قطب های علمی گروه علوم پزشکی  همواره در پی دستیابی به آخرین یافته‌های علمی و افزایش مشارکت در گسترش مرزهای دانش و اعتلای موقعیت علمی کشور در سطح منطقه و بین الملل، تربیت نیروی انسانی نخبه و پژوهشگر،ظرفیت سازی و مشارکت در توسعه همکاری های علمی مؤثر بین المللی بوده اند. در کشور جمهوری اسلامی ایران نیز از سال 1379 طبق مفاد برنامه سوم توسعه، 18 نهاد علمی دانشگاهی تحت عنوان قطب علمی و با تنوع حیطه عملکردی در زمینه های آموزش،پژوهش و ارائه ی خدمت سلامت به ساختار آموزش عالی  کشور در گروه علوم پزشکی پیوستند و در حال حاضر 50 قطب علمی در گروه علوم پزشکی و با نظارت معاونت آموزشی وزارت بهداشت،درمان و آموزش پزشکی مشغول فعالیت می باشند. بدون تردید، ارزیابی عملکرد این مراکز،از تکالیف مدیریت ارشد وزارت بهداشت،درمان و آموزش پزشکی بوده و نتایج آن به درک بهتر و شناخت هر چه بیشتر فعالیت این مراکز می انجامد. فرایند ارزشیابی، سبب می شود ذی نفعان به میزان ارتقاء واستقرار کیفیت در فعالیت های علمی تحقق یافته، به سطح آگاهی خود افزوده و از بازخوردهای آن برای برنامه ریزی پویا و توسعه فعالیت های دانشی بهره مند گردند.به عبارتی دیگر، ارزشیابی، فرایندی است که از جمع آوری، تجزیه و تحلیل و تفسیر نظام مند داده ها برخوردار می باشد و در جهت تصمیم گیری خاص به کار برده می شود. در راستای چنین تکلیفی، دبیرخانه شورای عالی قطب های علمی مستقر در مرکز مطالعات و توسعه آموزش علوم پزشکی وزارت متبوع در سال 1393 سومین دوره  ارزشیابی قطب ها را طبق مفاد اساسنامه قطب های علمی گروه علوم پزشکی (10) در دستور کار خود قرار داد و در بازه ی زمانی 7 ماهه       ( 1/ 8/1393 الی 1/3/1394 ) به اتمام رساند. این مقاله به منظور ارائه ی چگونگی طراحی ابزار و نیز محتوای ارزشیابی قطب ها بر مبنای شاخص های 3 محور: «دروندادی»، «فرآیندی» و «بروندادی» در عرصه های آموزش، پژوهش، فناوری و نوآوری، و نیز ارائه ی خدمت سلامت تدوین شده است.