این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
زیست شناسی گیاهی ایران، جلد ۹، شماره ۲، صفحات ۸۹-۱۰۶
عنوان فارسی بررسی میزان بیان ژن‌های خانواده CBL، در تنش خشکی و حمله ویروس در دو رقم حساس و مقاوم به خشکی گوجه‌فرنگی با روش PCR نیمه‌کمّی
چکیده فارسی مقاله کلسیم، یک جزء حیاتی مهم برای شماری از مسیر‌های انتقال پیام در گیاهان است که به واسطه انواعی از گیرنده‌های اختصاصی از جمله پروتئین‌های شبه‌کلسی‌نورین B (CBL) در درک تنش‌های محیطی، عمل می‌کند. در پژوهش حاضر، با رویکردهای بیوانفورماتیک، 11 ژن رمزکننده پروتئین‌های شبه‌کلسی‌نورین B با درجه حفاظت‌شدگی زیاد در گیاه گوجه‌فرنگی شناسایی و تأیید شد. با بهره‌گیری از یک روش مبتنی بر ارتوژنی، این پروتئین‌ها به 5 کلاس مجزای SlCBL1، SlCBL3، SlCBL4، SlCBL8 و SlCBL10 تقسیم‌بندی و نام‌گذاری شدند. تحلیل توالی‌های پروتئینی نشان داد که همه اعضای CBLهای 1 و 4 که شامل 5 پروتئین می‌شوند، یک ناحیه حفاظت‌شده مریستویلاسیون در بخش N-ترمینال دارند. بررسی با روش PCR نیمه‌کمّی نشان داد که میان CBLهای کلاس 1، بیان ژن SlCBL1-3 در هردو تنش خشکی، حمله ویروس و ترکیب این دو، تنها در رقم حساس افزایش داشته است. درباره CBLهای کلاس 3، اگرچه دو ژن SlCBL3-1 و SlCBL3-2 در تنش خشکی در هردو رقم حساس و مقاوم، افزایش بیان نشان دادند، اعمال هم‌زمان دو تنش، اثر افزایشی بر بیان این ژن‌ها نداشت. بین دو همولوگ کلاس 4 نیز، تنها SlCBL4-1 در هردو تنش خشکی و ویروس افزایش بیان نشان داد. براساس نتایج، رفتار بیانی ژن‌های کلاسSlCBL8 در شرایط مختلف تنش و ارقام مختلف، متنوع بود. بیان تنها ژن موجود در کلاس SlCBL10 نیز در رقم حساس با هیچ‌کدام از تنش‌های یاد‌شده افزایش نیافت و تنها در رقم مقاوم، در تنش خشکی افزایش بیان داشت. به‌طورکلی، استنباط شد که با تغییر الگوی بیان ژن‌های CBL در هردو تنش زیستی و غیرزیستی، احتمالاً مسیر‌های پیام‌رسانی CBL/CIPK متفاوتی در گیاهان حساس و مقاوم فعال می‌شوند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Evaluation of the CBL family gene expression under drought stress and virus attack in two susceptible and drought tolerant tomato cultivars using semi-quantitative PCR analysis
چکیده انگلیسی مقاله Eleven genes encoding Calcineurin B-Like proteins with a high degree of sequence conservation were identified using bioinformatics approaches in tomato. These proteins classified into five clusters including SlCBL1, SlCBL3, SlCBL4, SlCBL8 and SlCBL10 using orthology-based method of nomenclature. Sequence analysis showed that all five members of SlCBL1 and SlCBL4 contained a myristoylation conserved motif (MGXXXS/T) at their N-terminals. Semi-quantitative RT-PCR showed that among the SlCBL1 members, SlCBL1-3 up-regulated under both drought and virus stresses, as well as the combined treatment. Although, both SlCBL3-1 and SlCBL3-2 up-regulated under both drought and virus stresses in both susceptive and resistant cultivars, the combined stress did not have any additional effect on the expression. Among SlCBL4 members, only SlCBL4-1 up-regulated under drought or virus attack. There was a diverse pattern of expression between the two SlCBL8 members under different stresses in both cultivars. SlCBL10 showed no change in expression pattern under drought or virus stresses in susceptive cultivar and this gene showed to be up-regulated under drought in resistant cultivar. Overall, it was concluded that changes in the expression pattern of CBL genes under biotic and abiotic stresses seemingly induced various CBL/CIPK patways in suseptive or resistant plants.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله پیمان آقایی |
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی 3697-19395 تهران، ایران

محمدعلی ابراهیمی | mohammad ali
گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه پیام نور تهران (Payame noor university)

سید علی حسینی تفرشی | seyed ali
گروه سلولی و مولکولی، دانشکده شیمی، دانشگاه کاشان، صندوق پستی 53153-87317 کاشان، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه کاشان (Kashan university)

مریم حایری نسب |
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی 3697-19395 تهران، ایران

شکوفه انتشاری |
گروه زیست شناسی، دانشگاه پیام نور، صندوق پستی 3697-19395 تهران، ایران

نشانی اینترنتی http://ijpb.ui.ac.ir/article_22192_e8e8c9c1b3a691fefaa400c3be6035f4.pdf
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/898/article-898-526979.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات