این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ژنتیک نوین، جلد ۱۶، شماره ۳، صفحات ۲۴۹-۲۶۱
عنوان فارسی ژنومیکس مقایسه ایی اسب های پونی و هانوواریان در برابر نژادهای مختلف اسب برای شناسایی ژن های کاندید اندازه بدن و عملکرد ورزشی
چکیده فارسی مقاله در طول فرآیندهای انتخاب طبیعی و مصنوعی، نژادهای اسب نیروی انتخاب را برای توسعه ویژگی های مطلوب تجربه کرده اند. این امر منجر به تنوع زیادی در بین نژادهای مختلف گردیده است که در بسیاری از صفات فنوتیپی مانند اندازه بدن، ترکیب عضله، سرعت رشد، تولید مثل و رفتار با یکدیگر متفاوت هستند. هدف از انجام این پژوهش بررسی نشانه های انتخاب مرتبط با صفات کنترل کننده اندازه بدن و نیز عملکرد ورزشی در نژاد­های اسب می باشد. در این مطالعه، از داده های توالی یابی کل ژنوم 86 راس اسب استفاده شد.  برای بررسی نشانه های انتخاب از روش شاخص تثبیت (Fst) و نسبت درست نمایی مرکب بین جمعیتی (XP-CLR) استفاده شد. برای صفت اندازه بدن، مطالعه ژنتیکی بر مبنای اندازه کوچک بدن نژاد پونی دبائو انجام گرفت. بررسی ژنتیکی نشان داد که مهمترین نشانه انتخاب مربوط به ژن FGFR1 برای قد کوتاه در این جمعیت می باشد که طی سالیان متمادی تحت انتخاب بوده اند. علاوه بر این، چهار جایگاه ژنومی دیگر در کروموزوم های 2، 3 و 4 شناسایی شد، که در ارتباط با توسعه اندازه بدن بودند. بررسی نشانه های انتخاب در ارتباط با شناسایی ژن های کاندید موثر بر عملکرد ورزشی بر مبنای نژاد اسب هانوواریان انجام گرفت. واکاوی ژنتیکی نشان داد که ژن ACTA1 در عملکرد ورزشی این نژاد دارای اهمیت است، که با نقش آن در جمعیت انسانی همخوانی دارد. علاوه بر این، سه جایگاه ژنومی دیگر نیز در کروموزوم های 1 و 20 گزارش گردید، که می توانند در عملکرد فیزیکی اسب موثر باشند. ژن های کاندید گزارش شده در این پژوهش می توانند درک روشنی از پایه ملکولی مربوط به صفات اندازه بدن و عملکرد ورزشی در اسب را ایجاد نمایند. نتایج حاصل از این پژوهش می­تواند دیدگاه جدیدی در رابطه با معماری ژنتیکی صفات در برنامه های اصلاح نژادی اسب ایجاد نماید.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله اندازه بدن، عملکرد ورزشی، ژنومیکس اسب
عنوان انگلیسی Comparative genomics of Pony and Hanoverian horses versus different breeds of horses for identifying candidate genes associated with body size and athletic performance
چکیده انگلیسی مقاله During domestication and artificial selection, horse breeds have experienced intense selection pressures for the development of desirable traits. This has resulted in a large diversity of breeds that display variation in many phenotypic traits, such as body size, muscle composition, growth rate, reproduction and behavior. The main goal of this study was detection of signatures positive selection associated with body size and athletic performance traits in horse breeds. Herein, we used whole genome sequencing data from 86 horses. To detect genomic signatures of positive selection, we applied fixation index (FST) and cross-population composite likelihood ratio (XP-CLR) methods. For body size trait, genetic study was performed based on the small body size of Debao pony. The most significant signal of positive selection was mapped to the FGFR1 gene, which may have independently been selected for short stature in the Chinese pony population. In addition, four other loci on chromosomes 2, 3 and 4 were identified to be potentially involved in the development of body size. The screen of the potential candidate genes involved in athletic performance was carried out based on Hanoverian horse breed.  Genetic analyses showed that the ACTA1 gene is potentially involved in athletic performance in this breed, consistent with its role observed in human population. In addition, three other loci on chromosomes 1 and 20 were identified to be potentially involved in the equine physical performance. These novel candidate genes identified in this study may be useful targets for clarifying our understanding of the molecular basis of body size and athletic performance in horses. These results can provide new insight for future research into the genetic architecture of relevant traits in horse breeding program.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Athletic performance, Body size, Horse genomics
نویسندگان مقاله حجت اسدالله پور نعنایی | Hojjat Asadollahpour Nanaei
Shahid Bahonar University of Kerman
دانشگاه شهید باهنر کرمان

علی اسماعیلی زاده | Ali esmailizadeh
Shahid Bahonar University of Kerman
دانشگاه شهید باهنر کرمان

حامد خراتی کوپایی | Hamed Kharrati-Koopaee
Shiraz University
دانشگاه شیراز

نشانی اینترنتی http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-264-2&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده ژنتیک جانوری
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی کامل
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات