این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله دانشکده پزشکی اصفهان، جلد ۳۱، شماره ۲۶۶، صفحات ۲۱۳۱-۲۱۳۸
عنوان فارسی شناسایی ایزوله‌های بالینی مایکوباکتریوم‌های غیر توبرکلوزیس شایع اصفهان با روش PCR-RFLP analysis ژن rpoB
چکیده فارسی مقاله مقدمه: مطالعه جهت تشخیص جنس مایکوباکتریوم، معیاری را برای بررسی اپیدمیولوژی و پاتوژنز این گروه از باکتری ها در نواحی جغرافیایی مختلف فراهم می کند. با توجه به شیوع عفونت های ناشی از مایکوباکتریوم در ایران و همچنین همسایگی ایران با دو کشور افغانستان و پاکستان که در زمره ی 22 کشور High burden دنیا هستند، ضرورت توجه بیش از پیش به این بیماری و ارایه ی مولکولار اپیدمیولوژی بیماری های مایکوباکتریال روشن می گردد. PCR-RFLP analysis (PRA یا Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism analysis) یک روش دقیق و ارزان می باشد که تشخیص گونه های مایکوباکتریوم را فراهم می آورد. این مطالعه با هدف تعیین پروفایل قطعات محدود شونده با استفاده از روش پیش گفته برای مشخص نمودن تایپ های شایع مایکوباکتریوم های غیر توبرکلوزیس اصفهان انجام گردید. روش ها: 34 ایزوله ی بالینی پس ازگردآوری و کشت توسط روش فنوتیپی تشخیص داده شدند. یک قطعه ی bp 360 از ژن rpoB با روش PCR (Polymerase chain reaction) تکثیر گردید و سپس محصولات PCR تحت تأثیر دو آنزیم MspI (Moraxella sp.) و HaeIII (Haemophilus aegyptius bacteria) قرار گرفتند. قطعات حاصل از هضم توسط آنزیم با استفاده از ژل متافور آگارز 4 درصد الکتروفورز شدند و مورد آنالیز قرار گرفتند. یافته ها: در بین 34 گونه NTM (Nontuberculous mycobacteria) مورد بررسی تایپ I مایکوباکتریوم فورچئیتوم با فراوانی 35/82 درصد بیشترین نمونه ی جدا شده از مجموعه ی نمونه های بالینی این منطقه بود و پس از آن، مایکوباکتریوم کانزاسی تایپ I و مایکوباکتریوم گوردونه تایپ I هر دو با 88/5 درصد و مایکوباکتریوم گوردونه ی تایپ II و مایکوباکتریوم اینتراسلولار با 94/2 درصد جدا گردیدند. نتیجه گیری: روش PRA rpoB gene به کار گرفته شده جهت تشخیص گونه های مایکوباکتریوم، نتایج معتبری را با توجه به نتایج دیگر مطالعات، در این منطقه ی جغرافیایی ارایه نمود. الگوی PRA گونه های مایکوباکتریوم کانزاسی ساب تایپ I (175/60/40/30 MspI:، 205/90 HeaIII:) و مایکوباکتریوم اویوم (105/80/40 MspI:، 270 HeaIII:) حاصل از این مطالعه با الگوی به دست آمده از بعضی مطالعات، یکسان بود؛ اما با پروفایل تعدادی دیگر همسان نبود. این روش، توانست 100 درصد ایزوله های مایکوباکتریوم غیر توبرکلوزیس را شناسایی کند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله ژن rpoB، PRA، مایکو باکتریوم غیر توبرکلوزیس
عنوان انگلیسی Identification of Non-Tuberculosis Mycobacteria Isolates by Polymerase Chain Reaction–Restriction Enzyme Analysis of 360-bp Fragment of rpoB Gene
چکیده انگلیسی مقاله Background: Diagnosis of mycobacterium genus provides a basis for investigating the epidemiology and pathogenesis of this group of bacteria. Regarding the prevalence of mycobacterial infection in Iran and because of the being neighborhood with countries among 22 high-burden countries, increasing attention to mycobacterial diseases and introducing molecular epidemiology of Mycobacteria seems to be necessary. Restriction Fragment Length Polymorphism Analysis of Polymerase Chain Reaction-Amplified Fragments (PCR-RFLP) is an inexpensive and accurate method providing diagnosis of mycobacterial species. The present study aimed to determine the common types of Mycobacteria in this geographical region by mentioned method. Methods: 34 clinical isolates were collected and cultured and identified by phenotypic methods. A 360-bp fragment of the rpoB gene was amplified by PCR and then, PCR products were digested by the two enzymes, MspI and HaeIII. Digested fragments were analyzed by using 4% metaphor agarose gel electrophoresis. Findings: Out of 34 species of nontuberculous mycobacteria (NTMs), M. fortuitum type I with the frequency of 82.35% was the most frequent type and M . gordonae type I and M. kansasii type I both with the frequency of 5.88% and M. gordonae type II and M. intracellular both with the frequency of 2.94% were the next. Conclusion: The PCR-RFLP analysis of rpoB gene used for identification of Mycobacteria provided valid results in this geographical area. In this study, M. kansasii type I (HeaIII: 90/205, MspI: 30/40/60/175) and M. avium (HeaIII: 270; MspI: 40/80/105) were identical to the patterns of some studies and different from others. This study demonstrated the high sensitivity (100%) of used PCR-RFLP analysis method for identification of Mycobacteria.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله شیما هادی فر | shima hadi فر
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه میکروب شناسی، دانشکده ی پزشکی و کمیته ی تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

شراره مقیم | sharareh moghim
استادیار، مرکز تحقیقات بیماری های عفونی و گرمسیری و گروه میکروب شناسی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

حاجیه قاسمیان صفایی | hajieh ghasemian safaei
دانشیار، گروه میکروب شناسی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

حسین فاضلی | hossein fazeli
استادیار، گروه میکروب شناسی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

فریبا فرید | fariba farid
پزشک عمومی، مرکز سل استان، معاونت درمان، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

محسن موقوفه یی | mohsen moghofeh یی
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه میکروب شناسی، دانشکده ی پزشکی و کمیته ی تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

منصور صدیقی | mansour sedighi
دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه میکروب شناسی، دانشکده ی پزشکی و کمیته ی تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

بهرام نصر اصفهانی | b nasre esfahani
دانشیار، گروه میکروب شناسی، دانشکده ی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران

نشانی اینترنتی http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/3506
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/103/article-103-318086.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده مقاله پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات