این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری، جلد ۹، شماره ۴، صفحات ۶۱۱-۶۱۹
عنوان فارسی کلونینگ، توالی‌یابی و شناسایی چندشکلی‌های جایگاه ژنی MHC-DAB II در ماهی فیتوفاگ
چکیده فارسی مقاله اهداف: ارزیابی و پایش مداوم تنوع ژنتیکی جمعیت‌های مختلف آبزیان پرورشی در کارگاه‌های تکثیر آبزیان یکی از ضروری‌ترین نیازمندی‌ها برای حفاظت از پویایی و پایداری صنعت آبزی‌پروری است. هدف این پژوهش، کلونینگ، توالی‌یابی و شناسایی چندشکلی‌های جایگاه ژنی MHC-DAB II در ماهی فیتوفاگ بود.
مواد و روش‌ها: در این پژوهش تجربی، چندشکلی ژن MHC class II β در 138 نمونه باله‌ماهی فیتوفاگ پرورشی در چهار کارگاه تکثیر ایران (گیلان، مازندران، گلستان، استان خوزستان) و نمونه‌های لاین وارداتی از چین مطالعه شد. با انجام واکنش زنجیره‌ای پلیمراز، ضمن تکثیر قطعه ژنی Hymo-DAB، الگوهای هاپلوتایپی مختلف نمونه‌ها با روش SSCP بررسی و توالی‌های به‌دست‌آمده با ClustalW2 در نرم‌افزار Geneious 4.8.5 هم‌ردیف و مرتب شدند و درخت فیلوژنی توالی‌ها رسم شد.
یافته‌ها: محصول واکنش PCR مربوط به جایگاه DAB ژنوم MHC کلاس II ماهی فیتوفاگ با وزن حدود 350جفت‌باز بدون باند جانبی در نمونه‌های مورد مطالعه به دست آمد که بیانگر تکثیر جایگاه ژنی 1*DAB2Hymo-DAB1*01/ در ماهی فیتوفاگ بود. بیشترین و کمترین تنوع هاپلوتایپی به‌ترتیب در جمعیت‌های خوزستان و مازندران مشاهده شد. میانگین اختلاف جایگاه‌های همسان (dS) و جایگاه‌های غیرهمسان (dN) بین آلل‌ها به‌ترتیب 0/25 و 0/30 و نسبت این دو عامل 1/2 بود. بالاترین غنای آللی در نمونه‌های وارداتی از چین (5) و کمترین غنای آللی میان نمونه‌های مازندران (3/8) مشاهده شد.
نتیجه‌گیری: تنوع هاپلوتایپی حاصله در ماهی فیتوفاگ به ژن 1*DAB2Hymo-DAB1*01/ تعلق دارد و میان گروه‌های مختلف این گونه، بیشترین تنوع هاپلوتایپی در جمعیت خوزستان و بالاترین غنای آللی مربوط به نمونه‌های وارداتی از چین است.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله چندشکلی جایگاه ژنی،SSCP،ژن MHC class II β،فیتوفاگ،
عنوان انگلیسی Cloning, Sequencing, and Detection of MHC-DAB II Gene Polymorphism in Silver Carp (Hypophthalmichthys molitrix)
چکیده انگلیسی مقاله Aims: Continuous monitoring of aquatic genetic diversity among different populations in fish hatcheries is an essential requirement to maintain the viability and sustainability of aquaculture industry. The aim of this study was cloning, sequencing, and detection of major histocompatibility complex (MHC) class II β in silver carp.
Materials and Methods: In this experimental study, the polymorphism of MHC class II β in 138 species of silver carp was studied in 4 different hatcheries of Iran (Guilan, Mazandaran, Golestan, and Khuzestan provinces) in addition to an imported group from China. By polymerase chain reaction (PCR), Hymo-DAB gene amplification was performed and the different haplotypes of the samples were analyzed by single-strand conformation polymorphism (SSCP) method and the sequences obtained with ClustalW2 were matched in Geneious 4.8.5 software and the phylogeny tree of the sequences was plotted.
Findings: The PCR reaction of the MHC-DAB II genome of the silver carp with a weight of about 350bp without side band was obtained in the samples, indicating the amplification of t Hymo-DAB1*01/DAB2*1 gene in silver carp. The highest and lowest diversity of haplotypes was observed in populations of Khuzestan and Mazandaran. The mean difference between synonymous site (dS) and nonsynonymous site (dN) of alleles was 0.25 and 0.30, respectively, with the ratio of 1.2. The highest allelic richness was observed in samples imported from China (5) and the lowest allelic richness was among Mazandaran species (3.8).
Conclusion: Haplotype diversity in silver carp belongs to Hymo-DAB1*01/DAB2*1 gene and among different groups of this species, the highest haplotype diversity is in the Khuzestan population and the highest allelic richness is related to samples imported from China.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله چندشکلی جایگاه ژنی,SSCP,ژن MHC class II β,فیتوفاگ
نویسندگان مقاله محمدرضا کلباسی |
گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی و علوم دریایی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

الهام جرفی |
پژوهشکده آبزی‌پروری جنوب کشور، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، اهواز، ایران

مجید صادقی‌زاده |
گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

سیروس امیری‌نیا |
سازمان تحقیقات و آموزش کشاورزی، معاونت پژوهشی، تهران، ایران

نشانی اینترنتی https://biot.modares.ac.ir/article_22459_c3cf9cf0770741fcb41f3e12059930e7.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات