این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله زنان، مامایی و نازایی ایران، جلد ۲۶، شماره ۸، صفحات ۵۵-۶۸
عنوان فارسی بررسی پروفایل بیانی miRNAهای اگزوزومی در سلول‌های سرطانی سرویکس (HeLa) در مقایسه با سلول‌های سالم و بررسی ژن‌های کلیدی وابسته به آنها
چکیده فارسی مقاله مقدمه: سرطان سرویکس، چهارمین سرطان شایع در میان زنان در سرتاسر جهان و یک بیماری هتروژن می ­باشد. miRNAهای اگزوزومی می ­توانند به‌عنوان بیومارکرهای تشخیصی و یا اهداف درمانی در سرطان سرویکس در نظر گرفته شوند. مطالعه حاضر با هدف استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی برای شناسایی miRNA ها، ژن­ها و مسیرهای مربوط به آنها در اگزوزوم­ های مشتق شده از سلول سرطانی سرویکس انجام شد. روش‌کار: در این مطالعه، بیان miRNAها و mRNAهای اگزوزومی در سلول­ های هلا و سالم با آنالیز داده‌های به‌دست آمده از پایگاه GEO برای miR-seq و RNA-seq در نرم‌افزار  R(نسخه 4.2.1) بررسی شد. پس از آن ژن‌های مشترک میان هدف ­های miRNA و mRNA با بیان کاهشی یا افزایشی، از اگززوم ­ها انتخاب شدند و سپس آنالیزهای GO و مسیرهای KEGG انجام شد. در پایان، ژن­ های مشترک برای ایجاد شبکه میانکنش پروتئین-پروتئین و انتخاب ژن­ های کلیدی مورد استفاده قرار گرفتند. یافته ­ها: در مطالعه حاضر، 31 miRNA با افزایش بیان و 16 miRNA با کاهش بیان در اگزوزوم ­ها مشاهده شد. همچنین 341 ژن مشترک از هدف­ های miRNA و RNA-seq برای آنالیزهای بعدی انتخاب شدند. آنالیز GO نشان داد که ژن­ های مشترک به‌طور معناداری در انتقال لوسین، فعالیت فسفاتازی MAP کیناز و انتقال گلوتامین نقش دارند. آنالیز KEGG نیز پیش­ بینی کرد که ژن­ها در پیری سلولی، مسیر پیام رسانی p53 و سیکل سلولی به‌صورت معناداری نقش دارند. 10 ژن کلیدی شامل CCNB1، BUB1، KIF20A،MKI67، FOXM1، BIRC5، NCAPH، ZWINT، GINS2 و ASF1B از شبکه میانکنش پروتئین-پروتئین شناسایی شدند. نتیجه ­گیری: نتایج شامل شناسایی miRNAهای با تغییر بیان و مشخص کردن ژن­ های کلیدی در اگزوزوم­ های مشتق شده از سلول­ های سرطانی سرویکس بود. این مطالعه می ­تواند دیدگاه جدیدی را برای تعیین مکانیسم های بالقوه همراه با اگزوزوم­ های مشتق شده از سلول­ های سرطانی در پیشرفت سرطان سرویکس ارائه کند.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله اگزوزوم، بیومارکر، سرطان سرویکس، مسیرهای پیام‌رسانی، miRNA، mRNA
عنوان انگلیسی The expression profile of exosomal miRNAs in cervical cancer cells (HeLa) compared to normal cells and evaluating the key genes related to them
چکیده انگلیسی مقاله Introduction: Cervical cancer is the fourth most common cancer among women worldwide and is a heterogeneous disease. The exosomal miRNAs could be applied as diagnostic biomarkers and therapeutic targets in cervical cancer. The present study was performed with aim to use a bioinformatics analysis to identify key miRNAs and related genes and pathways in exosomes derived from cervical cancer cells. Methods: In this study, the differential expression of exosomal miRNA and RNAs in healthy and HeLa cells was investigated by analyzing the GEO database for miR-seq and RNA-seq in R software. Subsequently, overlapped miRNA target genes and differentially mRNA from exosome were selected and then, GO and KEGG pathway analysis was performed. The overlapped genes were integrated to construct a PPI network and hub genes selection. Results: In the present study, it was observed that 31 miRNAs were upregulated and 16 miRNAs were downregulated in exosomes. Also, 341 overlapped genes from miRNAs targets and mRNA-seq were selected for future analysis. GO analysis indicated that overlapped genes were significantly enriched in the leucine transport, MAP kinase phosphatase activity, and glutamine transport. KEGG analysis suggested that the genes were enriched in cellular senescence, p53 signaling pathway and cell cycle. The top ten genes including CCNB1, BUB1, KIF20A, MKI67, FOXM1, BIRC5, NCAPH, ZWINT, GINS2, and ASF1B were identified from the PPI network. Conclusion: The results identified key miRNAs with altered expression and characterizing key genes in exosomes derived cervical cancer cells. This study will provide novel insights to determine the potential mechanisms associated exosomes derived from cancer cells in cervical cancer progression.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله Biomarker, Cervical Cancer, Exosome, miRNA, mRNA, Signaling pathway
نویسندگان مقاله مرضیه نادری بلداجی | Marzieh Naderi Boldaji
M.Sc. of Cellular and Molecular Biology, Department of Genetics, School of Basic Sciences, Shahrekord University, Shahrekord, Iran.
کارشناس ارشد سلولی و مولکولی، گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.

دکتر کامبیز احمدی | Kambiz Ahmadi
Assistant Professor, Department of Computer Science, School of Mathematical Sciences, Shahrekord University, Shahrekord, Iran.
استادیار گروه علوم کامپیوتر، دانشکده علوم ریاضی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.

دکتر سمیه رئیسی | Somayeh Reiisi
Associate Professor, Department of Genetics, School of Basic Sciences, Shahrekord University, Shahrekord, Iran.
دانشیار گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.

نشانی اینترنتی https://ijogi.mums.ac.ir/article_23399.html
فایل مقاله فایلی برای مقاله ذخیره نشده است
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده en
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده اصیل پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات