این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
تاکسونومی و بیوسیستماتیک، جلد ۵، شماره ۱۷، صفحات ۹۵-۱۰۴
عنوان فارسی بررسی مولکولی ژن luxA برای شناسایی باکتری‌های نورافشان دریای مازندران
چکیده فارسی مقاله نورتابی زیستی (بیولومینانس) واکنشی شیمیایی است که سبب نشر نور در موجودات زنده می‌گردد. باکتری‌های نورافشان، فراوان‌ترین موجودات نورافشان در طبیعت هستند. برای شناسایی این باکتری‌ها از آزمون‌های بیوشیمیایی استفاده می‌شود. بررسی مولکولی ژن luxA که توالی‌ آن در باکتری‌های نورافشان متفاوت است، می‌تواند در تشخیص این باکتری‌ها مناسب باشد. در پژوهش حاضر، نتایج تعیین جنس باکتری‌های نورافشان بر اساس آزمون‌های بیوشیمیایی و نتایج حاصل از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز با استفاده از پرایمر‌های اختصاصی luxA مقایسه شد. همچنین، نتایج توالی‌یابی ژن 16S rDNA جدایه‌های نورافشان برای تأیید نتایج، بررسی شد. نمونه‌های آب دریای مازندران از ایستگاه‌های متعدد سواحل جنوبی جمع‌آوری شد. باکتری‌های نورافشان با استفاده از محیط‌های کشت اختصاصی SWB و SWA جداسازی و ویژگی‌های مورفولوژیکی و فیزیولوژیکی آنها تعیین گردید. پس از گروه‌بندی جنس‌های مختلف باکتری‌های نورافشان بر اساس توالی ژن luxA، پرایمرهای اختصاصی طراحی و سنتز شد. با استخراج نوکلئیک‌اسید باکتری‌ها، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ژن‌های luxA و 16S rDNA انجام شد. پس از تعیین توالی ژن 16S rDNA جدایه‌های باکتری، درخت فیلوژنی نیز رسم شد. تعداد 9 جدایه‌ باکتریایی نورافشان از آب دریای مازندران جداسازی شد. بر اساس نتایج آزمون‌های بیوشیمیایی، تعداد پنج جدایه به جنس Photobacterium و چهار جدایه به جنس Vibrio متعلق بود. همچنین، واکنش زنجیره‌ای پلیمراز ژن luxA جنس‌های Aliivibrio، Photobacterium و Vibrio به ترتیب با پرایمر‌های اختصاصی luxA1، luxA2 و luxA3 انجام شد. نتایج توالی‌یابی ژن 16S rDNA جنس Photobacterium، نشان‌دهنده شباهت بیش از 99 درصد این جدایه‌ها به گونه‌ P. leiognathi بود. نتایج تعیین جنس بر اساس آزمون‌های بیوشیمیایی و بررسی مولکولی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز با پرایمر‌های اختصاصی luxA و نیز نتایج حاصل از توالی‌یابی ژن 16S rDNA، با یکدیگر مطابقت داشت. بنابراین، پرایمر‌های اختصاصی ژن luxA می‌تواند برای تعیین اولیه جنس باکتری‌های نورافشان به کار رود.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله باکتری‌های نورافشان، نورتابی زیستی، دریای مازندران، luxA،
عنوان انگلیسی Molecular investigation of luxA gene to identify luminescent bacteria in Caspian sea
چکیده انگلیسی مقاله Bioluminescence is a chemical reaction that causes light emission in the living organisms. Luminous bacteria are the most abundant bioluminescent organisms in natural environments. Biochemical tests are used for identification of luminous bacteria. However, molecular characterization of luxA gene could be suitable for investigation of luminescent bacteria due to differences in the sequences. In this study, the results of identification of luminescent bacteria were compared to the results of biochemical tests and PCR amplification of luxA using designed specific primers. In addition, thr results were confirmed by sequencing of 16S rDNA gene in the isolated luminescent bacteria. Samples of sea water were collected from several locations of southern shores of the Caspian sea. Luminous bacteria were isolated using specific cultures SWB and SWA. Then, morphological and physiological characterization of the isolates was identified. Specific primers for amplification of luxA were designed and synthesized after classification of luminescent bacteria according to the sequence of luxA. Polymerase chain reaction for luxA and 16S rDNA genes was performed after nucleic acid extraction of bacteria. Sequencing of 16S rDNA gene was obtained and then phylogenetic tree was constructed. Nine strains of luminescent bacteria were isolated from the Caspian sea. According to the results of biochemical tests, 5 strains belonged to the Photobacterium genus and 4 strains belonged to the Vibrio genus. Also, luxA PCR amplification of Aliivibrio, Photobacterium and Vibrio was done in order to specify primers luxA1, luxA2 and luxA3, respectively. In addition, BLAST subroutine of the 16S rDNA sequences revealed that the isolates were most similar to Photobacterium leiognathi with 99% homology. Results of isolates determination are according to the biochemical tests, molecular investigation of PCR luxA using specific primer and 16S rDNA analyses was correspondent. Therefore, the specific primer of luxA could be used for preliminary determination of luminescent bacteria.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Luminous bacteria, Bioluminescence, Caspian Sea, luxA
نویسندگان مقاله مجتبی محسنی |


محدثه صالح قمری |


نشانی اینترنتی http://tbj.ui.ac.ir/article_17497_d9075096df24f73e7522f77a4330ed83.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/681/article-681-336196.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات