این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
تحقیقات دامپزشکی، جلد ۶۹، شماره ۱، صفحات ۴۹-۵۵
عنوان فارسی بررسی خصوصیات چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی در ناحیه َ۵ ژن لاکتوفرین در گاوهای بومی و هلشتاین ایران
چکیده فارسی مقاله زمینه مطالعه: لاکتوفرین، گلیکوپروتیین متصل شونده به آهن، دارای نقش‌های فیزیولوژیکی متعددی می باشد که مهمترین آنها خواص آنتی میکروبی است. از این رو ژن کد کننده این پروتیین می تواند به عنوان ژن کاندیدایی در مقاومت به بیماری ورم پستان در نظر گرفته شود. هدف: بررسی ناحیه َ5 ژن لاکتوفرین گاو در نمونه‌های بومی و هلشتاین با استفاده از روش ‌PCR-SSCP‌ و تعیین توالی می باشد. روش کار: برای این منظور از تعداد 50 نمونه گاو بومی و 50 نمونه گاو هلشتاین ماده ژنتیکی استخراج گردید. آغازگرهای لازم جهت تکثیر بخشی از ناحیه َ5 ‌طراحی، و قطعه مورد نظر توسط روش SSCP تعیین ژنوتیپ شد. سپس هر الگوی مشاهده شده تعیین توالی گردید و همترازی توالی‌ها جهت شناسایی چند شکلی‌های تک نـوکلئـوتیـدی صـورت گـرفت. همچنین، تجزیه و تحلیل این سیلیکو‌(In silico)‌ جهت تأثیر چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی برجایگاه اتصال فاکتورهای رونویسی در ناحیه تکثیر شده صورت گرفت. نتایج:‌ ‌در این تحقیق، در تمام نمونه‌های مورد بررسی 3 الگوی واضح ) SSCP‌A، B و (C‌ برای قطعه تکثیر شده مشاهده شد که در گاو‌های بومی تنها‌هاپلوتیپ ‌C‌ آشکار گردید. تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی توالی‌ها نشان داد که جایگزینی ‌T‌ با ‌G‌ در جایگاه 602 منجر به ایجاد جایگاه اتصالی برای فاکتور رونویسی ‌1AML-‌ گردید. از طرف دیگر، جایگزینی ‌T‌ با ‌C‌ در جایگاه 586 جایگاه اتصال فاکتور رونویسی 1AML-‌ را منسوخ می کند. نتیجه گیری نهایی: بنابراین، جهت استفاده از ژن لاکتوفرین به عنوان نشانگر مقاومت به بیماری ورم پستان در گاوهای شیری، بررسی این چند شکلی‌ها از نظر تأثیر بر فرآیند رونویسی ژن، همچنین ارتباط آن با تعداد سلول‌های سوماتیکی شیر امری ضروری می باشد.  
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Characterization of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5'-flanking region of bovine lactoferrin gene in the local and holstein cattle of Iran
چکیده انگلیسی مقاله BACKGROUND: Lactoferrin (Lf), an iron binding glycoprotein, has a variety ofphysiological roles and its foremost is antimicrobial properties. Therefore, the lactoferringene can be considered as a potential candidate gene for resistance to mastitis. OBJECTIVES:This study was carried out to determine the haplotype frequency of the 5'-flanking region ofbovine lactoferrin gene in local and Holstein cattle breeds of Iran using PCR-SSCPand DNAsequencing. METHODS: Genomic DNA was isolated from 100 blood samples of two cattlebreeds (50 Local, 50 Holstein). Two new primer pairs were designed from Lf sequence toamplify a part of 5'-flanking region of the gene. The amplified fragment was screened bysingle strand conformation polymorphism (SSCP) and DNA sequencing. The multiplealignments were carried out for the nucleotide sequences of different SSCPpatterns. In silicoanalysis of identified single nucleotide polymorphisms (SNPs) within the 5'-flanking regionof bovine Lf gene was screened, to identify any association on transcription factor bindingaffinity. REULTS: Analysis of the whole samples revealed three SSCP patterns (A, B and C)for amplified fragment that C haplotype was the only variant identified in local breed samples.The bioinformatics analysis revealed that the Tto G trans version at position -602 created anAML-1 transcription binding site in combined genotype A. In -586 position, Tto C transitionabolished binding site of AML-1 transcription factor. CONCLUSIONS: Therefore, to apply Lfgene for marker-assisted selection, additional studies are required to evaluate the functionalrole of these identified polymorphic sites on gene expression and somatic cell counts in cattle.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله مصطفی محقق دولت آبادی | mohaghegh dolatabadi
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه یاسوج، یاسوج– ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه یاسوج (Yasouj university)

جواد حبیبی زاد |
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه یاسوج، یاسوج– ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه یاسوج (Yasouj university)

فرحناز ایمانی خواه |
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه یاسوج، یاسوج– ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه یاسوج (Yasouj university)

نشانی اینترنتی http://jvr.ut.ac.ir/article_35031_1e450f38e7542410c01a6756a2b7e4da.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/699/article-699-280373.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات