این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
پنجشنبه 4 دی 1404
علوم دامی ایران
، جلد ۴۷، شماره ۳، صفحات ۳۸۹-۳۹۸
عنوان فارسی
تعیین جایگاههای تحت انتخاب مثبت در نژادهای گوسفند ایرانی بلوچی و زل
چکیده فارسی مقاله
نشانههای انتخاب در کل ژنگان (ژنوم)، ما را در درک سازوکارهای انتخاب و شناسایی مناطقی از ژنگان که در طی سالیان متمادی بهصورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شدهاند، راهنمایی میکنند. هدف این تحقیق شناسایی نقاطی از ژنگان در گوسفندان زل و بلوچی بود که در طی سالهای مختلف بهصورت مصنوعی یا طبیعی انتخاب شدهاند. 143 رأس گوسفند بلوچی (96 رأس) و زل (47 رأس)، با استفاده از آرایههای ژنگانیIllumina ovine SNP50K BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. برای جستجوی نشانههای انتخاب از آزمون نااُریب FST ویر و کوکرهام (تتا) در بستۀ نرمافزاری R استفاده شد. نتایج 17 منطقۀ ژنگانی روی کروموزومهای 3، 4، 5، 7، 10، 11، 12، 13، 15، 18 و X را شناسایی کرد. تجزیهوتحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنگانی با ژنهای مؤثر بر صفات گسترش نظام استخوانبندی (اسکلتی) و دم، ایمنی و یاختهشناختی (سیتولوژی) یاختهای، سوختوساز (متابولیسم) قند و انرژی و تولیدمثلی مانند ژنهای RPS6KA3، HOXB9، ESPL1، AAAS، FNDC3A همپوشانی دارند. نتایج این تحقیق و جایگاههای ژنگانی شناساییشده میتواند نقش مهمی در رابطه با بررسی تأثیر انتخاب در تمایز جمعیتی دو نژاد دنبهدار بلوچی و بدون دنبۀ زل و در پی آن شناسایی مناطق ژنگانی مرتبط با صفات متمایزکنندۀ این دو نژاد داشته باشد.
کلیدواژههای فارسی مقاله
عنوان انگلیسی
Detection of loci under positive selection in Iranian Baluchi and Zel sheep breeds
چکیده انگلیسی مقاله
Selective signatures in whole genome can help us to understand the mechanisms of selection and to identify the genomic regions that have been under natural or artificial selection during long years. The objective of this study was to identify the genomic regions that have been under artificial and natural selection in Baluchi and Zel sheep breeds. 143 sheep from Baluchi (N=96) and Zel breeds (N=47) have been genotyped using the Illumina ovine SNP50 BeadChip. Unbiased method of Weir and Cockerham's FST (Theta) was used to detect the selection signatures in the R package. The results revealed seventeen genomic regions on 3, 4, 5, 7, 10, 11, 12, 13, 15, 18 and X chromosomes. Bioinformatics analysis demonstrated that some of these genomic regions overlapped with reported genes included in the development of the skeletal system and tail, cytology cells, immune system, sugar and energy metabolism and reproduction traits such as RPS6KA3, HOXB9, ESPL1, AAAS, FNDC3A genes. The results of the present study and the identified genomic regions can play an important role in study of the effect of the selection on population differentiation in two Baluchi fat-tailed and Zel thin-tailed breeds and subsequently, would direct us to identify the genomic regions associated with traits differentiate these breeds.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله
زینب منظری |
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، دانشکدۀ علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه تهران (Tehran university)
حسن مهربانی یگانه | mehrabani yeganeh
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکدۀ علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه تهران (Tehran university)
اردشیر نجاتی جوارمی | nejati javaremi
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکدۀ علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه تهران (Tehran university)
محمد حسین مرادی | mohammad hossein
استادیار، دانشکدۀ کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه اراک (Arak university)
محسن قلی زاده |
استادیار، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
نشانی اینترنتی
http://ijas.ut.ac.ir/article_59794_93c54be2bda371acaec26639ed1e6167.pdf
فایل مقاله
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/954/article-954-311843.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات