این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری، جلد ۱۳، شماره ۴، صفحات ۰-۰
عنوان فارسی شناسایی ژن‌ها و فرایندهای کلیدی آلزایمر با تحلیل مبتنی بر شبکه‌ی ترنسکریپتوم هیپوکامپ
چکیده فارسی مقاله زمینه و هدف: بیماری آلزایمر، شایع‎ترین بیماری زوال عصبی می‌باشد و اختلال در حافظه، بارزترین ویژگی آن است. ناحیه هیپوکامپ مغز، اولین ناحیه‌ای است که در آلزایمر دچار تغییرات می‌شود. ابزارهای زیست‌شناسی سامانه‌ها از جمله تکنیک‌های توان بالا ما را قادر می‌سازند تا ژن‌های برجسته‌ی دخیل در آغاز و پیشرفت بیماری را جستجو کنیم که می‌توانند بعنوان نامزدهای جدید تشخیصی و درمانی بیماری‌های پیچیده مانند آلزایمر درنظر گرفته شوند.
روش بررسی: در مجموع 85 نمونه‌ی‌ بدست‌آمده از ناحیه هیپوکامپ مغز افراد سالم و مبتلا به آلزایمر از دو مجموعه داده انتخاب شد. آنالیز تفاوت بیان بصورت جداگانه برای هر دو مجموعه داده انجام و نتایج بدست‌آمده با یکدیگر ادغام شد. ژن‌هایی که بطور مشترک در دو مجموعه داده الگوی بیانی یکسان داشتند، جهت ساخت یک شبکه ژنی با استفاده از پایگاه داده STRING، مورد استفاده قرار گرفتند. آنالیز شبکه بدست‌آمده، به‌منظور یافتن ژن‌های کلیدی دخیل در بیماری انجام گرفت.
یافته‌ها: در این مطالعه، 73 ژن دارای الگوی بیانی یکسان در دو مجموعه داده یافت شد. با آنالیز شبکه بدست‌آمده، 4 ژن SNAP25، UNC13A، SYN2 و AMPH بعنوان ژن‌های کلیدی دخیل در آلزایمر گزارش شد.
نتیجه‌گیری: نقش ژن‌های گزارش‌شده در فرآیندهای اندوسیتوز، رهاسازی انتقال‌دهنده‌های عصبی و چرخه‌ی وزیکول سیناپسی، کارکرد صحیح حافظه را میسر می‌سازد و تغییرات بیانی و جهش در هرکدام از این ژن‌ها، مسیرهای دیگر را تحت‌ تاثیر قرار داده و موجب بروز آلزایمر می‌گردد. بنابراین ژن‌های کلیدی معرفی‌شده در این مطالعه، می‌توانند بعنوان مارکرهای بالقوه جهت توسعه‌ی روش‌های تشخیصی و درمانی آلزایمر مورد توجه قرار گیرند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله آلزایمر،تکنیک‌های توان بالا،پروفایل بیان ژن،آنالیز ترنسکریپتوم،شبکه ژنی،
عنوان انگلیسی Exploring signature genes and pathways in Alzheimer’s disease by network based analysis of Hippocampus transcriptome data
چکیده انگلیسی مقاله Background and Objectives: Alzheimer’s disease is the most common neurodegenerative disease and the memory impairment is the main prominent symptom of this disease. The hippocampus of the brain, is the first region that undergoes changes in Alzheimer’s. Systems biology tools such as high-throughput techniques, enable us to explore signature genes involved in disease initiation and advancement which can be considered as new therapeutic and diagnostic candidates in complex diseases like Alzheimer’s.
Methods: A total of 85 samples obtained from the hippocampus of the brain of healthy individuals and individuals with Alzheimer’s were selected from two datasets. Differential expression analysis was performed independently for both datasets and the results were integrated. Genes with the same expression pattern in the two datasets were used to construct a gene-gene network using the STRING database. The obtained network analysis was performed to detect key genes associated with the disease.
Results: In this study, 73 genes with the same expression pattern were found in the two datasets. The obtained network analysis led to the identification of SNAP25, UNC13A, SYN2 and AMPH as key genes connected with Alzheimer’s disease.
Conclusion: The role of the reported key genes in endocytosis, neurotransmitters release and synaptic vesicle cycle facilitate proper functioning of memory. Expressional changes and mutations in each of these genes effect other pathways and lead to Alzheimer’s. Thus, the key genes reported in this study, can be considered as potential markers in developing diagnostic and therapeutic methods for Alzheimer’s.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله آلزایمر,تکنیک‌های توان بالا,پروفایل بیان ژن,آنالیز ترنسکریپتوم,شبکه ژنی
نویسندگان مقاله مهدی صادقی |
دانشگاه سمنان

سجاد صفری |
دانشگاه سمنان

نشانی اینترنتی https://biot.modares.ac.ir/article_22667_77804e219ae71c9f5666bd457808e0ce.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات