این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
چهارشنبه 19 آذر 1404
مجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران
، جلد ۷۳، شماره ۱۱، صفحات ۷۸۴-۷۹۰
عنوان فارسی
مقایسه روش Real-time PCR با استفاده از پرایمر همگانی ۲۳s rRNA و روش کشت خون در تشخیص سپتیسمی
چکیده فارسی مقاله
زمینه و هدف: در سراسر دنیا عفونتهای جریان خون (Blood Stream Infections, BSI) دارای میزان شیوع و مرگومیر بالایی هستند که بین 20% تا 70% متغیر میباشد. بنابراین هدف از این مطالعه یافتن یک روش کارآمد برای تشخیصی سپتیسمی در کنار روش کشت، با استفاده از پرایمر همگانی 23S rRNA در تشخیص بیماران مشکوک به سپتیسمی بود. روش بررسی: این مطالعه از نوع توصیفی- مقطعی میباشد که از مهر 1393 تا خرداد 1394 در بیمارستانهای آموزشی شهر همدان در دو مرحله آنالیتیکی و کلینیکی انجام گرفت. در مرحله آنالیتیکی حساسیت و اختصاصیت پرایمر با دو باکتری استافیلوکوکوس اورئوس، اشرشیاکلی و همچنین آزمایش بر روی نمونههای DNA غیر باکتریایی مانند نمونه سلولی انسان و نمونه سلولی قارچ ارزیابی شد. در مرحله کلینیکی 121 نمونه بیمار مشکوک به سپتیسمی از بخش مراقبتهای ویژه بیمارستانهای شهر همدان، با روش Real-time polymerase chain reaction (PCR) و روش کشت خون بررسی گشت و نتایج آنها با هم مقایسه گردید. یافتهها: حساسیت بهدستآمده برای استافیلوکوکوس اورئوس و اشرشیاکلی، دو رونوشت نامبر و پایینترین حد DNA قابل شناسایی برای پرایمر 5fg میباشد. در روش Real-time PCR تعداد 78/57% (70 مورد) از نمونهها مثبت و 22/13% (16 مورد) از نمونهها توسط روش کشت مثبت گردید. همبستگی یا توافق کاپا 2/0 بهدست آمد که نشاندهنده توافق ضعیف بین دو روش است. نتیجهگیری: حساسیت روش Real-time PCR نسبت به روش کشت خون بیشتر است و بهعلت حساسیت بالا میتوان از این پرایمر برای آزمایشات غربالگری نمونه خون بیماران مشکوک به سپتیسمی استفاده کرد.
کلیدواژههای فارسی مقاله
کشت خون، 23 ، Real-time PCR، سپتیسمی
عنوان انگلیسی
Comparison of Real-time PCR method and blood culture in diagnosis of septicemia
چکیده انگلیسی مقاله
Background: Bloodstream infections (BSI) have a high incidence and high mortality in the worldwide. The mortality rate is variable between 20-70%. Therefore, early and timely detection of BSI agent in clinical laboratories is necessary. The aim of this study was to determine an efficient diagnostic tool to septicemia in accompany of blood culture method by Real-time PCR (using panbacterial 23S rRNA gene). Methods: This cross-sectional study was conducted in two analytical and clinical stages in Hamadan University of Medical Sciences, Iran, from October 2014 to June 2015. In analytical stage, sensitivity (by serial dilution from 104 to 1 CFU/ml) and specificity of the primer were evaluated with the Staphylococcus aureus (as Gram positive indicator bacteria) and Escherichia coli (as Gram-negative indicator bacteria), human genome (from Hella cell culture), Candida albicans yeast and Aspergillus fumigatus fungus. In clinical stage, 121 blood samples were collected from patients suspected to sepsis in intensive care unit (ICU) from Hamadan University Hospitals. Finally, the results of Real-time PCR and blood culture methods were compared. Results: The Real-time PCR showed a sensitivity ranging from 2 to 10 target copies per reaction to the whole blood for Escherichia coli and Staphylococcus aureus respectively. The specificity of this method was evaluated and no false positive amplification was identified. 57.85% (70 cases) of the samples were positive by Real-time PCR and 13.22% (16 cases) of the samples were positive by blood culture. However, none of the cases that were positive by blood culture were negative in Real-time PCR. As well as, 44.62% (54 cases) of cases were positive by Real-time PCR but blood culture showed no bacteria in the samples, and 42.15% (51 cases) were negative by both methods. Correlation or agreement of Kappa was 0.20, that indicating poor agreement between the two methods. Conclusion: Real-time PCR is more sensitive than blood culture and also, because of high sensitivity of this primer by Real-time PCR, we can use it for screening blood samples from suspected patients of sepsis.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله
علی غلامی | ali gholami
department of microbiology, faculty of medicine, hamedan university of medical sciences, hamedan, iran.
گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی همدان (Hamadan university of medical sciences)
محمدرضا عربستانی | mohammad reza arabestani
department of microbiology, faculty of medicine, hamadan university of medical sciences, hamadan, iran. postal code 6517619653. tel 98 81 3838077
همدان، دانشگاه علوم پزشکی همدان، دانشکده پزشکی، گروه میکروب شناسی، کد پستی 6517619653 تلفن 3838077-081
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی همدان (Hamadan university of medical sciences)
نشانی اینترنتی
http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-5412&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
مقاله اصیل
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات