این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
علوم دامی، جلد ۳۰، شماره ۱۱۵، صفحات ۱۹۳-۲۰۵
عنوان فارسی بررسی شبکه تنظیمی مؤثر در شروع شیردهی در بافت پستان گاو شیری با استفاده از داده‌های RNA-seq
چکیده فارسی مقاله در این مطالعه به منظور درک بهتر شبکه تنظیمی درگیر درشروع شیر‌دهی در بافت پستان گاو شیری، در ابتدا ژن های با بیان بالا با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های RNA-Seq در سه حالت زیر شناسایی گردید: حالت اول) مقایسه بافت پستان گاو شیری در 35 روز قبل از زایمان با 3 روز بعد از زایمان ، حالت دوم) مقایسه بافت پستان گاو شیری در 7 روز قبل از زایمان با 3 روز بعد از زایمان، حالت سوم) مقایسه بافت پستان گاو شیری در 7 و 35 روز قبل از زایمان. به منظور بررسی گروه‌های کارکردی ژن-های معنادار با بیان بالا در سه حالت مختلف ذکر شده، از نرم-افزار DAVID استفاده شد. تنها عبارات معنادار(05/0 >P ) مربوط به مراحل بیولوژیکی در نظر گرفته شد. سپس توالی پروموتری این ژن‌ها جهت شناسایی فاکتور‌های رونویسی کاندید درگیر در این مکانسیم استخراج شد. نتایج تجزیه و تحلیل پروموتری با استفاده از نرم‌افزار Genomatix منجر به شناسایی 24 فاکتور رونویسی کاندید جدید احتمالی مؤثر در مراحل تنظیمی شروع شیر‌دهی گردید. افزون بر این، برای ترسیم شبکه‌های ژنی مرتبط با فاکتور‌های رونویسی شناسایی شده در شروع شیر‌دهی از نرم افزار STRING استفاده شد. با توجه نتایج بدست آمده از این پژوهش، 24 فاکتور رونویسی جدید شناسایی شدند که دارای پتانسیل مناسبی برای بررسی بیشتر در سطح آزمایشگاهی می-باشند و می‌توانند اطلاعات جدیدی را در درک بهتر شبکه‌ی تنظیمی مؤثر در شروع شیر‌دهی در بافت پستان گاو شیری فراهم کنند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله شبکه تنظیمی، پروموتر، فاکتورهای رونویسی، بیان ژن،
عنوان انگلیسی Study gene regulatory networks involved in Lactogenesis in dairy cow mammary tissue using RNA-Seq data
چکیده انگلیسی مقاله In this study to gain insights into transcriptional regulation Lactogenesis in mammary tissue, at the first high expression genes in lactogenesis in three different condition were identified by RNA-Seq data analysis. This three conditions including comparison of the dairy cow mammary tissue in 35 days before and 3 days after birth, dairy cow mammary tissue in 7 days before and 3 days after birth and dairy cow mammary tissue in 7 and 35 days before birth. To investigate the biological processes of significant high expression genes in three different condition mentioned above, the DAVID software was used. The only significant terms (P< 0.05) related to biological processes were considered. Then promoter regions of these genes were extracted to identify candidate transcription factors involved in this mechanisms. Assuming that changes in the transcription level of co-expressed genes may result from the coordinated action of a limited number of transcription factors, we looked for over-represented putative transcription factor binding sites in the promoters of these genes. Promoter analysis by using Genomatix software lead to identify of 24 novel transcription factors candidates activating in lactogenesis. In this study in order to visualization of regulatory networks containing transcription factors and that regulate the genes, STRING software were used. According to the results, 24 new candidates transcription factor introduced in this study has good potential for more investigation in the laboratory.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله زهره مزدوری |
دانش آموخته کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دام و طیور پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه تهران (Tehran university)

محمد قادرزاده |
دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح دام، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

نشانی اینترنتی http://asj.areo.ir/article_113275_b53f1c473937bcbfe95eb45fc26ca4d4.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/953/article-953-435264.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات