این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
ارمغان دانش، جلد ۱۸، شماره ۹، صفحات ۷۲۳-۷۳۵
عنوان فارسی تشخیص سریع باکتری سودوموناس آئروژینوزا به روش PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن LasI سیستم کروم سنسینگ باکتری
چکیده فارسی مقاله چکیده زمینه و هدف: سودوموناس آئروژینوزا یک باکتری پاتوژن فرصت طلب بیمارستانی است که به علت دارا بودن مقاومت ذاتی و اکتسابی به آنتی‌بیوتیک‌های معمول مرگ و میر ناشی از عفونت‌های آن بسیار شایع می‌باشد لذا شناسایی سریع و دقیق باکتری می تواند در کنترل عفونت و کاهش مرگ و میر موثر باشد. هدف این مطالعه، ارزیابی استفاده از روشی سریع با اختصاصیت و حساسیت بالا بر پایه واکنش زنجیره پلی‌مراز و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن LasI سیستم کروم سنسینگ باکتری جهت شناسایی آن بود. روش بررسی: در این مطالعه تجربی که به روش مقایسه ای بین نتایج حاصل از تشخیص به روش کشت و PCR برای باکتری سودوموناس آئروژینوزا موجود در نمونه بالینی و چهار گونه باکتریایی دیگر انجام گرفت، ابتدا 40 سویه سودوموناس آئروژینوزا از نمونه‌های بالینی جدا شده و به وسیله تست‌های بیوشیمیایی شناسایی و تأیید شدند. یک جفت پرایمر اختصاصی ژن LasI از طریق روش آنالیز بیوانفورماتیک طراحی گردید. پس از استخراج ژنوم باکتری، توالی این ژن با استفاده از تکنیک PCR تکثیر یافت. اختصاصیت آزمون PCR با ژنوم چهار گونه مختلف استافیلوکوکوس اورئوس، کلبسیلا پونومونیه، اشیریشیاکلی و ویبریوکلرا مورد ارزیابی قرار گرفت. از رقت های مختلف ژنوم باکتری سودوموناس آئروژینوزا در آزمون PCR نیز جهت بررسی حساسیت پرایمر طراحی شده استفاده شد. داده‌ها با آزمون آماری تی تجزیه و تحلیل شدند. یافته‌ها: برای تمامی‌سویه های سودوموناس آئروژینوزا جدا شده، آزمون PCR دارای نتیجه مثبت بود. هم‌چنین تا غلظت 5-10 از ژنوم باکتری سودوموناس آئروجینوزا نتیجه آزمون PCR مثبت بود. برای ژنوم چهار باکتری دیگر نیز نتایج آزمون PCR منفی بود. نتیجه گیری: این مطالعه نشان داد که پرایمرهای طراحی شده جهت شناسایی باکتری سودوموناس آئروژینوزا با استفاده از PCR در مقایسه با روش های قبلی شناسایی مبتنی بر این روش از اختصاصیت و حساسیت بیشتری برخوردار می‌باشد. واژه‌های کلیدی: سودوموناس آئروژینوزا، PCR، کروم سنسینگ، LasI
کلیدواژه‌های فارسی مقاله واژه‌های کلیدی، سودوموناس آئروژینوزا، PCR، کروم سنسینگ، LasI
عنوان انگلیسی Rapid Detection of Pseudomonas Aeruginosa by PCR Method Using Specific Primers of Quorum Sensing LasI gene
چکیده انگلیسی مقاله Abstract Background & aim: Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic nosocomial pathogen that due to having intrinsic and acquired resistance to common antibiotics, mortality due to infections is very common. Therefore, early and accurate identification of bacteria could be effective in controlling infections and deaths. The aim of this study was to evaluate the use of a rapid method with high sensitivity and specificity based on polymerase chain reaction using gene-specific primers quorum sensing LasI system for detection of bacteria. Methods: In this study, the comparison between the results of culture and PCR for the diagnosis of Pseudomonas aeruginosa in clinical samples and other bacterial species were carried out. 40 strains of Pseudomonas aeruginosa from isolated clinical specimens were identified and confirmed by biochemical tests. LasI gene specific primers were designed using bioinformatics analysis. Sequence of this gene was amplified techniques after extraction of bacterial genome. The specificity of PCR tests with DNA from of different species, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumonia, Escherichia coli and Vibrio cholerae were evaluated. A different dilution of the bacterial genome of Pseudomonas aeruginosa was used in PCR to evaluate the sensitivity of primer. Data were analyzed by t-test Results: The results indicated that the PCR test result was positive for all strains of P. aeruginosa isolates however, PCR test results were negative for the four other bacteria. Even at 10-5 Pseudomonas aeruginosa genome concentration, PCR test was positive for all isolated strains Conclusion: This study showed that the primers designed for detection of Pseudomonas aeruginosa using PCR, had higher sensitivity and specificity compared to previous methods. Keywords: Pseudomonas aeruginosa, PCR, Quorum sensing, LasI
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Keywords, Pseudomonas aeruginosa, PCR, Quorum sensing, LasI
نویسندگان مقاله حسین آقاملایی | h aghamollaei


کمال عزیزی بارجینی | k azizi barjini


مهرداد موسی زاده مقدم | m moosazadeh mogaddam


نشانی اینترنتی http://armaghanj.yums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-344&slc_lang=fa&sid=en
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده تخصصی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات