زرینگیاه (.Dracocephalum kotschyi Boiss)، گیاه دارویی چندساله، بومی ایران و در فهرست گیاهان درحال انقراض است که بهدلیل داشتن متابولیتهای ثانویه ارزشمند بسیار حائز اهمیت است. بهدلیل کمیاب بودن گونه وحشی این گیاه در طبیعت و برداشت بیرویه آن، نیاز است یک رویکرد جایگزین برای تولید ترکیبات باارزش این گیاه بهکار گرفته شود. با توجه به اهمیت دارویی زرینگیاه، پژوهش حاضر با هدف دستیابی به ریشههای مویین (تغییریافته ژنتیکی) با غربالگری بهترین سویه باکتری Rhizobium rhizogenes (شامل ATCC 15834، A4 و MSU440) و ریزنمونه (برگ، گره و میانگره)، بهینهسازی القای ریشه تغییریافته ژنتیکی این گیاه با استفاده از روششناسی سطح پاسخ با بهرهگیری از مقادیر بهینه از چهار عاملِ غلظت ال-آرژنین، استوسیرینگون، ساکارز و نوع محیطکشت و در نهایت انتخاب بهترین لاین ریشه تغییریافته ژنتیکی با Ri-پلاسمید انجام شد. براساس نتایج ما سویه MSU440 و ریزنمونه برگ بالاترین میانگین میزان القای ریشه را نشان دادند (بهترتیب 62 % و 52 %). نتایج بهینهسازی فراوانی القای ریشه بهترتیب، میزان اسیدآمینه ال-آرژنین، استوسیرینگون و ساکارز را در حدود mM 1 – 5/0، µM 110 -85 و g/L 15-20 نشان داد. همچنین با بررسی سرعت رشد لاینهای ریشه با ماهیت تراریخته مربوط به لاین بهدست آمده از سویه MSU440 رشد یافته در محیط MS جامد انتخاب شد.