این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
Journal of Medical Signals and Sensors، جلد ۵، شماره ۳، صفحات ۱۷۶-۰
عنوان فارسی
چکیده فارسی مقاله
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Fully Automated cDNA Microarray Segmentation using a Novel Fuzzy-based Algorithm
چکیده انگلیسی مقاله DNA microarray is a powerful approach to study simultaneously, the expression of 1000 of genes in a single experiment. The average value of the fluorescent intensity could be calculated in a microarray experiment. The calculated intensity values are very close in amount to the levels of expression of a particular gene. However, determining the appropriate position of every spot in microarray images is a main challenge, which leads to the accurate classification of normal and abnormal (cancer) cells. In this paper, first a preprocessing approach is performed to eliminate the noise and artifacts available in microarray cells using the nonlinear anisotropic diffusion filtering method. Then, the coordinate center of each spot is positioned utilizing the mathematical morphology operations. Finally, the position of each spot is exactly determined through applying a novel hybrid model based on the principle component analysis and the spatial fuzzy c‑means clustering (SFCM) algorithm. Using a Gaussian kernel in SFCM algorithm will lead to improving the quality in complementary DNA microarray segmentation. The performance of the proposed algorithm has been evaluated on the real microarray images, which is available in Stanford Microarray Databases. Results illustrate that the accuracy of microarray cells segmentation in the proposed algorithm reaches to 100% and 98% for noiseless/noisy cells, respectively.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله شیدا بهرامی | sheyda bahrami


حمیدرضا صابرکاری | hamidreza saberkari


موسی شمسی | mousa shamsi


حبیب بدری قویفکر | habib badri ghavifekr


محمد حسین صداقی | mohammad hossein sedaaghi


نشانی اینترنتی http://www.jmss.mui.ac.ir/index.php/jmss/article/view/276
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده en
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده Original Articles
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات