این سایت در حال حاضر پشتیبانی نمی شود و امکان دارد داده های نشریات بروز نباشند
مجله دانشکده پزشکی اصفهان، جلد ۲۹، شماره ۱۲۶، صفحات ۰-۰
عنوان فارسی استفاده از روش Real-time PCR و پروب های اختصاصی آلل TaqManبه منظور شناسایی جهش های نقطه ای مقاومت به کلاریترومایسین در هلیکوباکتر پیلوری
چکیده فارسی مقاله مقدمه: هلیکوباکتر پیلوری یک ارگانیسم مشکل پسند و کند رشدی است که انجام تست های حساسیت آنتی بیوتیکی آن به 10 تا 14 روز زمان نیاز دارد. استفاده از روش های مولکولی می تواند جایگزین دقیق و مناسبی برای شناسایی هم زمان جهش های نقطه ای مقاومت آنتی بیوتیکی در این باکتری می باشد. هدف از این پژوهش ارزیابی مقاومت به کلاریترومایسین و جهش های نقطه ای مرتبط با آن با استفاده از روش Real-time PCR می باشد. روش ها: این مطالعه به صورت مقطعی-توصیفی بر روی 200 نمونه بیوپسی تهیه شده از بیماران مراجعه کننده به بیمارستان هاجر شهرکرد انجام شد. در ابتدا با استفاده از روش های اوره آز سریع(RUT) و واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) وجود هلیکوباکتر پیلوری تشخیص داده شد. در مرحله بعد با استفاده از روش Real-time PCR، مقاومت به کلاریترومایسین و جهش های نقطه ای مرتبط با آن با استفاده از پروب های اختصاصی مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته ها: از مجموع نمونه های مورد بررسی، در 164 (82%) نمونه هلیکوباکتر پیلوری شناسایی گردید که 105 (2/64%) نمونه حساس و 59 (98/35%) نمونه آن مقاوم به آنتی بیوتیک کلاریترومایسین بودند. در بین سوش های مقاوم شناسایی شده موتاسیون های نقطه ای A2144G، A2143G، A2143C و A2142G به ترتیب فراوانی 44/2%، 85/15%، 15/9 و 19/12 را داشتند. اما در 5 (47/8%) نمونه مقاوم، هیچ کدام از این ژنوتیپ ها شناسایی نشد. در بین سویه های دارای مقاومت، 38 (17/23%) نمونه تنها دارای یک ژنوتیپ و 16 (76/9%) نمونه دارای مخلوطی از ژنوتیپ ها بودند. نتیجه گیری: نتایج این پژوهش نشان داد که تکنیک Real-time PCR به صورت مستقیم در نمونه های بیوپسی توانایی شناسایی هم زمان هلیکوباکتر پیلوری و انواع مقاومت به کلاریترومایسین در کمترین زمان را دارد.
کلیدواژه‌های فارسی مقاله
عنوان انگلیسی Real-Time PCR Assay Using Allele-Specific TaqMan probe for Detection of Clarithromycin Resistance and Its Point Mutations in Helicobacter Pylori
چکیده انگلیسی مقاله Background: Helicobacter pylori is a fastidious microorganism and therefore standard phenotypic susceptibility tests can take at least 10-14 days. Molecular based diagnostic assays offer an alternative approach to obtain susceptibilities to antibiotics and detection of point mutations with greater accuracy. The aim of this study was the assessment of Clarithromycin resistance and its point mutations by using real-time PCR assay. Methods: This cross-sectional descriptive study was performed on 200 gastric biopsy specimens obtained from patients undergoing upper gastrointestinal endoscopy at Hajar hospital in Shahrekord. Initially Helicobacter pylori were identified by rapid urease test (RUT) and polymerase chain reaction (PCR). Then clarithromycin resistance and its point mutations were evaluated by using specific probes and real-time PCR technique. Finding: Of total samples, 164 (82%) were Helicobacter pylori positive. Overall, a clarithromycin susceptible strains were detected in 105 (64.02%) patients and resistance strains were detected in 59 (35.98%) which were identified as 4 (2.44%) A 2144G, 26 (15.85%) A2143G, 15 (9.15%) A2143C, and 20 (12.19%) A2142G point mutations. Genotype of 5 (8.47%) strains was not detected. Purely resistant strains were detected in 38 (23.17%), while heteroresistant were found in the remaining 16 cases (9.76%). Conclusion: Results showed that real-time PCR assay has high accuracy to simultaneously identify Helicobacter pylori and clarithromycin resistance types directly in gastric biopsy specimens in short time.
کلیدواژه‌های انگلیسی مقاله
نویسندگان مقاله محمد کارگر | kargar m
دانشیار، گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد جهرم، جهرم، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی جهرم (Islamic azad university of jahrom)

صادق قربانی دالینی | sadegh ghorbani dalini
کارشناس ارشد، گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد جهرم و عضو باشگاه پژوهشگران جوان، جهرم، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی جهرم (Islamic azad university of jahrom)

عباس دوستی | abbas doosti
استادیار، مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی شهرکرد (Islamic azad university of shahrekord)

نگار صعود | negar souod
کارشناس ارشد، گروه میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد جهرم و عضو باشگاه پژوهشگران جوان، جهرم، ایران
سازمان اصلی تایید شده: دانشگاه آزاد اسلامی جهرم (Islamic azad university of jahrom)

نشانی اینترنتی http://jims.mui.ac.ir/index.php/jims/article/view/588
فایل مقاله اشکال در دسترسی به فایل - ./files/site1/rds_journals/103/article-103-318942.pdf
کد مقاله (doi)
زبان مقاله منتشر شده fa
موضوعات مقاله منتشر شده
نوع مقاله منتشر شده مقاله پژوهشی
برگشت به: صفحه اول پایگاه   |   نسخه مرتبط   |   نشریه مرتبط   |   فهرست نشریات