این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ژنتیک نوین، جلد ۱۰، شماره ۳، صفحات ۴۱۷-۴۲۸
عنوان فارسی چند شکلی ادغامی رتروترنسپوزون‌ها و تنوع ژنتیکی در ارقام زراعی و ژنوتیپ-های وحشی انگور
چکیده فارسی مقاله به منظور مطالعه چند شکلی ادغامی خانواده‌های رتروترنسپوزونیTvv1 ، Edel، Vine1، Gentilو Huben و تنوع ژنتیکی در 67 رقم زراعی و ژنوتیپ‌های وحشی انگور (Vitis vinifera L.) از نشانگرهای IRAPو REMAP استفاده شد. در مجموع 103 مکان با استفاده از دو آغازگر IRAP و 13 ترکیب آغازگری REMAP تولید شد که از این تعداد، 83 مکان (58/80 درصد) چند‌شکل بودند. مقادیر شاخص تنوع نی برای آغازگرها از صفر (آغازگرGentil-A7) تا 38/0 (آغازگر Tvv1-808) متغیر بود. میانگین شاخص تنوع نی در کل ارقام مطالعه شده 27/0 بود. دامنه ضرایب تشابه ژنتیکی دایس بین ارقام از 57/0 (رقم H6 با دسترچین) تا یک (رقم رشه اصل با سیاه معمولی) متغیر و میانگین آن 78/0 بود. بیشترین مقادیر شاخص تنوع نی، تعداد الل‌های موثر (Ne) و شاخص اطلاعاتی شانون (I) مربوط به خانواده رتروترنسپوزونی Tvv1 و به ترتیب 32/0، 54/1 و 47/0 بود که بیانگر تحرک و چند شکلی زیاد این خانواده در ارقام مطالعه شده می‌باشد. تجزیه کلاستر بر‌اساس ضریب تشابهDice و الگوریتم UPGMA ارقام مورد مطالعه را در شش گروه اصلی قرار داد و نمونه‌های زراعی و وحشی را از هم متمایز کرد. شباهت و تمایز ارقام بر‌اساس نتایج حاصل از‌ تجزیه کلاستر ژنوتیپ‌های مورد مطالعه، به وسیله روش‌های مبتنی بر مدل با استفاده از نرم‌افزار Structure 2.3.1 تایید شد. نتایج نشان داد خانواده‌های رتروترنسپوزونی مورد استفاده به ویژه Tvv1 در ژنوم انگور به لحاظ انتقالی فعال بوده و می‌توان از نشانگرهای مبتنی بر این خانواده در تمایز ارقام و ژنوتیپ‌های انگور استفاده کرد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله انگور،تنوع ژنتیکی،رتروترنسپوزون،IRAP ،REMAP
عنوان انگلیسی Retrotransposon insertional polymorphism and genetic diversity in cultivated and wild grape genotypes
چکیده انگلیسی مقاله In the current investigation, inter retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) and retrotransposon microsatellite amplified polymorphism (REMAP) markers were used to study the insertional polymorphism of retrotransposon families Tvv1, Edel, Vine1, Gentil and Huben and genetic diversity in 67 grape (Vitis vinifera L.) cultivars and wild genotypes. Totally, 103 loci generated using 2 IRAP and 13 REMAP primers which 83 (80.58%) was polymorphic. The mean of Nei’s diversity index for primers ranged from 0 (Gentil-A7) to 0.38 (Tvv1-808), averaging 0.27 for the studied grape collection. The Dice similarity coefficients varied from 0.57 (H6 and Dastarchin) to 1 (Rasha-SeyahMamoli) with a mean value of 0.78. The maximum values of Nei’s diversity index (0.32), number of effective alleles (Ne=1.54) and Shannon’s information index (I=0.47) was for retrotransposon Tvv1, showing its high activity and insertional polymorphism in the studied grape collection. Cluster analysis using Dice similarity coefficients and UPGMA algorithm grouped cultivars in 6 main clusters and differentiated cultivated and wild grapes. The UPGMA classification of the studied cultivars was confirmed using model-based methods, implemented in software Structure 2.3.1. It was concluded that used retrotransposon families especially Tvv1 are transpositionally active and could make insertional polymorphism in grape genome; hence molecular markers developed based on this retrotransposon could be used in grapevine genotypes and cultivar identifications.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله معصومه فرخ نیا | معصومه فرخ نیا


بابک عبدالهی مندولکانی | بابک عبدالهی مندولکانی


حامد دولتی بانه | حامد دولتی بانه


ایرج برنوسی | ایرج برنوسی


نشانی اینترنتی http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-109-377&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1516/article-1516-1988808.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات