این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
چهارشنبه 19 آذر 1404
مجله دانشکده پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران
، جلد ۷۳، شماره ۷، صفحات ۴۷۸-۴۸۴
عنوان فارسی
بررسی ژنهای مشترک سرطان پستان و چاقی بهروش اولویتبندی ژنهای کاندیدا
چکیده فارسی مقاله
زمینه و هدف: گزارشهای زیادی چاقی را بهعنوان یک ریسک فاکتور مؤثر در ایجاد سرطان پستان تأًیید میکند، اما ارتباط مولکولی چاقی و سرطان پستان هنوز به درستی روشن نیست. مطالعه حاضر با هدف بررسی اولویت ژنهای مؤثر در ارتباط مولکولی چاقی و سرطان پستان انجام شد. روش بررسی: این پژوهش از فروردین تا تیر 1393 در مرکز پژوهشهای بیوشیمی و بیوفیزیک دانشگاه تهران بهروش شبیهسازی رایانهای برای الویتبندی ژنهای مؤثر در ارتباط مولکولی چاقی و سرطان پستان انجام شد و از الگوریتم Multiple Data Sources برای تجزیه و تحلیل دادهها استفاده شد. ژنهای آموزشی از میان ژنهایی انتخاب شد که تأثیر آنها در یکی از اختلالات چاقی و سرطان پستان و یا در هر دو، در مطالعات پیشین تأیید شده بود. دو دسته ژن کاندیدا وارد مطالعه شدند. گروه اول ژنهایی که در پنج ناحیه کروموزومی مشترک چاقی و سرطان پستان قرار داشتند و گروه دوم ژنهای حاصل از آنالیز نتایج میکرواری پژوهش Creighton و همکاران بودند. یافتهها: تعداد 72 ژن حاصل آنالیز میکرواری و ژنهای پنج ناحیهی کروموزومی، به چهار سبک اولویتبندی شدند که از این میان پنج ژن NTRK3, TNFRSF10B, F2, IGFALS و HSP90B1 در 10 اولویت اول دو بار تکرار شده بود. این پنج ژن در ایجاد ارتباط مولکولی بین چاقی و سرطان پستان در اولویت قرار گرفتند. نتیجهگیری: وجود ژنهای مشترک بین سرطان پستان و چاقی نشانگر وجود ارتباط مولکولی بین این دو موضوع میباشد. در این پژوهش امکان تأثیر پلیمورفیسم ژن F2 در ایجاد سرطان پستان همراه با ریسک فاکتور چاقی تأیید شد که در پژوهشهای گذشته مطرح نشده بود.
کلیدواژههای فارسی مقاله
سرطان پستان، چاقی، ژن، شبیهسازی کامپیوتری
عنوان انگلیسی
Investigation of the molecular relationship between breast cancer and obesity by candidate gene prioritization methods
چکیده انگلیسی مقاله
Background: Cancer and obesity are two major public health concerns. More than 12 million cases of cancer are reported annually. Many reports confirmed obesity as a risk factor for cancer. The molecular relationship between obesity and breast cancer has not been clear yet. The purpose of this study was to investigate priorities of effective genes in the molecular relationship between obesity and breast cancer. Methods: In this study, computer simulation method was used for prioritizing the genes that involved in the molecular links between obesity and breast cancer in laboratory of systems biology and bioinformatics (LBB), Tehran University, Tehran, Iran, from March to July 2014. In this study, ENDEAVOUR software was used for prioritizing the genes and integrating multiple data sources was used for data analysis. Training genes were selected from effective genes in obesity and/or breast cancer. Two groups of candidate genes were selected. The first group was included the existential genes in 5 common region chromosomes (between obesity and breast cancer) and the second group was included the results of genes microarray data analysis of research Creighton, et al (In 2012 on patients with breast cancer). The microarray data were analyzed with GER2 software (R online software on GEO website). Finally, both training and candidate genes were entered in ENDEAVOUR software package. Results: The candidate genes were prioritized to four style and five genes in ten of the first priorities were repeated twice. In other word, the outcome of prioritizing of 72 genes (Product of microarray data analysis) and genes of 5 common chromosome regions (Between obesity and breast cancer) showed, 5 genes (TNFRSF10B, F2, IGFALS, NTRK3 and HSP90B1) were the priorities in the molecular connection between obesity and breast cancer. Conclusion: There are some common genes between breast cancer and obesity. So, molecular relationship is confirmed. In this study the possible effect of gene F2 polymorphism in making breast cancer associated with obesity risk factor was confirmed, the fact that past studies have not been reported.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
breast neoplasms, computer simulation, genes, obesity
نویسندگان مقاله
سبا گرشاسبی | saba garshasbi
department of biology, islamic azad university, shahrekord branch, shahrekord, iran.
تهران، استاد معین، خیابان دستغیب، بهداشت غرب، آزمایشگاه قطب کشوری، اچ ای وی دانشگاه علوم پزشکی ایران تلفن 66047831-021
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم پزشکی ایران (Iran university of medical sciences)
داریوش سلیمی | dariush salimi
department of bioinformatic, laboratory of systems biology and bioinformatics lbb , institute of biochemistry and biophysics, university of tehran, tehran, iran. department of bioinformatic, research institute of modernbiological techniques rimbt , university of zanjan, zanjan, iran.
گروه بیوانفورماتیک، آزمایشگاه سیستم بیولوژی و بیوانفورماتیک، مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک، دانشگاه تهران
سازمان اصلی تایید شده
: مرکز تحقیقات بیوشیمی و بیوفیزیک (Institute of biochemistry and biophysics)
عباس دوستی | abbas doosti
biotechnology research center, islamic azad university, shahrekord branch, shahrekord, iran.
مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد شهرکرد
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه آزاد اسلامی شهرکرد (Islamic azad university of shahrekord)
نشانی اینترنتی
http://tumj.tums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-25-5370&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
مقاله اصیل
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات