این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری، جلد ۱۱، شماره ۱، صفحات ۱۰۹-۱۱۸
عنوان فارسی بررسی بیوانفورماتیکی انتقال افقی ژنهای دخیل در مقاومت آنتی بیوتیکی در باکتری Escherichia coli
چکیده فارسی مقاله ، یک باکتری گرم منفی E.Coli
کلیدواژه‌های فارسی مقاله انتقال افقی ژن،بیوانفورماتیک،MIC،مقاومت انتی بیوتیکی،
عنوان انگلیسی Bioinformatic analysis of horizontal transmission of genes related to antibiotic resistance genes in Escherichia coli
چکیده انگلیسی مقاله Escherichia coli is a Gram-negative bacterium, the second most common bacteria in the intestine and the main indicator of urban water pollution, is the most common cause of urinary tract infection and also is one of the main factors in food poisoning and diarrhea. Drug resistance of this bacterium to antibiotics is a global challenge. Horizontal gene transfer (HGT) is the movement of genetic material between unicellular and other gene transfer pathways which is an important factor in the evolution of many organisms, antibiotic resistance in bacteria, gene function. Antibiotic resistance in E. coli can be transferred to another species of bacteria through HGT mechanisms. Today, Bioinformatics methods have been used to understand of gene transfer from HGT mechanism. In this study, we used bioinformatics tools such as PredictBias, ACLAME, Mobil Genetic Elements (MGEs) PAI-ID, and Alien_Hunter in order to genes analysis that related from antibiotic resistance in E. coli. Bioinformatics and MIC assays result show that from 26 to 30 genes have been identified in all safthwers. Most of genes that identified show over 50 percent of GC content. put P gene with 178, blaCMY with 62, BlaTEM with 43, and aac-6 with 66 homology in the PredictBias website identified. Also in the ACLAME website, mob (A-C) and rep (A-C) gene family are highest number of horizontal gene transfer from infection bacteria strain. Those cluster genes are the highest resistant of laboratory tests which carries resistant genes such as blaSHV and blaCHV on the blaCMY plasmid.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله انتقال افقی ژن,بیوانفورماتیک,MIC,مقاومت انتی بیوتیکی
نویسندگان مقاله سعیده قیاسوند |
گروه زیست شناسی دانشکده علوم دانشگاه ملایر

اکبر واثقی |
گروه نانوتکنولوژی تربیت مدرس

فیروزه علویان |
دانشگاه فرهنگیان

نشانی اینترنتی https://biot.modares.ac.ir/article_22558_af87f4f9a4b231d09e4663b0e1f9b7ec.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات