این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
صفحه اصلی
درباره پایگاه
فهرست سامانه ها
الزامات سامانه ها
فهرست سازمانی
تماس با ما
JCR 2016
جستجوی مقالات
دوشنبه 24 آذر 1404
پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی
، جلد ۹، شماره ۲۳، صفحات ۱۲۵-۱۳۷
عنوان فارسی
شناسایی رونوشتهای با افزایش تظاهر در رقم برنج (Oryza sativa L.) مقاوم به تنش شوری با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP
چکیده فارسی مقاله
تنش شوری یکی از مهمترین تنشهای غیرزیستی برای برنج است که بهطور منفی رشد و باروری آن را متأثر میسازد. در این پژوهش اثرات تنش شوری بر بیان افتراقی برخی از ژنهای مسئول در تنش شوری در دو ژنوتیپ برنج متحمل و حساس به شوری (FL478 و IR29) با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP مورد بررسی قرار گرفت. از میان TDFهای (Transcript Derived Fragments یا قطعات حاصل از رونوشتها) حاصل از 2 آنزیم برشی و 18 ترکیب آغازگری که در پاسخ به تنش شوری در رقم مقاوم در مقایسه با تیمار شاهد و حساس افزایش بیان نشان داده بودند 28 TDF جدا شد که در نهایت 21 عدد از آنها کلون، توالییابی و در بانک ژن ثبت گردیدند و سپس با استفاده از الگوریتم بلاست مورد آنالیز قرار گرفتند. TDFهای شناسایی شده در این مطالعه متعلق به گروههای متفاوتی از ژنها شامل متابولیسم، ترارسانی سیگنال، فاکتورهای رونویسی، سمیتزدایی، سیستم ترانسپورت و دیگر مکانیسمهای مرتبط با تنش شوری بودند که این امر بیانگر آن است که تعداد زیادی از فرآیندها در پاسخ به تنش شوری درگیر هستند. سپس تعدادی از این ژنها برای تأئید الگوهای بیانی به دست آمده توسط cDNA-AFLP با استفاده از آنالیز Real time PCR انتخاب گردیدند که نتایج به دست آمده از این آزمایش الگوهای بیانی ردیابی شده با استفاده از تکنیک cDNA-AFLP را تأئید نمود. نتایج این تحقیق نشان داد که cDNA-AFLP تکنیک قدرتمندی برای بررسی الگوی بیان ژنهای برنج تحت تنش شوری میباشد. علاوه بر این یافتههای ما به روشن نمودن اساس مولکولی اثرات تنش شوری بر ژنوم برنج و شناسایی ژنهایی که میتوانند تحمل به شوری برنج را افزایش دهند کمک مینماید.
کلیدواژههای فارسی مقاله
تنش شوری، cDNA-AFLP ، رونوشت، بیان ژن، برنج
عنوان انگلیسی
Identification of Up-regulated Transcripts in Salt Tolerant Rice (Oryza sativa L.) Cultivar using the cDNA-AFLP Technique
چکیده انگلیسی مقاله
Salt stress is one of the main abiotic stresses for rice that causes negative effects on its growth and productivity. In present study, effects of salt stress on differential gene expression of some genes which are responsible in salt stress were investigated in two rice tolerant and sensitive genotypes (FL478 and IR29) by applying cDNA-AFLP technique. Among the TDFs (Transcript Derived Fragments (were generated by 2 restriction enzymes and 18 primer combination that displayed up-regulation expression in tolerant line with respect to the control treatment and sensitive line in response to salt stress, 28 TDF were separated and 21 of them were cloned, sequenced and submitted in gene bank and finally they were analyzed by BLAST algorithm. All known TDFs in current study were belonged to different groups of genes related to metabolism, signal transduction, transcription factors, detoxification, transport system and other mechanism related to salt stress which suggests a lot of process to be involved in salt stress responses. Some genes were further selected for validation of cDNA-AFLP expression patterns using real-time PCR. The results of real-time PCR confirmed the expression patterns that were detected using the cDNA-AFLP technique. The results of this research show that cDNA-AFLP is a powerful technique for investigating the expression pattern of rice genes under salt stress. Moreover our finding will help either elucidation the molecular basis of salt stress effects on rice rice or identification those genes that could increase the salt tolerance of rice plant.
کلیدواژههای انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله
فاطمه زارع | fatemeh zare
غلامعلی رنجبر | gholam ali ranjbar
علیرضا ترنگ | ali reza tarang
حمید نجفی زرینی | hamid najafi zarrini
نشانی اینترنتی
http://jcb.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-288&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله
اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/1462/article-1462-561112.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده
fa
موضوعات مقاله منتشر شده
اصلاح نباتات، بیومتری
نوع مقاله منتشر شده
پژوهشی
برگشت به:
صفحه اول پایگاه
|
نسخه مرتبط
|
نشریه مرتبط
|
فهرست نشریات