این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
یکشنبه 23 آذر 1404
ژنتیک نوین
، جلد ۱۷، شماره ۲، صفحات ۱۱۳-۱۲۵
عنوان فارسی
کلونینگ و تعیین توالی نوکلئوتیدی ژن کامل پروتئین ماتریکس ویروس بیماری نیوکاسل شایع در گلههای مرغ گوشتی شمال شرق ایران
چکیده فارسی مقاله
بیماری نیوکاسل یک بیماری ویروسی شناخته شده و یکی از اصلیترین عوامل بیماریزا در صنعت طیور در سراسر جهان است. پروتئین ماتریکس (M) یکی از پروتئینهای ساختاری ویروس بیماری نیوکاسل است که نقش مهمی در بیماریزایی، تکثیر و جوانهزنی ویروس دارد و همچنین پوشش ویروسی را به کمپلکس ریبونوکلئوپروتئین (RNP) پیوند میدهد. با توجه به نقش پروتئین ماتریکس، این مطالعه با هدف فراهم نمودن اطلاعات تکمیلی جهت تعیین هویت یک جدایه ویروس بیماری نیوکاسل با نام CH/RT40/IR/2011 شایع در گلههای مرغ گوشتی تجاری استان خراسان رضوی انجام گرفت. ژن کامل پروتئین ماتریکس RT40 با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیر و سپس در پلاسمید PTZ57r/t کلون شد. پس از تعیین توالی نوکلئوتیدی تجزیه و تحلیل دادهها با استفاده از نرمافزار CLC Main Workbench 5.5 انجام شد. درخت فیلوژنتیک با استفاده از روش Maximum likelihood با نرمافزار MEGA6 رسم شد. تعیین توالی ژن پروتئین ماتریکس (1241نوکلئوتید)، درخت فیلوژنتیک و آنالیز فواصل ژنتیکی بین ژنوتیپی نشان داد که RT40با تحت ژنوتیپ VII.1.1 ویروسهای بیماری نیوکاسل ایرانی (MF417546) و عراقی (MT370497,MT370499) شباهت دارد. بررسی توالی پروتئینی سیگنالهای متمرکزکننده هستهای (247KKGKKVTFDKIEEKIRR263) و دیگر نواحی پروتئین ماتریکس RT40 نشان داد که این ویروس بسیار شبیه به ویروسهای فوق حاد بیماری نیوکاسل است. یافتههای حاصل از این مطالعه تکمیلکننده اطلاعات لازم برای شناسایی کامل جدایه RT40 و معرفی آن بهعنوان یک سویه بومی ویروس بیماری نیوکاسل بود.
کلیدواژههای فارسی مقاله
درخت فیلوژنتیکی، ژن ماتریکس، ژنوتایپ VII.1.1، ویروس بیماری نیوکاسل، ایران
عنوان انگلیسی
Cloning and nucleotide sequencing of the complete matrix protein of Newcastle disease virus subgenotype VII.1.1 prevalence in broiler flocks of northeastern Iran
چکیده انگلیسی مقاله
Newcastle disease (ND) is a well-known and major viral disease of poultry industry all over the world. Viral matrix (M) protein is a structural protein linking the viral envelope with the virus core that plays an important role in pathogenesis. It plays a crucial role in virus assembly and interact with the ribonucleoprotein (RNP) complex as well as with the viral membrane. Due to the role of matrix protein, this study was performed to complete previous studies to identify a Newcastle disease virus (NDV) isolate naming CH/RT40/IR/2011 which is prevalent in commercial broiler flocks in Khorasan Razavi province. The full M protein gene of the RT40 was amplified using specific primers and then cloned into a PTZ57R/T cloning vector. The cloning vector product was sequenced from both directions and data analyses were performed using CLC Main Workbench 5.5. The phylogenetic tree was constructed with the maximum likelihood method in MEGA 6. Nucleotide sequencing of M protein gene (nt: 1241), phylogenetic tree and analysis of genetic distances between genotypes showed that RT40 was similar to Iranian (MF417546) and Iraqi (MT370499, MT370497) NDVs subgenotype VII.1.1. Investigation of amino acid sequence of the nuclear localization signals (247KKGKKVTFDKIEEKIRR263) and other matrix gene protein regions revealed that this virus was very similar to very virulent NDVs. These results completed the prat of information required for full characterization of RT40 as well as for introduction of a native NDV strain.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
Genotype VII.1.1, Matrix gene, Newcastle disease virus, Phylogenetic tree, Iran
نویسندگان مقاله
علی اکبر خبیری | Aliakbar Khabiri
Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Iran
دانشجوی دکتری. کرمان، دانشگاه شهید باهنر کرمان، دانشکده کشاورزی
رضا طرقی | Reza Toroghi
Mashhad Branch, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Mashhad, Iran
مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران
محمدرضا محمدآبادی | Mohammadreza Mohammadabadi
Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Shahid Bahonar University of Kerman, Iran
دانشگاه شهید باهنر کرمان، دانشکده کشاورزی
سیدالیاس طباطبایی زاده |
Mashhad Branch, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Mashhad, Iran
مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران
نشانی اینترنتی
http://mg.genetics.ir/browse.php?a_code=A-10-313-2&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
ژنتیک جانوری
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی کامل
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات