این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
جمعه 5 دی 1404
زیست فناوری
، جلد ۱، شماره ۱، صفحات ۱-۱۰
عنوان فارسی
پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی با استفاده از پروفایل انرژی
چکیده فارسی مقاله
در این مقاله پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی بر پایه توالی اسید های آمینه آن ارائه خواهد شد. برای تعریف فاکتوری به منظور تشخیص میزان انعطاف پذیری از انرژی دو اسید آمینه متوالی استفاده شد. با استفاده از تحلیل های آماری برروی این انرژی، عددی بین صفر و صد به هر جفت اسید آمینه تعلق میگیرد که آنرا عدد انعطاف پذیری می نامیم. در نظر گرفتن اثرات همسایه ها تا چهار همسایه اسید آمینه باعث بهبود پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئین میگردد. برای ارزیابی پیشگویی انعطاف پذیری قطعات پروتئینی از پروتئین هایی که ساختمان آنها توسط NMR تعیین ساختار شده بود استفاده شد. عدم قطعیت در تعیین ساختار مناطقی که انعطاف پذیری بالایی دارند، مثل سر و ته زنجیره و حلقهها باعث ایجاد مدلهای مختلف ساختمانی میشود. مقایسه بین پیشگویی و پراکندگی زوایا در مدلهای مختلف همبستگی بالایی را نشان میدهد که حاکی از دقت قابل اعتماد روش پیشگویی میباشد.
کلیدواژههای فارسی مقاله
عنوان انگلیسی
Prediction of flexibility in proteins based on sequence of amino acids
چکیده انگلیسی مقاله
We present a method to predict the flexible and rigid regions based on sequence. We use the free energy of two consequent amino acids to define a factor for distinguishing flexible regions from the rigid ones. Using statistical analysis of this free energy, we assign a normalized number between zero to one hundred which we call it flexibility number. Taking the effects of up to four neighbors of an amino acid, into account, resulted in an efficient prediction of flexible and rigid regions of a protein.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله
سید شهریار عرب | seyed shahriar
نیاوران - میدان شهید باهنر - پژوهشگاه تحقیقات بنیادی ipm - پژوهشکده کامپیوتر - گروه بیوانفورماتیک
مهدی صادقی |
اتوبان تهران - کرج - پژوهشگاه ژنتیک - صندوق پستی 14155-6343
چنگیز اصلاح چی |
دانشگاه شهید بهشتی دانشکده ریاضی صندوق پستی 1983963113
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه شهید بهشتی (Shahid beheshti university)
حمید پزشک |
دانشگاه تهران، دانشکده ریاضی آمار و علوم کامپیوتر، قطب بیومت
سازمان اصلی تایید شده
: دانشگاه تهران (Tehran university)
نشانی اینترنتی
http://biot.modares.ac.ir/article_3304_9f83ef44423bf918077de5f6a6bd3ad6.pdf
فایل مقاله
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/899/article-899-501073.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات