این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
یکشنبه 30 آذر 1404
فصلنامه علوم پزشکی دانشگاه آزاد اسلامی واحد پزشکی تهران
، جلد ۲۱، شماره ۴، صفحات ۲۳۳-۲۳۷
عنوان فارسی
به کار گیری روش High Resolution Melting در شناسایی چند شکلیهای نوکلئوتیدی ژرم لاین ژن STK۱۱ در مبتلایان به انواع سرطانهای دستگاه گوارش
چکیده فارسی مقاله
سابقه و هدف: آنالیز HRM (High Resolution Melting) تکنیکی است که میزان کاهش فلورسنت را در طی فرایند شیب حرارتی ذوب DNA در اثر خروج رنگ اندازهگیری مینماید. ژن STK11 یکی از پروتئینهای خانواده سرین- ترئونین کیناز سلولی را رمز مینماید که تنظیم کننده قطبیت سلولی بوده و همچنین به عنوان پروتئین مهار کننده تومور عمل مینماید. موتاسیونهای ژرم لاین در این ژن همراه با سندروم Peutz-Jeghers واستعداد ابتلاء به انواع نئوپلازیها میباشند.روش بررسی: در این مطالعه تجربی، DNA ژنومی از 56 بیمار مبتلا به انواع سرطانهای دستگاه گوارش استخراج گردید. سپس ما تغیرات نوکلئوتیدی را در تمام طول ژن با استفاده از تکنیک Real-time PCR و High(HRM) resolution melting بررسی نمودیم. یافتهها: غربالگری نوکلئوتیدی با تکنیک HRM دو نوع SNP در اینترونهای 6 و 7 در 10 بیمار را نشان داد. 4 بیماردارای تغییر نوکلئوتیدی C/T [cluster id/dsSNP/rs9282860] در اینترون 6 به صورت هموزیگوس و شش بیمار دارای تغییر نوکلئوتیدی C/G [cluster id/dsSNP/rs2075607] در اینترون 7 بصورت هتروزیگوس بودند. همچنین مقایسه نتایج HRM با نتایج تعیین توالی یک مطابقت 100 درصدی را نشان داد. نتیجهگیری: هر چند در این مطالعه موتاسیونی در بخش اگزون ژن مشاهده نگردید، به هر حال نتایج این مطالعه نشان میدهد غربالگری اولیه ژن STK11هم برای شناسایی تغییرات نوکلئوتیدی ناشناخته ژرم لاین و هم سوماتیک در مبتلایان به نئوپلازی به منظور تشخیص علت بیماری از طریق روش HRM به سهولت و با هزینه نسبتا اندک قابل اجراء میباشد.
کلیدواژههای فارسی مقاله
ژن STK11 ، موتاسیونهای ژرم لاین، High resolution melting
عنوان انگلیسی
Application of high resolution melting technique for detection of germ line single nucleotide polymorphisms in STK11 gene among patients with various gastrointestinal cancers
چکیده انگلیسی مقاله
Background: High Resolution Melting (HRM) is a method that analyzes genetic variations such as Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in PCR amplicons. The STK11 gene encodes a member of the serine/threonine kinase and regulates cell polarity and function as a tumor suppressor gene. The germ-line mutations in this gene are associated with Peutz-Jeghers syndrome. The patients with this syndrome are prone to some types of neoplasm. Materials and methods: In this experimental study, genomic DNA was extracted from the whole blood samples of 56 patients with various gastrointestinal cancers. The nucleotide changes in the entire STK11 gene were analyzed by Real-time PCR and H RM technique. Results: The nucleotide screening by HRM technique showed two types of SNPs in introns 6 and 7 of STK11 gene in 10 patients. Four patients had C / T substitution [cluster id/dsSNP/rs9282860] with homozygous genotype in intron 6, and six patients showed a C/G substitution [cluster id/dsSNP/rs2075607] with heterozygous genotype in intron 7. The direct sequencing of the fragments confirmed that the results obtained by HRM were 100% reliable. Conclusion: In this study we found no SNP in exons of STK11 gene. However, two SNPs were found in the introns of this gene. Our results show that the primary screening of the STK11gene by the HRM technique is easily applicable to detect the unknown germ line and somatic mutations in patients with neoplasia at a relatively low cost.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
STK11gene, Germ line mutations, High resolution melting
نویسندگان مقاله
سیدجمال حسینی | seyed jamal hosseini
reseacher member of society of biology, islamic azad university, tonekabon branch, tonekabon, iran
پژوهشگرعضو انجمن زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی تنکابن
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه آزاد اسلامی تنکابن (Islamic azad university of tonekabon)
علی ناظمی | ali nazemi
assistant professor, department of biology, islamic azad university, tonekabon branch, tonekabon, iran
گروه بیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه آزاد اسلامی تنکابن (Islamic azad university of tonekabon)
مهرداد هاشمی | mehrdad hashemi
associate professor, department of molecular genetics, islamic azad university, tehran medical branch, tehran, iran
گروه ژنتیک مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تهران پزشکی
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه آزاد اسلامی علوم و تحقیقات (Islamic azad university science and research branch)
میرساعد میری نرگسی | mirsaed miri nargesi
phd student of molecular genetics, islamic azad university, tonekabon branch, tonekabon, iran
دانشجوی دکتری ژنتیک مولکولی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه آزاد اسلامی تنکابن (Islamic azad university of tonekabon)
شهرآشوب شریفی | shahr ashoob sharifi
bs of genetics, islamic azad university, tonekabon branch, tonekabon, iran
کارشناس ژنتیک، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد تنکابن
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه آزاد اسلامی تنکابن (Islamic azad university of tonekabon)
نشانی اینترنتی
http://www.iau-tmuj.ir/browse.php?a_code=A-10-155-19&slc_lang=fa&sid=en
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
ژنتیک
نوع مقاله منتشر شده
تحلیلی/مقطعی/توصیفی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات