این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران، جلد ۲۴، شماره ۱۱۹، صفحات ۴۰-۴۷
عنوان فارسی تشخیص سریع موتاسیون در ژن عامل مقاومت به ریفابوتین در سویه های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش Allele Specific PCR
چکیده فارسی مقاله سابقه و هدف: تشخیص مولکولی مقاومت در آنتی بیوتیک‌های موثر روی سویه‌های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. در این مطالعه طراحی روشی جهت تشخیص سریع موتاسیون‌های مرتبط به مقاومت در ژن عامل مقاومت به آنتی بیوتیک ریفابوتین مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش‌ها: 40 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شامل 12 سویه مقاوم به ریفابوتین و28سویه حساس به این آنتی‌بیوتیک مورد استفاده قرار گرفتند که نمونه‌ها از بانک میکروبی مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان دانشگاه علوم پزشکی اراک اخذ شد. پرایمرهای اختصاصی با کمک نرم افزارهای BLAST، IDT و MEGA طراحی و تصحیح شدند. پرایمرهای طراحی شده جهت واکنش Allele Specific PCR از ´3 قابلیت اتصال به نوکلئوتیدهای موتانت در کدون‌های 516-526-531 ژن rpoB را داشته و قابلیت شناسایی حالت موتانت را داشتند، لذا عدم تشکیل باند در محصول PCR به معنی مقاوم بودن سویه به ریفابوتین بود. قطعه مورد نظر در تعدادی از نمونه‌ها تعیین ترادف شده و با نتایج به‌دست آمده مقایسه گردید. یافته‌ها: از 12 سویه مقاوم به ریفابوتین مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با کمک روش Allele Specific PCR مورد مطالعه،10 سویه به عنوان سویه‌های موتانت در یکی از 3کدون اصلی تشخیص داده شدند. سویه‌های حساس نیز فاقد موتاسیون در این کدون‌ها بودند. حساسیت روش معادل80 درصد با 95% CI:0.55-0.95 و ویژگی آن معادل 100 درصد با 95% CI:0/87-1 محاسبه گردید. نتایج تعیین ترادف (سکوئنس) مؤید نتایج به دست آمده بود. استنتاج: نتایج مطالعه حاضر نشان می‌دهد که Allele Specific PCR روشی ساده و سریع برای تشخیص سریع مقاومت به ریفابوتین در سویه‌های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بوده و جهت استفاده روتین پیشنهاد می‌شود.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله ریفابوتین- مایکوباکتریوم توبرکلوزیس- Allele Specific PCR
عنوان انگلیسی Rapid Detection of Mutation in Gene Resistant to Rifabutin in Mycobacterium tuberculosis Isolates Using Allele Specific-PCR
چکیده انگلیسی مقاله Background and purpose: Molecular detection of antibiotic resistance in clinical strains of M.tuberculosis is of great importance. In this study, we developed a method for rapid detection of mutations resistant to the rifabutin antibiotic resistant gene. Material and methods: In this study 40 clinical isolates of M.tuberculosis including 12 resistant and 28 susceptible isolates to rifabutin were used. The isolates were obtained from Tuberculosis and Pediatric Infectious Research Center affiliated to Arak University of Medical Sciences. Specific primers were designed and corrected by BLAST-IDT and MEGA software. The primers for an Allele Specific PCR was able to detect the desired hot point in the gene from 3´end in 516-526-531 codons and could also reconnoiter mutant state Therefore, lack of formation of band in PCR product indicates the resistance of strain to rifabutin. Some selected samples were sequenced and compared with results derived from ASP. Results: 12 M.tuberculosis isolates resistant to rifabutin, mutations in one of the three main codons were detected in 10 strains using Allele Specific PCR method. Susceptible strains did not show any mutations in these codons. The sensitivity of the method was 80% (95% CI: 0.55-0.95) and the specificity was 100% (95% CI:0.87-1). Results of sequencing were concordant with results of ASP method. Conclusion: The results showed that Allele Specific-PCR was a rapid and simple method for fast detection of rifabutin resistance in M.tuberculosis isolates and is recommended for routine works.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Rifabutin, Mycobacterium tuberculosis, Allele Specific PCR
نویسندگان مقاله نوید مسببی | navid mosabebi
msc in microbiology, faculty of basic sciences, qom branch, islamic azad university, qom, iran
علوم پزشکی مازندران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی مازندران (Mazandaran university of medical sciences)

مریم صدرنیا | maryam sadrnia
assistant professor, department of biology, payame noor university, tehran, iran
تهران تهران دانشگاه پیام نور، گروه زیست شناسی، کد پستی 4697-19395
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه پیام نور تهران (Payame noor university)

محمد رضا ذوالفقاری | mohammad reza zolfaghari
assistant professor, department of microbiology, faculty of basic sciences, qom branch, islamic azad university , qom, iran
علوم پزشکی مازندران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه علوم پزشکی مازندران (Mazandaran university of medical sciences)

نشانی اینترنتی http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3397-52&slc_lang=fa&sid=fa
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده میکروبیولوژی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی-کامل
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات