این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
فصلنامه علمی پژوهشی گیاهان دارویی، جلد ۴، شماره ۴۸، صفحات ۴۰-۵۳
عنوان فارسی مقایسه کارایی نشانگر RAPD و Modified RAPD در تعیین تنوع ژنتیکی و فیتوشیمیایی بین جمعیت‌های مختلف گیاه رازیانه (Foeniculum vulgar)
چکیده فارسی مقاله مقدمه: گیاه دارویی رازیانه (Foeniculum vulgar) متعلق به خانواده چتریان است که دارای کاربردهای فراوانی در صنایع دارویی و غذایی می‌باشد. هدف: در این مطالعه، تأثیر هضم آنزیمی محصول RAPD - PCR به منظور افزایش کارایی نشانگر RAPD در ارزیابی تنوعات ژنومی مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: پس از تکثیر DNA ژنومی 15 جمعیت رازیانه با استفاده از 9 آغازگر RAPD، بخشی از محصول PCR توسط دو آنزیم برشی MseI و EcoRI مورد هضم قرار گرفت. سپس محصول PCR هضم شده و بدون هضم، با استفاده از الکتروفورز ژل آگارز تفکیک شد. برای تعیین کارآیی نشانگرها در تفکیک ژنوتیپ‌های مورد مطالعه، از معیار میزان اطلاعات چند شکلی (PIC) و برای گروه‌بندی نمونه‌ها از تجزیه خوشه‌‌ای استفاده شد. همچنین درصد اسانس و اجزای تشکیل‌دهنده آن در جمعیت‌های فوق با استفاده از دستگاه کروماتوگرافی گازی متصل به طیف‌سنج جرمی تعیین شد. نتایج: مقایسه الگوی باندی محصول PCR هضم شده و هضم نشده نشان داد که استفاده از یک آنزیم چهاربازبر مانند MseI برای هضم قطعات حاصل از تکثیر RAPD-PCR می‌تواند تا حد قابل توجهی میزان چندشکلی را نسبت به روش RAPD استاندارد افزایش دهد. همچنین تجزیه کلاستر بر اساس داده‌های حاصل از روش RAPD تغییریافته، جمعیت‌ها را به صورت مناسب‌تری گروه‌بندی نمود. نتیجه‌گیری: به عنوان یک نتیجه کلی، هضم آنزیمی مناسب محصول PCR می‌تواند کارایی نشانگر مولکولی RAPD را تا حد قابل توجهی در بررسی تنوعات در سطح ژنوم بهبود بخشد. از سوی دیگر نتایج نشان داد که میان عملکرد اسانس و تنوع ژنتیکی موجود همبستگی وجود ندارد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله Foeniculum vulgar، اسانس، تنوع ژنتیکی، هضم آنزیمی، RAPD
عنوان انگلیسی The Improvement of RAPD-PCR Molecular Marker Efficiency in Detection of Polymorphism in Fennel (Foeniculum vulgar) Using Restriction Enzymes
چکیده انگلیسی مقاله Background: Fennel (Foeniculum vulgar) is a medicinal plant species in the Apiaceae family with culinary and medicinal uses. Objective: This study was conducted to evaluate the effects of enzymatic digestion of PCR product in improvement of the efficiency of RAPD markers. Methods: Nine RAPD primers were used to amplify the genomic DNA of fifteen accessions of Fennel. Following amplification, a part of PCR products was digested with two restriction enzymes (EcoRI and MseI). Both of digested and undigested PCR products were separated on agarose gel electrophoresis. The accessions were grouped by cluster analysis and polymorphic information content index was calculated for each marker. Also percentage and component of essential oil were indicated by GC/MS analysis. Results: The comparison of banding patterns of digested and undigested PCR products revealed that digestion of RAPD-PCR product using a four base cutter enzyme such as Mse I shows a higher level of polymorphism as compared to standard RAPD. Cluster analysis based on data obtained by modified RAPD classified accessions more suitable as compared to standard RAPD data. There was no correlation between genetic diversity and metabolic yield. Conclusion: Restriction enzymes have enormous potential to improve the efficiency of RAPD markers in evaluation of genetic diversity across genome.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله علیرضا اطمینان | a etminan
department of plant breeding, kermanshah branch, islamic azad university, kermanshah
1- دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرمانشاه، گروه اصلاح نباتات
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی کرمانشاه (Islamic azad university of kermanshah)

لیا شوشتری | l shooshtari
department of plant breeding, kermanshah branch, islamic azad university, kermanshah
1- دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرمانشاه، گروه اصلاح نباتات
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی کرمانشاه (Islamic azad university of kermanshah)

منصور قربانپور | m ghorbanpour
faculty of agriculture and natural resources, arak university
گروه گیاهان دارویی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه اراک (Arak university)

علی مهرآفرین | a mehrafarin
cultivation and development department of medicinal plants research center, institute of medicinal plants, acecr
گروه کشت و توسعه گیاهان دارویی مرکز تحقیقات گیاهان دارویی، پژوهشکده گیاهان دارویی جهاددانشگاهی
سازمان اصلی تایید شده: پژوهشکده‮ ‬گیاهان‮ ‬دارویی‮ ‬جهاد‮ ‬دانشگاهی (Institute of medicinal plants)

اردشیر قادری | a qaderi
biotechnology department of medicinal plants research center, institute of medicinal plants, acecr, karaj
کرج، گروه پژوهشی بیوتکنولوژی گیاهان دارویی، مرکز تحقیقات گیاهان دارویی، پژوهشکده گیاهان دارویی جهاددانشگاهی، صندوق پستی 1369 – 31375 تلفن 34764010 026 ، نمابر 3476021 026
سازمان اصلی تایید شده: پژوهشکده‮ ‬گیاهان‮ ‬دارویی‮ ‬جهاد‮ ‬دانشگاهی (Institute of medicinal plants)

نشانی اینترنتی http://www.jmp.ir/browse.php?a_code=A-10-75-1&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده biotechnology|
نوع مقاله منتشر شده 1
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات