این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ژنتیک نوین، جلد ۱۴، شماره ۴، صفحات ۲۷۸-۲۸۷
عنوان فارسی تهیه نقشه ژنتیکی اشباع جمعیت لاین‌های اینبرد نوترکیب گندم نان بهاره با استفاده از روش ارزیابی ژنوتیپی با توالی‌یابی (Genotyping by Sequencing)
چکیده فارسی مقاله نقشه‌های ژنتیکی اشباع لازمه مکان‌یابی دقیق مکان­های ژنی کنترل کننده صفات کمی می­باشند. در این مطالعه، نقشه ژنتیکی اشباع جمعیت لاین­های اینبرد نوترکیب گندم نان بهاره حاصل از تلاقی رقم Yecora Rojo و ژنوتیپ بومی No. 49 با استفاده از روش ارزیابی ژنوتیپی با توالی­یابی (GBS) تهیه شد. برای شناسایی چندشکلی‌های تک نوکلئوتیدی (SNPs)، توالی‌یابی والدین و لاین­های اینبرد نوترکیب به‌صورت تکرار دار در سه لاین دستگاه ایلومینا Illumina Hiseq 2500 انجام شد. در مجموع، بیش از 36 هزار SNP شناسایی شد که 804 SNP به هیچ گروه کروموزومی منتسب نشد. از این تعداد SNP، 3042 به زیرژنوم A، 3977 به زیرژنوم B و 769 SNP به زیرژنوم D تعلق داشتند. پس از حذف SNPهایی با داده گمشده بیش از 20 درصد، فراوانی آلل نادر کمتر از 5 درصد و نیز دارای انحراف تفرق از نسبت‌ مندلی 1:1، تعداد 5831 نشانگر SNP شناسایی و به 21 کروموزوم گندم منتسب شد. این نشانگرها، 14/3642 سانتی‌مورگان از ژنوم گندم را با متوسط فاصله 62/0 سانتی‌مورگان بین دو نشانگر مجاور پوشش دادند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Construction of high density linkage map in spring bread wheat recombinant inbred lines using genotyping by sequencing (GBS) method
چکیده انگلیسی مقاله High density linkage maps are essential for precise mapping of gene loci controlling quantitative traits. In the present study, a high density linkage map of spring wheat recombinant inbred lines population derived from a cross between Yecora Rojo and No. 49 was constructed using genotyping by sequencing (GBS) method. To identify single nucleotide polymorphisms (SNPs), sequencing of parents and recombinant inbred lines was carried out at three lanes of Illumina Hiseq 2500. In total, more than 36 thousand SNP were identified of which 804 SNPs were not aligned to any wheat chromosome. Among these SNPs, 3042, 3977 and 769 SNPs were belonged to A, B and D sub genomes, respectively. After removing SNPs with ≥20% missing data and minimum allele frequency ≤0.05 as well as loci segregating from 1:1 Mendelian ratio, in total 5831 polymorphic SNPs identified and assigned to 21 chromosomes of wheat. These markers spanned 3642.14 cM of the wheat genome with an average marker density of 0.62 (markers/cM).  
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله نیر عبدالهی سیسی |
دانشگاه تبریز

سید ابولقاسم محمدی |
دانشگاه تبریز

سارا غفاریان |
دانشگاه شهید مدنی آذربایجان

نشانی اینترنتی http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-64-1&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده ژنتیک گیاهی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی کامل
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات