marker sites.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
PrP gene, PCR-SSCP, Melting curve analysis, Naieni sheep
نویسندگان مقاله
مجتبی نجفی | مجتبی نجفی
قدرت رحیمی میانجی | قدرت رحیمی میانجی
زربخت انصاری پیرسرایی | زربخت انصاری پیرسرایی
محمد علی روحی | محمد علی روحی
نشانی اینترنتی
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-395&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1516/article-1516-1988770.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات