این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
پژوهش های تولیدات دامی، جلد ۱۶، شماره ۳، صفحات ۰-۰
عنوان فارسی بررسی ارتباط چندشکلی در ژنهای PDK۴ و THRSP با صفات مرتبط با رشد در یک لاین تجاری مرغ گوشتی
چکیده فارسی مقاله
مقدمه و هدف: نرخ رشد جزو صفات مهم اقتصادی به شمار می­رود که با پتانسیل ژنتیکی پرنده و تحت تاثیر عوامل غیرژنتیکی تغییر می­کند. شناخت بهتر ژنوم مرغ می‌تواند به بهبود ژنتیکی راندمان تولید گوشت و تخم مرغ کمک کند. سندرم آسیت، یک بیماری متابولیکی-ژنتیکی است که وقوع آن با برخی عوامل ژنتیکی و غیرژنتیکی، از جمله تغذیه و شرایط پرورش در ارتباط است و اغلب در جوجه­های گوشتی مشاهده می­‌شود. در تحقیق حاضر، ارتباط چندشکلی در دو ژن کاندید مؤثر بر سندروم آسیت (THRSP و PDK4) با صفات نرخ رشد و وزن بدن مورد بررسی قرار گرفت.
مواد و روش­ها: برای شناسایی SNPها در دو ژن مذکور، از داده­های RNA-seq استفاده شد و با آنالیزهای بیوانفورماتیکی، نشانگرهای RFLP مربوطه شناسایی شد. برای مطالعه ارتباط ارتباط سنجی از 114 قطعه جوجه متعلق به چهار گروه نر سالم (44 قطعه)، نر بیمار (11 قطعه)، ماده سالم (55 قطعه) و ماده بیمار (4 قطعه) استفاده شد. یک نشانگر RFLP مناسب در ژن PDK4 و یکی دیگر در ژن THRSP انتخاب شد و ارتباط ژنوتیپ­های مختلف موجود در آنها با صفات مزبور بررسی شد.
یافته­ها: در جایگاه PDK4، فراوانی ژنوتیپ‌های CC، TC و TT به ترتیب برابر 105/0، 658/0 و 237/0 بود. در جایگاه THRSP نیز فراوانی ژنوتیپ‌های AA، AG وGG به ترتیب برابر 185/0، 5/0 و 315/0 بود. پرندگان مربوط به ژنوتیپ­های مختلف از نظر رشد تفاوت معنی­داری با یکدیگر نشان ندادند. همان­طور که ذکر شد، ژن­های مورد بررسی جزو ژن­های موثر بر بروز آسیت بودند و هدف از بررسی آنها این بود که مشخص گردد آیا ژن­های مرتبط با سندروم آسیت با صفات مرتبط با رشد نیز مرتبط هستند یا خیر. نتایج نشان داد که چند شکلی در دو ژن PDH4 و THRSP با صفات مرتبط با رشد ارتباط معنی‌داری ندارد (05/0<P).
نتیجه­ گیری: به نظر می­رسد آلل­ هایی که در ژن­های مرتبط با رشد باعث رشد سریع­تر پرنده می­شوند، همان آلل­های مستعد کننده پرنده برای وقوع سندروم آسیت نمی­باشند. به عبارت دیگر، یافته­های تحقیق حاضر ارتباط ژنتیکی مستقیم بین رشد پرنده با وقوع سندروم آسیت را تائید نمی­کند. با اینکه ارتباط ژنتیکی مستقیم بین سندرم آسیت و صفات رشد در مطالعه حاضر مشاهده نشد، مطالعه ژن­های دیگر با استفاده از نشانگرهای SNP یا RFLP قابل توصیه است
کلیدواژه‌های فارسی مقاله فراوانی ژنوتیپی، صفات مرتبط با رشد، SNP، RNA-seq.
عنوان انگلیسی Association of polymorphisms in PDK4 and THRSP genes with growth related traits in a commercial broiler line
چکیده انگلیسی مقاله
Introduction and Objective: Growth rate is one of the most important economic traits in the broiler chickens. Growth rate could be modified with the influences of both genetic and non-genetics factors. Better understanding of the domestic chicken genome may help the genetic improvement of chicken to be accelerated for both meat and egg yield traits. Ascites, a metabolic-genetic disorder in the meat-type chickens, is associated with the chicken own susceptibility as well as with the environmental triggers including rich nutrition and bad rearing conditions. In the current research, the association of polymorphisms in two ascites-related genes (i.e., PDK4 and THRSP) with the body weight and growth-related traits was investigated.
Material and Methods: The RNA-seq data was used to discovery of the SNPs within the THRSP and PDK4 genes. After detecting the variants and identifying their corresponding RFLP markers using bioinformatics analysis, two suitable RFLP markers (each on one of the mentioned genes) were selected for the wet-lab analysis. Then, the growth differences among the different genotypes were monitored. The growth patterns of 114 chickens (consisting of 44 healthy males, 11 ascitic males, 55 healthy females, and 4 ascitic females) were analyzed using the ScaI restriction enzyme.
Results: Genotyping of the two mentioned genes showed that at PDK4 locus, the frequencies of CC, TC and TT genotypes were 0.105, 0.658 and 0.237, respectively. In the THRSP locus, the frequencies of AA, AG and GG genotypes were 0.185, 0.5 and 0.315, respectively. The growth rate and body weight least square means of the chickens of the three genotypes were significantly different neither for THRSP nor for PDK4 gene (p>0.05).
Conclusion: The observed genotypes did not show any significant differences in term of growth patterns. Since the studied genes are among the important genes affecting the incidence of ascites, investigating their combined effect on the growth-related traits was the main goal of the current work study. Therefore, the lack of association between the different genotypes of the PDK4 and THRSP genes with the growth-related traits emphasizes to the fact that there is no actually direct genetic relationship between the rapid growth rate and susceptibility of chickens to ascites. However, further assessment on the other variants harboring the studied genes may be needed to elucidate the inherent, if any, genetic association of the mentioned genes with the growth related traits.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Genotypic frequency, Growth, SNP, RNA-seq.
نویسندگان مقاله کریم حسنپور | karim hasanpur
Tabriz university
دانشگاه تبریز

رامین نعمت زاده | ramin nematzadeh
Tabriz university
دانشگاه تبریز

صادق علیجانی | sadegh alijani
Tabriz university
دانشگاه تبریز

شایان زرگریان | shayan zargarian
Tabriz university
دانشگاه تبریز

آرش جوانمرد | Arash Javanmard
Tabriz university
دانشگاه تبریز

نشانی اینترنتی http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1820-1&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده ژنتیک و اصلاح نژاد طیور
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات