این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
جمعه 28 آذر 1404
توسعه آبزی پروری
، جلد ۱۹، شماره ۲، صفحات ۰-۰
عنوان فارسی
ساختار ژنتیکی ماهی سفید (Rutilus frissi, Nordmann, ۱۸۴۰) در حوضه جنوبی دریای خزر (استان گیلان) با استفاده از توالی یابی DNA میتوکندریایی
چکیده فارسی مقاله
بهمنظور بررسی امکان تمایز ژنتیکی و مقایسه ساختار ژنتیک جمعیت ماهی سفید با استفاده از روشهای تعیین توالی
DNA
(
DNA sequencing
)
، تعداد ده عدد ماهی سفید از مناطق شرقی، مرکزی و غربی دریای خزر (سواحل استان گیلان) صید گردید.
DNA
سه نمونه ماهیان از هر منطقه با استفاده از روش استات آمونیوم استخراج شد و کمیت و کیفیت آنها با استفاده از ژل آگارز 1 درصد و دستگاه نانودراپ (مدل
ND1000
) تعیین گردید. دو جفت پرایمر (
Forward
و
Reverse
) ژن
16SrRNA
با استفاده از نرم افزار
GeneRuner
طراحی و سنتز شد. جهت تعیین توالی ژن
16SrRNA
، پس از استخراج
DNA
و
PCR
، محصول
PCR
بر روی ژل آگارز 1 درصد رانده شد و باندهایی در محدوده 500
–
600 جفت باز برای ژن
16SrRNA
تولید نمود. اختلاف تکاملی، درجه خویشاوندی و روابط فیلوژنی با استفاده از نرم افزار
MEGA11
بهدست آمد. نتایج حاصله نشان داد که نمونههای ماهی سفید در سه منطقه صید شده دارای 95-97 درصد شباهت بوده و 5-3 درصد با یکدیگر اختلاف تکاملی دارند. درخت فیلوژنی نمونههای ماهی سفید با استفاده از روش
Neighbor
-
Joining
ترسیم گردید و نشان داد که نمونههای مناطق غربی و شرقی هر کدام بر روی یک کلاستر مجزا قرار دارند که این میتواند نشانه تمایز جمعیتها بر اساس ژن
16SrRNA
باشد. با
توجه
به
تخریب
رودخانههای محل
مهاجرت،
آلودگی
دریای
خزر
و
عدم
وجود
موانع فیزیکی
در
این
پهنه
آبی،
ماهی
سفید
در
این
دو
منطقه هنوز
از
تنوع
ژنتیکی
برخوردار
میباشد.
بنابراین حفظ ساختار
ژنتیکی
جمعیتهای
ماهی
سفید
مناطق مرکزی، شرقی و غربی در نوار ساحلی استان گیلان
دارای
اهمیت
اساسی میباشد.
کلیدواژههای فارسی مقاله
ساختار ژنتیکی، ماهی سفید، دریای خزر، DNA میتوکندری.
عنوان انگلیسی
Investigation of genetic structure of Caspian kutum (Rutilus frissi) stocks on the southern basin of the Caspian Sea (Guilan province) by mtDNA sequencing
چکیده انگلیسی مقاله
Introduction:
In order to investigate the possibility of genetic differentiation and to compare the genetic structure of Kutum population using DNA sequencing methods, ten Kutum
s
from the eastern, middle and western regions of the Caspian Sea (coasts of Gilan province) were sampled from the mentioned areas.
Materials and methods:
DNA of three samples of each area and species was extracted using ammonium acetate method, their quantity and quality were determined using 1% agarose gel and Nanodrop device (ND1000), respectively. One pair of primers (Forward and Reverse) of 16SrRNA gene were designed and synthesized using GeneRuner software. In order to determine the sequence of the 16SrRNA gene, Kutum DNA were amplified by PCR. Then, PCR product was runned on 1% agarose gel and bands have been produced in the range of 500-600 bp.
Results and Discussion:
Evolutionary difference (Maximum Likelihood), neighbor-joining and phylogeny relationships were obtained using MEGA11 software. The results show that the samples of Kutum in three areas have 97% similarity and 3- 5% evolutionary differences with each other. The phylogeny tree of Kutum samples was drawn using Neighbor-Joining methods.
In order to compare of phylogeny relationships of Kutum from three areas using Neighbor-Joining method, each western and eastern samples were placed in a separated cluster, which it could be a sign of population differences according to 16SrRNA gene. Due to the destruction of the rivers where they migrate, the pollution of the Caspian Sea and the lack of physical barriers in it, the kutum in these two regions still has genetic diversity.
Conclusion:
So preserving the genetic structure of the kutum populations in the central, eastern and western regions on the coasts of Gilan province is important and essential.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
Genetic structure, Kutum, Golden grey mullet, Caspian Sea, mtDNA.
نویسندگان مقاله
محمد حسن زاده صابر1 | Mohammad Hassanzadeh Saber
1-International Sturgeon Research Institute (ISRI), Iranian Fisheries Science Institute (IFSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Rasht, Iran
امید جعفری1 | Omid Jafari
شیرین جمشیدی1 | Shirin Jamshidi
محمود محسنی1 | Mahmoud Mohseni
کیوان عباسی رنجبر | keywan Abbasi Ranjbar
Inland Waters Aquaculture Research Center, Iranian Fisheries Science Research Institute (IFSRI), Agriculture Research Education and Extension Organization (AREEO), Bandar-e Anzali, Iran.
پژوهشکده آبزی پروری آبهای داخلی، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج جهاد کشاورزی، بندر انزلی، ایران
سیامک باقری | Siamak Bagheri
Inland Waters Aquaculture Research Center, Iranian Fisheries Science Research Institute (IFSRI), Agriculture Research Education and Extension Organization (AREEO), Bandar-e Anzali, Iran.
پژوهشکده آبزی پروری آبهای داخلی، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج جهاد کشاورزی، بندر انزلی، ایران
اسماعیل عبداله زاده1 | Esmail Abdolahzadeh
مریم فروزد | Maryam Forouzad
Iranian Fisheries Science Research Institute (IFSRI), Agriculture Research Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran.
موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج جهاد کشاورزی، رشت، ایران
نشانی اینترنتی
http://aqudev.liau.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-369-5&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله
فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
تخصصی
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات