این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
یکشنبه 30 آذر 1404
پژوهش های تولیدات دامی
، جلد ۱۲، شماره ۳۴، صفحات ۱۴۱-۱۴۷
عنوان فارسی
ارتباط چند شکلی تک نوکلئوتیدی ناحیه اینترون (C۲۲۳۹T) ژن بتا۴-دیفنسین با صفات تولید شیر و تعداد سلول های بدنی در گاوهای هلشتاین
چکیده فارسی مقاله
چکیده مبسوط مقدمه و هدف: دیفنسین ها پپتیدهای ضد میکروبی کوچکی هستند که نقش مهمی در ایمنـی ذاتـی به عهده دارند. از این رو، ژن های کدکننده آنها می توانند به عنوان نشانگر، در انتخاب به کمک نشانگرها، به بهبود صفت اقتصادی دام های اهلی کمک بسزایی کنند. از این رو، هدف از این تحقیق بررسی ارتباط بین چند شکلی تک نوکلئوتیدی جایگاه 2239 ناحیه اینترون ژن بتا4-دیفنسین با صفات تولید شیر و تعداد سلولهای بدنی در گاوهای هلشتاین بود. مواد و روشها: برای این منظور، در مجموع تعداد 182 رأس گاو شیری هلشتاین انتخاب و DNA ژنومی استخراج شد. سپس، با استفاده از آغازگرهای مناسب قطعه ای به طول 393 جفت باز، در برگیرنده جهش جایگاه مورد نظر (از جایگاه 2100 الی2493 ژن بتا-4 دیفنسین به شماره دسترسی AF008307.1)، توسط تکنیک واکنش زنجیره پلی مراز تکثیر شد. سپس محصولات تکثیر شده از این ناحیه از اینترون ژن بتا4-دیفنسین توسط تکنیک تفاوت فرم فضایی رشته های منفرد (SSCPs) و متعاقبا، تعیین توالی مورد بررسی قرار گرفت. برای بررسی ارتباط بین چند شکلی تک نوکلئوتیدی با صفات تولید شیر و تعداد سلول های بدنی از رویه مدل خطی عمومی (GLM) نرمافزار SAS (نسخه 9/1) استفاده شد. یافتهها: نتایج این پژوهش حضور سه الگوی متفاوت SSCP در جمعیت مورد بررسی را نشان داد که نتایج تعیین توالی وجود چندشکلی تکنوکلئوتیدی جایگاه 2239 (جایگزینی C با T) در این ناحیه را تایید کرد. فراوانی ژنوتیپهای CC، CT و TT شناسایی شده بر اساس توالیهای بدست آمده در جمعیت مورد مطالعه به ترتیب 0/79، 0/13 و 0/08 بود. ارتباط معنی داری بین ژنوتیپ جهش جایگاه 2239 ژن بتا 4-دیفنسین و صفات تولید شیر، درصد چربی، درصد پروتئین و تعداد سلولهای بدنی در نمونههای مورد بررسی مشاهده نشد. اگرچه، تمایل نزدیک به معنیداری بین ژنوتیپ ها و مقدار تولید شیر مشاهده شد (0/1=p). میانگین تولید شیر و تعداد سلولهای بدنی برای ژنوتیپ TT نسبت به ژنوتیپهای دیگر بیشتر بود در صورتی که ژنوتیپ های CT و CC به ترتیب کمترین تولید شیر و تعداد سلول های سوماتیکی را نشان دادند. نتیجهگیری: در این پژوهش، ارتباط معنیداری بین ژنوتیپ های شناسایی شده با صفات تولیدی شیر و تعداد سلول های بدنی مشاهده نشد ولی این ارتباط برای صفت مقدار تولید شیر روزانه تمایل به معنیداری نشان داد. همچنین نتایج نشان داد ژنوتیپ های TT و CT برای این جهش به ترتیب دارای بیشترین و کمترین مقدار تولید شیر بودند.
کلیدواژههای فارسی مقاله
تعداد سلولهای بدنی، چندشکلی تکنوکلئوتیدی، ژن بتا4-دیفنسین، صفات تولید شیر، SSCP
عنوان انگلیسی
Association between Single Nucleotide Ppolymorphism (SNP) in the Intronic Region of (C2239T) B4-Defensin Gene with Milk Production Traits and Somatic Cell Count in Holstein Cattle
چکیده انگلیسی مقاله
Extended Abstract Introduction and Objective: Defensins are small antimicrobial peptides that play an important role in innate immunity. Therefore, their coding genes can be used as markers in selecting markers to help improve the economic quality of domestic animals. Therefore, the aim of this study was to investigate the relationship between C2239T SNP of the intron region of the beta-4-defensin gene with milk production traits and the somatic cell count in Holstein cows. Material and Methods: For this purpose, genomic DNA was extracted from 182 dairy cows. Then, using a suitable primer pairs, a 393 bp fragment from intron of bovine B4-defensin sequence (2100 to 2493) was amplified by the polymerase chain reaction. Then, the amplified fragment was screened by single strand conformation polymorphism (SSCP) and DNA sequencing methods. The associations between genotypes of the SNP with SCC and milk production traits were analyzed using the GLM procedure of SAS (9.1). Results: A total of 3 distinct SSCP patterns (A, B and C) were observed which confirmed single nucleotide polymorphism (substitution of C to T) at position 2239 upon sequence analysis in the population. The frequencies of CC, CT and TT genotypes were 0.79, 0.13 and 0.08, respectively. No significant difference was observed between SNP genotypes and milk production traits and SCC. However, the genotypes were tended to associate with milk yield (p=0.10). The highest average milk yield and somatic cell count were found in the TT genotype, whereas the lowest ones for average milk yield and somatic cell count were CT a CC genotypes, respectively. Conclusion: In this study, no significant relationship was observed between the identified genotypes with milk production traits and the number of body cells, but this relationship showed a significant tendency for the amount of daily milk production. The results also showed that TT and CT genotypes for this mutation had the highest and lowest milk production, respectively.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
B4-defensin gene, Milk production traits, Single nucleotide polymorphism, Somatic cell count, SSCP
نویسندگان مقاله
مصطفی محقق دولت آبادی | mustafa mijahjehj dolatabady
Animal Science Department, Faculty of Agriculture Science, University of Yasouj, Yasouj, Iran
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران
اعظم رحیمی رضایی | azam rahimirezaei
Animal Science Department, Faculty of Agriculture Science, University of Yasouj, Yasouj, Iran
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران
نشانی اینترنتی
http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1257-1&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
ژنتیک و اصلاح نژاد دام
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات