انار (Punica granatum L.) یکی از قدیمیترین میوههای خوراکی است که دارای ارزش غذایی و خواص دارویی بالایی میباشد. مرکز پیدایش انار آسیای میانه، به ویژه بخشهای از ایران، افغانستان و هند میباشد که از آنجا به دیگر نقاط جهان گسترش یافته است که نشان دهنده تنوع ژنتیکی گسترده و دامنه سازگاری بالای آن جهت کشت در شرایط اقلیمی مختلف است. بهمنظور بررسی روابط ژنتیکی موجود بین و درون جمعیتهای ارقام انار از کشورهای ایران، افغانستان، ترکمنستان، سوریه، لبنان، هند، یمن و ایالت متحده آمریکا واقع در دو قاره آسیا و آمریکا از آغازگرSSR استفاده شد. در این مطالعه، شش آغازگر ریز ماهوارهای، 24 آلل چند شکل تولید کردند. برای هر مکان ژنی تعداد آللها از 3 تا 5 آلل با میانگین 4 آلل متغیر بود. محتوی اطلاعات چند شکلی مربوط به مکانهای ژنی 28/0 تا 46/0 با میانگین 38/0 ارزیابی شد. نتایج شاخص تنوع نی، تجزیه و تحلیل هماهنگ اصلی و تجزیه واریانس مولکولی، حاکی از وجود تنوع در داخل ژنوتیپهای هر جمعیت بود. در بین ژنوتیپهای مورد مطالعه، ارقام ایرانی دارای تنوع ژنتیکی بالاتری نسبت به سایر جمعیتها بودند. براساس نتایج تجزیه خوشهای مشخص شد که تنوع جغرافیایی ژنوتیپها تا حدودی از تنوع ژنتیکی تبعیت میکند. براساس پژوهش حاضر آغازگر SSR توانست اطلاعات سودمندی را در ارتباط با روابط ژنتیکی ژنوتیپهای انار با منشاء مختلف ارائه دهد که میتواند در برنامههای به نژادی انار مانند برنامههای گزینش و هیبریداسیون جهت تهیه ارقام هیبرید و یا ترسیم نقشههای لینکاژی و همچنین توالییابی باندهای اختصاصی و مدیریت کلکسیونهای انار مفید واقع شود.