این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست فناوری، جلد ۹، شماره ۱، صفحات ۱۳۷-۱۴۴
عنوان فارسی بررسی تنوع پروکاریوت‌های اکوسیستم شور به روش غیرقابل کشت
چکیده فارسی مقاله اهداف: میکروارگانیزم‌ها علاوه بر محیط‌های معمولی در محیط‌های افراطی هم حضور دارند. دریاچه‌های نمک با شوری در حد اشباع در سراسر جهان پراکنده‌ هستند. یکی از این محیط‌های پرشور دریاچه ارومیه است. هدف مطالعه حاضر بررسی تنوع پروکاریوت‌های اکوسیستم شور دریاچه ارومیه به روش غیرقابل کشت بود.
مواد و روش‌ها: در پژوهش تجربی حاضر از مناطق مختلف دریاچه ارومیه نمونه‌برداری شد و ماده ژنومی استخراج‌شده از نمونه آب شاخص به‌عنوان الگو برای تکثیر قطعه 16S rDNA و قطعه‌ای از ژن bop از طریق واکنش زنجیره‌ای پلیمراز مورد استفاده قرار گرفت. با روش کلونینگ هر یک از قطعات تکثیرشده که مربوط به یک سویه منفرد بودند توسط کیت T/A وکتور تکثیر یافتند. برای بررسی بیشتر تنوع زیستی هالوآرکی‌ها به‌موزات بررسی 16S rDNA، تنوع زیستی ژن bop نیز مطالعه شد.
یافته‌ها: با روش کلونینگ و توالی‌یابی شش جنس باکتری شامل آکاریوکلوریس، ادهیری‌باکتر، براکی‌باکتریوم، گلوئوکپسوپسیز، سیزری‌باکتر و باسیلوس شناسایی شدند. کتابخانه ژنی آرکی‌ها متعلق به پنج جنس شامل هالونوتیوس، هالولامینا، هالوکوادراتوم، هالومیکروآرکولا و هالورهابدوس بودند. کتابخانه کلون‌های باکتریایی نیز در چهار راسته باکتریوئیدز، سیانوباکتر، اکتینوباکتر و فرمیتیکوس قرار داشتند. ‌کلون‌های کتابخانه قطعه‌ای از ژن bop (به عنوان یک مارکر مولکولی) متعلق به چهار جنس شامل هالوروبروم، نتری‌آلبا، هالوکوادراتوم و نترینما بودند. فیلوژنی bop با فیلوژنی 16S rDNA رابطه تنگاتنگی نشان داد.
نتیجه‌گیری: با روش کلونینگ و توالی‌یابی شش جنس باکتری شامل آکاریوکلوریس، ادهیری‌باکتر، براکی‌باکتریوم، گلوئوکپسوپسیز، سیزری‌باکتر و باسیلوس شناسایی شدند. فیلوژنی bop با فیلوژنی 16S rDNA رابطه تنگاتنگی دارد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله محیط پرشور،ژن bop،متاژنوم،هالوآرکی،
عنوان انگلیسی Evaluation of Prokaryotic Diversity in Hypersaline Environment by Culture-independent Method
چکیده انگلیسی مقاله Aims: Microorganisms are present not only in common environment, but also in extreme environments. Salt lakes with near or at saturating salinity are spread all over the world. Urmia Salt Lake is one of these hypersaline environments. The present study aimed at evaluating prokaryotic diversity in hypersaline environment by culture-independent method.
Materials and Methods: In this experimental study, different regions of Urmia Lake were sampled and the genomic material extracted from the water sample was used as a pattern for the amplification of 16S rDNA and a fragment of the bop gene via polymerase chain reaction. By cloning, each of the amplified fragments belonging to a single strain was amplified by T/A cloning vector. To further investigate the biodiversity of Haloarchaea, the biodiversity of bop gene was studied in addition to studying 16S rDNA.
Findings: By cloning and sequencing, 6 bacteria genera, including Acaryochloris, Adhaeribacter, Brachybacterium, Gloeocapsopsis, Cesiribacter, and Bacillus were identified. Archaeal library belonged to 5 genera, including Halonotius, Halolamina, Haloquadratum, Halomicroarcula, and Halorhabdus. The clone libraries of bacterial belonged to 4 phyla, including Bacteroidetes, Cyanobacteria, Actinobacteria, and Firmicutes. . The clone libraries of bop gene (as a molecular marker) belonged to genera, including Halorubrum, Natrialba, Haloquadratum, and Natrinema. The bop phylogeny was closely related to the 16S rDNA phylogeny.
Conclusion: By cloning and sequencing, 6 bacteria genera, including Acaryochloris, Adhaeribacter, Brachybacterium, Gloeocapsopsis, Cesiribacter, and Bacillus were identified. The bop phylogeny is closely related to the 16S rDNA phylogeny.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله محیط پرشور,ژن bop,متاژنوم,هالوآرکی
نویسندگان مقاله فرشته جوکار کاشی |
گروه بیوتکنولوژی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، کاشان، ایران

پرویز اولیا |
مرکز تحقیقات میکروب‌شناسی ملکولی، دانشگاه شاهد، تهران ،ایران

محمدعلی آموزگار |
گروه میکروبیولوژی، دانشکده زیست‌شناسی و قطب تبارزایی موجودات زنده، دانشگاه تهران، تهران، ایران

نشانی اینترنتی https://biot.modares.ac.ir/article_22402_82f16581b12a4b3f68aec51594857552.pdf
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات