این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
سه شنبه 2 دی 1404
پژوهش های تولیدات دامی
، جلد ۱۲، شماره ۳۱، صفحات ۱۴۶-۱۵۶
عنوان فارسی
شناسایی جهش فقدان عملکرد p.Q۵۷۹X موثر بر سقط جنین در ژن APAF۱در گاوهای هلشتاین
چکیده فارسی مقاله
امروزه مشکلات تولید مثلی یکی از نگرانیهای اصلی در صنعت گاو شیری است. هدف از پژوهش حاضر شناسایی جهش فقدان عملکرد p.Q579X موثر بر سقط جنین خود به خودی و مشکلات تولید مثلی در ژن APAF1 با روش توالی یابی در گاو هلشتاین بود. در مجموع 200 نمونه خون تهیه و استخراج DNA با کیت تجاری انجام شد. سپس یک جفت آغازگر اختصاصی برای تکثیر قطعه ای با طول 456 جفت باز حاوی جهش مورد نظر طراحی و تعیین ژنوتیپ نمونه ها با روش PCR-SSCP انجام شد. در جایگاه APAF1 دو آلل A و B و دو ژنوتیپ AA و AB به ترتیب با فراوانی های 96/76، 3/24، 93/51 و 6/49 درصد مشاهده شدند. ژنوتیپ BB در نمونه های مورد مطالعه مشاهده نشد. بعد از تعیین ژنوتیپ نمونه ها، از هر ژنوتیپ دو نمونه به صورت دو طرفه توالییابیشده و بعد از همترازی توالی های به دست آمده، مقایسه آنها با توالی رفرنس برای شناسایی جهش های مورد نظر با استفاده از نرم افزار BioEdit (version7.0.9.0 ) صورت گرفت. نتایج بررسی های بیوانفورماتیک نشان داد که جهش p.Q579X که یکی از جهش های موثر بر سقط جنین در گاو هلشتاین می باشد در ژنوتیپ AB ژن APAF1 در گاوهای هلشتاین در ایران وجود دارد. با توجه به اینکه این جهش در حالت هموزیگوت باعث سقط جنین در گاو میشود، می توان نتایج حاصل از این پژوهش را در برنامه های اصلاح نژادی در راستای شناسایی حاملین و حذف آنها از گله گاوهای شیری هلشتاین به کار برد.
کلیدواژههای فارسی مقاله
توالی یابی، ژن APAF1، سقط جنین، گاو هلشتاین
عنوان انگلیسی
Detection of Lack of Function Mutation of p.Q879X Affecting Abortion in APAF1 Gene in Holstein Cattle
چکیده انگلیسی مقاله
Today, reproductive problems are one of the major concerns in the dairy industry. The aim of this study was to detect the lack of function mutation of p.Q579X affecting spontaneous abortion and reproduction problems in APAF1 gene in Holstein cattle. In total, 200 blood samples were prepared and DNA was extracted with commercial kit. Then a specific pair of primers was designed to amplify a fragment with lengths of 456 bp from the exons 11 of the APAF1 gene and genotyping was performed by PCR-SSCP method. In APAF1 locus two alleles of A and B and two genotypes of AA and AB with frequencies of 96.76, 3.24 and 93.51 and 6.49 were observed, respectively. The BB genotype was not observed in the studied samples. After determining the genotype of the samples, two samples from each genotype were sequenced from both end and alignment of the obtained sequences and their comparison with the reference sequence from the gene bank to detect the mutation was carried out using BioEdit (version7.0.9.0) software. The results of bioinformatics analysis showed that the lack of function mutation of p.Q579X, which is one of the mutations affecting abortion in Holstein cattle, is present in the AB genotype of APAF1 gene in Holstein cattle in Iran. Given that this mutation causes abortion in cow in homozygous form, the results of this study can be directly used in breeding programs in order to identify the carriers of this mutation and culling them from Holstein dairy herd.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
Abortion, APAF1 gene, Holstein cattle, Sequencing
نویسندگان مقاله
خزان عنایتی | Khazan Enayati
Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran
گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
ایوب فرهادی | Ayoub Farhadi
Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran
گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
قدرت رحیمی میانجی | Ghodrat Rahimi-Mianji
Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran
گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
نشانی اینترنتی
http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-400-6&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
ژنتیک و اصلاح نژاد دام
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات