این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
طب جنوب، جلد ۲۱، شماره ۵، صفحات ۳۸۳-۳۹۲
عنوان فارسی شناسایی جدایه‌های اشرشیا کلی جدا شده از آب سواحل بوشهر با روش PCR
چکیده فارسی مقاله زمینه: تشخیص با روش‌های استاندارد نتوانسته است تمام مشکلات تشخیصی اشرشیا کلی را حل نماید. اما با گسترش مطالعات ژنومیک، به نظر می‌رسد واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) توان کافی برای حل این مشکل را داشته باشد. هدف از این مطالعه تشخیص جدایه‌های محیطی اشرشیا کلی با کاربرد روش PCR و استفاده از پرایمرهای اختصاصی برای قطعات ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY بود. مواد و روش‌ها: شناسایی ملکولی اشرشیا کلی با آزمایش‌های PCR و پرایمرهای چهارگانه فوق بر روی DNA ژنومی تخلیص شده از 120 جدایه محیطی اشرشیا کلی به همراه سویه‌های استاندارد شیگلا و سویه‌های انتروهموراژیک اشرشیا کلی به عنوان کنترل انجام شد. کلیه جدایه‌های محیطی مورد استفاده در یک مطالعه قبلی از آب سواحل بوشهر جداسازی و با روش‌های استاندارد باکتری‌شناسی شناسایی شده و سپس جهت مطالعات بعدی در دمای منفی 70 نگهداری شده‌اند. یافته‌ها: پرایمرها قدرت شناسایی اهداف خود را در جدایه‌های محیطی و سویه‌های استاندارد داشتند. مشخص گردید به‌طور هم‌زمان چهار قطعه مربوط به ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY فقط در جدایه‌ها و سویه‌های اشرشیا کلی وجود دارند. این روش PCR قدرت جداسازی اشرشیا کلی را از شیگلا، به‌عنوان نزدیک‌ترین جنس فیلوژنیک، داشته و برخلاف روش‌های کلاسیک، ‌توانست سویه انتروهموراژیک را به عنوان اشرشیا کلی تشخیص دهد. نتیجه‌گیری: روش PCR طراحی ‌شده برای قطعات ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY دقت لازم برای شناسایی و جداسازی اشرشیا کلی از گونه‌های بسیار مشابه را داشته بنابراین به‌عنوان یک روش ملکولی قابل ‌اطمینان در تشخیص اشرشیا کلی معرفی می‌گردد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی PCR Identification of Escherichia coli Isolated from Bushehr Coastal Water
چکیده انگلیسی مقاله Background: Standard methods of identification have not been able to solve all issues concerning E. coli. With the development of genomic studies, PCR appears promising to deal with the shortcomings. This study aimed to utilize PCR with specific primers for lacZ, uidA, cyd, and lacY gene segments to identify environmental E. coli isolates. Materials and methods: PCR and the aforementioned four primers were used for molecular identification of E. coli on purified genome DNA from 120 environmental E. coli isolates, standard strains of Shigella, and Enterohaemorrhagic E. coli strain as controls. All environmental E. coli isolates were isolated from Bushehr coastal areas and identified in a previous study by standard bacteriological methods and then preserved in -70 ˚C for further studies. Results: The primers successfully showed their ability to identify the targets in environmental isolates and standard strains. It is shown that the four PCR fragments related to lacZ, uidA, cyd, and lacY genes were observed only for E. coli isolates and strains. Conclusion: PCR method proved capable to distinguish E. coli from Shigella as the most phylogenetically related genus and contrary to the classical methods, it could detect enterohaemorrhagic strains as Escherichia coli.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله زهرا رحیمی | Zahra Rahimi
Department of Microbiology and Parasitology, School of Medicine, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, Iran
گروه میکروب‌شناسی و انگل‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران

عباس بهادر | Abbas Bahador
Department of Microbiology, School of Medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
گروه میکروب‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران

مسعود عظیم‌زاده | Masoud Azimzadeh
Department of Microbiology and Parasitology, School of Medicine, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, Iran
گروه میکروب‌شناسی و انگل‌شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران

محمدعلی حقیقی | Mohammadali Haghighi
The Persian Gulf Marine Biotechnology Research Center, The Persian Gulf Biomedical Sciences Research Institute, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, Iran
مرکز تحقیقات زیست فناوری دریایی خلیج‌فارس، پژوهشکده علوم زیست پزشکی خلیج‌فارس، دانشگاه علوم پزشکی بوشهر، بوشهر، ایران

نشانی اینترنتی http://ismj.bpums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-69&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/35/article-35-999170.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده میکروب‌شناسی و ایمنولوژی
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات