این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
پژوهش های تولیدات دامی، جلد ۱۲، شماره ۳۱، صفحات ۱۳۴-۱۴۵
عنوان فارسی آنالیز تفاوت ژنتیکی ژن های مرتبط با پاسخ ایمنی بین گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد با استفاده از داده های RNA-Seq
چکیده فارسی مقاله جهش در طول توالی ژن­ها سبب بروز تغییرات نوکلئوتیدی و درنتیجه ایجاد عملکرد جدید در ژن­ها می­شود. هدف از مطالعه حاضر، ارزیابی تنوع ژنتیکی و تحلیل بیان متفاوت ژن‌های مرتبط با سیستم ایمنی در بین دو جمعیت گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت­ بیلیارد بود. در این مطالعه از نتایج مربوط به آنالیز بیان افتراقی در بین جمعیت گاو­های نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت­ بیلیارد با استفاده از داده­ های RNA-Seq جهت تجزیه ژنتیکی و ترسیم درخت فیلوژنتیکی استفاده ‌شد. توالی­های نوکلئوتیدی با روش ClustalW توسط نرم ­افزار MegaAlign هم­ردیفـ سازی­ شدند و درخت فیلوژنتیکی و ماتریس تفاوت و تشابه توالی­ها ترسیم  شد. بر اساس نتایج این تحقیق، میانگین اختلاف نوکلئوتیدها و تعداد کل جهش­ها برای ژن‌های مورد مطالعه در بین جمعیت‌های گاو نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت­بیلیارد به­ترتیب در محدوده­ی (2598/66-186) و (3898-74) قرار داشت. هم­چنین، نواحی حفاظت‌ شده بخش اندکی از توالی ژن­های مورد مطالعه را تشکیل دادند که این امر نشان دهنده چند شکلی بالای این ژن­ها و هم­چنین مستعد بودن به تغییرات نوکلئوتیدی و جهش می­باشد. نتایج حاصل از درخت فیلوژنی توالی نوکلئوتیدی ژن­های مورد مطالعه نشان داد که تنوع ژنتیکی و واگرایی برای ژن­های مورد مطالعه در بین جمعیت­های گاو نژاد خالص، آمیخته سیستانی و مونت­ بیلیارد و ایندیکوس وجود دارد. میزان عددی نسبت جایگزینی dN/dS برای ژن­های مورد مطالعه نشان ­دهنده انتخاب مثبت این ژن­ها بود.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله تکامل، تنوع ژنتیکی، جهش، فیلوژنتیک، گاو سیستانی
عنوان انگلیسی Analysis of Genetic Differences in Genes Associated with Immune Response Among Purebred and Crossbreed Sistani and Montebeliarde Cow Populations using RNA-Seq Data
چکیده انگلیسی مقاله Mutations during gene sequencing lead to nucleotide changes, resulting in new function in gene. The aim of the present study was to evaluate the genetic diversity and analysis the reasons for the differential expression of immune-related genes between the two populations of purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde cows. In this study, the results of the analysis of differential expression among the population of purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde cows using RNA-Seq data were used for genetic analysis and phylogenetic tree mapping. Clustal W nucleotide sequences were aligned using the MegaAlign software, and the phylogenetic tree and matrix of differences and similarities of the sequences were plotted. Based on the results of this study, the mean difference between nucleotides (nucleotide divergence) and the total number of mutations for the studied genes among purebred and crossbreed Sistani and Montebeliarde populations were in the range (2598-1869) and (3898-74) . Also, conserved regions make up a small part of the sequence of genes studied, indicating a high polymorphism of these genes and their susceptibility to nucleotide changes and mutations. The results of the phylogenetic tree for the nucleotide sequence of the studied genes showed that there is genetic diversity and divergence in the studied genes among purebred and crossbreed Sistani and Montebilliard and Indicus populations. The numerical value of the dN/dS ratio for the studied genes indicated the positive selection for these genes.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Evolution, Genetic diversity, Mutations, Phylogenetic, Sistani cows
نویسندگان مقاله بتول اصغری اسفدن | Batol AsghariEsfeden
University of Zabol
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

غلامرضا داشاب | Gholam Reza Dashab
University of Zabol
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

محمد حسین بنابازی | Mohammad Hossein Banabazi
Department of Biotechnology, Animal Science Research Institute of IRAN (ASIR)
بخش پژوهش های بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی،کرج،

محمد رکوعی | Mohammad Rokouei
University of Zabol
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

نشانی اینترنتی http://rap.sanru.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-458-7&slc_lang=fa&sid=1
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده ژنتیک و اصلاح نژاد دام
نوع مقاله منتشر شده پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات