این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
علوم دامی، جلد ۳۶، شماره ۱۴۰، صفحات ۹۷-۱۱۰
عنوان فارسی بررسی شبکه تنظیمی ژن‌های مؤثر بر صفات تولید و ترکیبات شیر گوسفند با استفاده از مطالعات پویش کل ژنومی (GWAS)
چکیده فارسی مقاله به‌منظور بهره‌گیری از نتایج تحقیقات مرتبط با مطالعات پویش کل ژنومی (GWAS) و استفاده از آن در جهت ترسیم شبکه‌های تنظیم ژنی، مطالعات جدیدی در حال انجام می‌باشد که مبنای آن استفاده از الگوریتم‌های ماتریس AWM است (Reverter و Fortes، 2013). در مطالعه حاضر، شبکه‌های ژنی از طریق الگوریتم‌های ماتریسAWM -PCIT و ارتباط SNPها با فنوتیپ‌های تولید و ترکیبات شیر گوسفند ترسیم شد. بدین منظور از داده‌های تولید و ترکیبات شیر ‌469 رأس میش نژاد Valle del Belice و اطلاعات ژنوتیپی ‌37228 SNP استفاده شد. داده‌های فنوتیپی شامل 5328 رکورد روز آزمایش برای 6 صفت تولید شیر (مقدار تولید، میزان و درصد چربی، میزان و درصد پروتئین و تعداد سلول‌های بدنی شیر) بود و شبکه تنظیم ژنی با استفاده از برنامه cytoscape رسم شد. نتایج نشان داد که استفاده از الگوریتم‌های AWM-PCIT از بین ژن‌های شناسایی موجود، که در ارتباط مستقیم و غیرمستقیم با صفات مرتبط با شیر بودند ژن‌های OSBPL3، ERBB4، VGLL4، BAZ1A، DDX25، CDH23، ITSN2، DPY30، FAT3 و CAPN10 شناسایی شدند. نتایج مطالعه حاضر و سایر مطالعات نشان داد که فرآیند پیچیده تولید و ترکیبات شیر تحت تأثیر شبکه تنظیم ژنی بیش از 10 ژن مهم و ارتباط با تعداد زیادی از ژن‌های دیگرقرار دارد و با توجه به تأیید نتایج حاصل از مطالعه قبلی در زمینه‌ی پویش ژنومی صفات تولید و ترکیبات شیر، و شناسایی مناطق ژنومی جدید مرتبط با این صفات، استفاده از یافته‌های این تحقیق، می‌تواند در انتخاب ژنتیکی گوسفند مفید باشد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله مطالعات پویش ژنومی (GWAS، شبکه تنظیمی ژن، تولید شیر، گوسفند،
عنوان انگلیسی Study of gene regulatory network using a genome-wide association study for milk yield and composition traits in sheep
چکیده انگلیسی مقاله Nowadays, new studies are being conducted based on the results of GWAS studies and the mapping of gene regulation networks based on the use of AWM matrix algorithms. In the present study, to map gene networks using AWM-PCIT matrix algorithms and and the association of SNPs with sheep milk production phenotypes and compositions was used. For this purpose, data on milk production traits in Valle del Belice sheep were used. After data quality control, 469 ewes and 37228 SNPs were used for final analysis. Phenotypic data were retained for analysis and contained 5586 Test day records for six milk production traits. and their gene regulation network was plotted using the cytoscape program. The results showed that using AWM-PCIT matrix algorithms, among the candidate genes that are directly and indirectly related to milk production traits were identified GENES OSBPL3, ERBB4, VGLL4, BAZ1A, DDX25, CDH23, ITSN2, DPY30, FAT3 and CAPN10. The present study and other studies have shown that the complex process of milk production and composition is important under the influence of the gene regulation network of more than 10 genes and is associated with many other genes.In total, this study supported previous results from GWAS of milk production and composition traits, also revealed additional regions in the sheep genome associated with these economically important traits. Using these findings could potentially be useful for genetic selection in the breeding programs.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله مطالعات پویش ژنومی (GWAS, شبکه تنظیمی ژن, تولید شیر, گوسفند
نویسندگان مقاله رمضانعلی عزیزی |
دانش‌آموخته دانشکده کشاورزی و محیط زیست دانشگاه اراک و عضو هیئت علمی مرکز تحقیقات کشاورزی استان مرکزی

امیر حسین خلت آبادی فراهانی |
دانشیار دانشکده کشاورزی و محیط زیست دانشگاه اراک، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، گروه علوم دامی

حسین مرادی |
دانشیار دانشکده کشاورزی و محیط زیست دانشگاه اراک، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، گروه علوم دامی

حسین محمدی |
استادیار دانشکده کشاورزی و محیط زیست دانشگاه اراک، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، گروه علوم دامی

حسینعلی قاسمی |
استادیار دانشکده کشاورزی و محیط زیست دانشگاه اراک، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، گروه علوم دامی

نشانی اینترنتی https://asj.areeo.ac.ir/article_130514_16651987a88125aee05ed280e9fd2bc2.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات